help/html/whatsNew.html

   1 <html>
   2 <head>
   3 <title>What's new ?</title>
   4 </head>
   5 <body>
   6 <p><strong>What's new ?</strong></p>
   7 <p><strong>Jalview Version 2.4</strong></p>
   8 <ul>
   9   VAMSAS Interoperation Client<br>
  10   DAS Sequence Fetching<br>
  11   PFAM full alignment retrieval<br>
  12   DNA/Protein Product traversal (Experimental)</br>
  13   .. (more to come)<br>
  14   URL links can be generated using regular
  15   expressions and created for sequence database cross references<br>
  16 </ul>
  17 <p><strong>Issues Resolved</strong></p>
  18 <ul>
  19   .. (more to come)
  20 </ul>
  21
  22 <--<p><strong>Jalview Version 2.3</strong></p>
  23 <ul>
  24   Jmol 11.0.2 integration<br>
  25   PDB views stored in Jalview XML files<br>
  26   Slide sequences<br>
  27   Edit sequence in place<br>
  28   EMBL CDS features<br>
  29   DAS Feature mapping<br>
  30   Feature ordering<br>
  31   Alignment Properties<br>
  32   Annotation Scores<br>
  33   Sort by scores<br>
  34   Feature/annotation editing in applet<br>
  35 </ul>
  36 <p><strong>Issues Resolved</strong></p>
  37 <ul>
  38   Headless state operation in 2.2.1 <br>
  39   Incorrect and unstable DNA pairwise alignment <br>
  40   Cut and paste of sequences with annotation <br>
  41   Feature group display state in XML<br>
  42   Feature ordering in XML<br>
  43   2.2.1 applet had no feature transparency<br>
  44   Number pad keys can be used in cursor mode<br>
  45   Structure Viewer mirror image resolved</p>
  46   </ul>-->
  47 <p>&nbsp;</p>
  48 <p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for
  49 details of all new features and resolved issues.</p>
  50 </body>
  51 </html>