Merge branch 'develop' of https://source.jalview.org/git/jabaws into develop
[jabaws.git] / conf / settings / MSAprobsParameters.xml
index 6ace32c..cc4227e 100644 (file)
@@ -29,7 +29,6 @@
             passes of consistency transformation\r
         </description>\r
         <optionNames>-c</optionNames>\r
-        <optionNames>--consistency</optionNames>\r
         <furtherDetails>prog_docs/msaprobs.txt</furtherDetails>\r
         <defaultValue>2</defaultValue>\r
         <validValue>\r
@@ -45,7 +44,6 @@
                       number of passes of iterative-refinement\r
         </description>\r
         <optionNames>-ir</optionNames>\r
-        <optionNames>--iterative-refinement</optionNames>\r
         <furtherDetails>prog_docs/msaprobs.txt</furtherDetails>\r
         <defaultValue>10</defaultValue>\r
         <validValue>\r