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   1 <html>
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  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Nucleotide Colour Scheme</title>
  24 <style type="text/css">
  25 <!--
  26 td {
  27         text-align: center;
  28 }
  29 -->
  30 </style>
  31 </head>
  32
  33 <body>
  34   <p>
  35     <strong>Nucleotide Ambiguity Colours</strong>
  36   </p>
  37   <div align="center">
  38     <table width="200" border="1">
  39       <tr>
  40         <td bgcolor="#f0fff0">A</td>
  41         <td>Adenine</td>
  42       </tr>
  43       <tr>
  44         <td bgcolor="#f0fff0">C</td>
  45         <td>Cytosine</td>
  46       </tr>
  47       <tr>
  48         <td bgcolor="#f0fff0">G</td>
  49         <td>Guanine</td>
  50       </tr>
  51       <tr>
  52         <td bgcolor="#f0fff0">T</td>
  53         <td>Thymine</td>
  54       </tr>
  55       <tr>
  56         <td bgcolor="#f0fff0">U</td>
  57         <td>Uracil</td>
  58       </tr>
  59       <tr>
  60         <td bgcolor="#ffffff">I</td>
  61         <td>Inosine</td>
  62       </tr>
  63       <tr>
  64         <td bgcolor="#4f6f6f">X</td>
  65         <td>Xanthine (sometimes Unknown)</td>
  66       </tr>
  67       <tr>
  68         <td bgcolor="#CD5C5C">R</td>
  69         <td>Unknown Purine</td>
  70       </tr>
  71       <tr>
  72         <td bgcolor="#008000">Y</td>
  73         <td>Unknown Pyrimidine</td>
  74       </tr>
  75       <tr>
  76         <td bgcolor="#4682B4">W</td>
  77         <td>Weak nucleotide (A or T)</td>
  78       </tr>
  79       <tr>
  80         <td bgcolor="#FF8C00">S</td>
  81         <td>Strong nucleotide (G or C)</td>
  82       </tr>
  83       <tr>
  84         <td bgcolor="#9ACD32">M</td>
  85         <td>Amino (A or C)</td>
  86       </tr>
  87       <tr>
  88         <td bgcolor="#9932CC">K</td>
  89         <td>Keto (G or T)</td>
  90       </tr>
  91       <tr>
  92         <td bgcolor="#8b4513">B</td>
  93         <td>Not A (G or C or T)</td>
  94       </tr>
  95       <tr>
  96         <td bgcolor="#808080">H</td>
  97         <td>Not G (A or C or T)</td>
  98       </tr>
  99       <tr>
 100         <td bgcolor="#483D8B">D</td>
 101         <td>Not C (A or G or T)</td>
 102       </tr>
 103       <tr>
 104         <td bgcolor="#b8860b">V</td>
 105         <td>Not T (A or G or C)</td>
 106       </tr>
 107       <tr>
 108         <td bgcolor="#2f4f4f">N</td>
 109         <td>Unknown</td>
 110       </tr>
 111     </table>
 112   </div>
 113 </body>
 114 </html>