help/html/whatsNew.html

   1 <html>
   2 <head><title>What's new ?</title></head>
   3 <body>
   4 <p><strong>What's new ?</strong> </p>
   5
   6 <p><strong>Jalview Version 2.2</strong></p>
   7 <p>Multiple views with different styles, colours, hidden regions for one alignment
   8 </p>
   9 <p>Easily add, amend and delete sequence features
  10 </p>
  11 <p>&quot;Reload&quot; alignment from File or URL to revert to original
  12 </p>
  13 <p>&quot;Save&quot; to current filename or &quot;Save As&quot; to new filename
  14 </p>
  15 <p>Set different text colour for dark or light background
  16 </p>
  17 <p>Right align sequence ids
  18 </p>
  19 <p>Set colour of lower case residues in a user defined colour scheme
  20 </p>
  21 <p>Menu Rearrangements: New <strong>Format</strong> for alignment layout and <strong>Select</strong> for region selection.
  22 </p>
  23 </p><p>Menu item accelerator keys added
  24 </p>
  25 <p>Control-V pastes sequences to active window, Control-Shift-V pastes to a new window.
  26 </p>
  27 <p>Raise/Minimise alignment and all associated windows from desktop window's <strong>window</strong> menu
  28 </p>
  29 <p>Select and colour whole branches of a tree</p>
  30 <p>'New Window' button on the 'Output to Text box' alignment output
  31 option to open a new alignment window after editing.</p>
  32 <p><strong>Issues Resolved</strong></p>
  33 </p>
  34 <p>
  35 Optimisations for large alignments: faster multithreaded calculations and Undo/Redo system.
  36 </p>
  37 <p>Remove empty columns - if empty columns exist at the end of the
  38 alignment bug fixed.
  39 </p>
  40 <p>DAS feature fetching slowed down, doesn't overload DAS servers
  41 </p>
  42 <p>DAS feature fetching can be cancelled
  43 </p>
  44 <p>Correct display of &gt; and &lt; symbols for feature descriptions without explicit &lt;html&gt; tags.
  45 </p>
  46 <p>Zoom working in PCA viewer
  47 </p>
  48 <p>Sequence Descriptions retained after running a web service
  49 </p>
  50 <p>&nbsp;</p>
  51 <p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for details of all
  52   new features and resolved issues. </p>
  53 </body>
  54 </html>