Add reference on Jronn
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index 46a7134..2c72efc 100644 (file)
   <li><a href="http://www.tcoffee.org/Projects_home_page/t_coffee_home_page.html">Tcoffee</a> (version 8.99) </li>\r
   <li><a href="http://probcons.stanford.edu/">Probcons</a> (version 1.12)</li>\r
 </ul>\r
-<p>Protein Secondary structure</p>\r
+<p>Protein Secondary structure prediction</p>\r
 <ul>\r
   <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;"><a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-jpred">Jpred</a></span> (3.0.3) </li>\r
 </ul>\r
 <ul>\r
   <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;"><a href="http://dis.embl.de/">DisEMBL</a></span> (1.5) </li>\r
   <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;"><a href="http://iupred.enzim.hu">IUPred</a></span> (1.0) </li>\r
-  <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;"><a href="http://www.strubi.ox.ac.uk/RONN">Ronn</a></span> (3.1) </li>\r
+  <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;">Jronn - Java implementation of <a href="http://www.strubi.ox.ac.uk/RONN">Ronn</a></span> (3.1) </li>\r
   <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;"><a href="http://globplot.embl.de/">GlobPlot</a></span> (2.3) </li>\r
   </ul>\r
 <p>Amino Acid conservation</p>\r
   <li><span style="color:black; font-weight:normal; text-align:left;">RNAalifold from <a href="http://www.tbi.univie.ac.at/RNA">ViennaRNA</a></span> (2.0) </li>\r
 </ul>\r
 \r
-\r
+All these codes including Jronn and AAcon are available at the <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/download">Download</a> section (registration is required).\r
 \r
 <h3><a name="jaba2.1"/></a>What is new in JABAWS 2.1? </h3>\r
 <strong>JABAWS Version 2.1 (Released 1st Oct 2013)</strong><p>JABAWS 2.1 includes several bug fixes and minor updates for <a href="#jaba2">JABAWS Version 2.0</a>. These are listed below:</p>\r