help/html/features/search.html

   1 <html>\r
   2 <head>\r
   3 <style type="text/css">\r
   4 <!--\r
   5 td {\r
   6         text-align: center;\r
   7 }\r
   8 -->\r
   9 </style>\r
  10 </head>\r
  11 \r
  12 <body>\r
  13 <p><strong>Search</strong></p>\r
  14 <p>The search box can be displayed by pressing the keys Control and F or selecting\r
  15   &quot;Search&quot;</p>\r
  16 Note:\r
  17 <ul>\r
  18   <li>The search will be performed on the selected region. If no region is selected,\r
  19     the search will operate on the full alignment.</li>\r
  20   <li>To clear any selection, press the &quot;Escape&quot; key.</li>\r
  21 </ul>\r
  22 <p>Using the &quot;Create new group&quot; is a quick way to group and highlight\r
  23   residues with the specified search pattern throughout the alignment.</p>\r
  24 <p>The search allows regular expression matching. </p>\r
  25 <p>&nbsp;</p>\r
  26 <table width="100%" border="1">\r
  27   <tr>\r
  28     <td width="24%">.</td>\r
  29     <td width="76%">Any single character.</td>\r
  30   </tr>\r
  31   <tr>\r
  32     <td>[]</td>\r
  33     <td>Any one of the characters in the brackets</td>\r
  34   </tr>\r
  35   <tr>\r
  36     <td>^</td>\r
  37     <td>The start of a line (column 1). </td>\r
  38   </tr>\r
  39   <tr>\r
  40     <td>$</td>\r
  41     <td>The end of a line </td>\r
  42   </tr>\r
  43   <tr>\r
  44     <td>*</td>\r
  45     <td> Matches zero or more of the preceding characters or expressions. </td>\r
  46   </tr>\r
  47   <tr>\r
  48     <td>?</td>\r
  49     <td>Matches zero or one of the preceding characters or expressions. </td>\r
  50   </tr>\r
  51   <tr>\r
  52     <td>+</td>\r
  53     <td>Matches one or more of the preceding characters or expressions. </td>\r
  54   </tr>\r
  55   <tr>\r
  56     <td>{count}</td>\r
  57     <td> Matches the specified number of the preceding characters or expressions.\r
  58     </td>\r
  59   </tr>\r
  60   <tr>\r
  61     <td>{min,}</td>\r
  62     <td> Matches at least the specified number of the preceding characters or\r
  63       expressions.</td>\r
  64   </tr>\r
  65   <tr>\r
  66     <td>{min,max} </td>\r
  67     <td>Matches between min and max of the preceding characters or expressions.</td>\r
  68   </tr>\r
  69 </table>\r
  70 </body>\r
  71 </html>\r