help/html/whatsNew.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>What's new ?</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26   <p>
  27     <strong>What's new in Jalview 2.10.3b1 ?</strong>
  28   </p>
  29   <p>
  30     This is the January 2018 patch release, which addresses critical bugs including trackpad function in OSX, and display of multiple 3D structures.
  31     The full list bugs fixed in this release can be found in the <a href="releases.html#Jalview.2.10.3b1">2.10.3b1
  32       Release Notes</a>. In addition, Jalview 2.10.3 provides:
  33   </p>
  34   <ul>
  35     <li>Faster and more responsive UI when importing and working
  36       with wide alignments and handling hundreds and thousands of
  37       sequence features</li>
  38     <li>Improved usability with <a
  39       href="features/pdbsequencefetcher.html">PDB</a> and <a
  40       href="features/uniprotsequencefetcher.html">UniProt</a> Free Text
  41       Search dialog, and new tab for retrieval of sequences for lists of
  42       IDs.
  43     </li>
  44     <li>Short names assigned to sequences retrieved from UniProt</li>
  45     <li>Groovy console upgraded to 2.4.12 (improved support for Java 9)</li>
  46   </ul>
  47   <p>
  48     <strong><a name="experimental">Experimental Features</a></strong>
  49   </p>
  50   <p>
  51     Remember, please enable the <em>Experimental Features</em> option in
  52     the Jalview Desktop's <em>Tools</em> menu, and then restart Jalview
  53     if you want to try out features below:
  54   </p>
  55   <ul>
  56     <li><em>Annotation transfer between Chimera and Jalview</em><br />Two
  57       <a href="features/chimera.html#experimental">new entries in
  58         the Chimera viewer's Chimera menu</a> allow positional annotation to
  59       be exchanged between Chimera and Jalview.</li>
  60   </ul>
  61
  62 </body>
  63 </html>