FEATURETODO

   1 JAL-958 Normalised logo feature todo
   2
   3 * add gui switches in applet for normalised logo display
   4 * add flags for normalised logo display to AnnotationFile and Jalview Project
   5 * add preference for application
   6 * consider rationalising flag model for N types of consensus/logo calculation methods
   7
   8 JAL-976 JABAWS 2 services todo
   9 * test store/recall of settings for AACons service
  10 * debug IUPred for case when parameters are tweaked and get a 'sequences must be aligned' error from JABAWS server
  11 * decide where AACons job stats should be stored (this is a report for the current view, rather than alignment as a whole)
  12 * make disorder calculation more intelligent
  13 -* only calculate for sequences where no calculation has already been performed ?
  14 -* if parameters are changed, old features should be replaced with new ones
  15 ..? calcId for features, too ?