Merge branch 'features/pca_jaxb_datasetrefs_JAL-3171_JAL-3063_JAL-1767' into develop
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
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23 action.edit = Edit
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27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
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39 action.open = Open
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51 action.remove_right = Remove right
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55 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
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64 action.remove = Remove
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66 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
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68 action.by_conservation = By Conservation
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84 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
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86 action.by_annotation = By Annotation...
87 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
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91 action.ok = OK
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112 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
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119 action.close = Close
120 action.add = Add
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122 action.save_as = Save as...
123 action.save = Save
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125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
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131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
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135 action.link = Link
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141 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
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145 label.url\: = URL:
146 label.input_file_url = Enter URL or Input File
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148 label.name = Name
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150 label.name_param = Name: {0}
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161 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
162 label.service_action = Service Action:
163 label.post_url = POST URL:
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169 label.undo_command = Undo {0}
170 label.redo_command = Redo {0}
171 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
172 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
173 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
174 label.choose_calculation = Choose Calculation
175 label.calc_title = {0} Using {1}
176 label.tree_calc_av = Average Distance
177 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
178 label.score_model_pid = % Identity
179 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
180 label.score_model_pam250 = PAM 250
181 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
182 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
183 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
184 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
185 label.status_bar = Status bar
186 label.out_to_textbox = Output to Textbox
187 label.occupancy = Occupancy
188 # delete Clustal - use FileFormat name instead
189 label.clustal = Clustal
190 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
191 label.colourScheme_clustal = Clustalx
192 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
193 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
194 label.colourScheme_zappo = Zappo
195 label.colourScheme_taylor = Taylor
196 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
197 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
198 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
199 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
200 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
201 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
202 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
203 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
204 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
205 label.blc = BLC
206 label.fasta = Fasta
207 label.msf = MSF
208 label.pfam = PFAM
209 label.pileup = Pileup
210 label.pir = PIR
211 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
212 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
213 label.show_annotations = Show annotations
214 label.hide_annotations = Hide annotations
215 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
216 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
217 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
218 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
219 label.hide_all = Hide all
220 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
221 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
222 label.colour_text = Colour Text
223 label.show_non_conserved = Show nonconserved
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237 label.input_from_textbox = Input from textbox
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242 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
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257 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
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263 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
264 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
265 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
266 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
267 label.structure_viewer = Default structure viewer
268 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
269 label.chimera_path = Path to Chimera program
270 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
271 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
272 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
273 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
274 label.min_colour = Minimum Colour
275 label.max_colour = Maximum Colour
276 label.no_colour = No Colour
277 label.use_original_colours = Use Original Colours
278 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
279 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
280 label.selection = Selection
281 label.group_colour = Group Colour
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284 label.min_value = Min value
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289 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
290 label.labels = Labels
291 label.output_values = Output Values...
292 label.output_points = Output points...
293 label.output_transformed_points = Output transformed points
294 label.input_data = Input Data...
295 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
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297 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
298 label.show_distances = Show distances
299 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
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301 label.newick_format = Newick Format
302 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
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310 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
311 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
312 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
313 label.removed_columns = Removed {0} columns.
314 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
315 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
316 label.order_by_params = Order by {0}
317 label.html_content = <html>{0}</html>
318 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
319 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
320 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
321 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
322 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
323 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
324 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
325 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
326 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
327 label.paste_your = Paste your
328 label.finished_searching = Finished searching
329 label.search_results= Search results {0} : {1}
330 label.found_match_for = Found match for {0}
331 label.font = Font:
332 label.size = Size:
333 label.style = Style:
334 label.calculating = Calculating....
335 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
336 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
337 label.set_this_label_text = set this label text
338 label.sequences_from = Sequences from {0}
339 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
340 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
341 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
342 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
343 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
344 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
345 label.source_to_target = {0} ... {1}
346 label.per_sequence_only= Per-sequence only
347 label.to_file = to File
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350 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
351 label.status = Status
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353 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
354 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
355 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
356 label.session_update = Session Update
357 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
358 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
359 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
360 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
361 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
362 label.groovy_console = Groovy Console...
363 label.lineart = Lineart
364 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
365 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
366 label.invert_selection = Invert Selection
367 label.optimise_order = Optimise Order
368 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
369 label.load_colours = Load Colours
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372 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
373 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
374 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
375 label.database_param = Database: {0}
376 label.example = Example
377 label.example_param = Example: {0}
378 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
379 label.file_format_not_specified = File format not specified
380 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
381 label.error_saving_file = Error Saving File
382 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
383 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
384 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
385 label.invalid_selection = Invalid Selection
386 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
387 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
388 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
389 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
390 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
391 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
392 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
393 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
394 label.translation_failed = Translation Failed
395 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
396 label.implementation_error  = Implementation error:
397 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
398 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
399 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
400 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
401 label.view_name_original = Original
402 label.enter_view_name = Enter View Name
403 label.enter_label = Enter label
404 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
405 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
406 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
407 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
408 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
409 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
410 label.error_parsing_text = Error parsing text
411 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
412 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
413 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
414 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
415 label.input_alignment = Input Alignment
416 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
417 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
418 label.couldnt_locate = Could not locate {0}
419 label.url_not_found = URL not found
420 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
421 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
422 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
423 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
424 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
425 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
426 label.invalid_url = Invalid URL !
427 label.error_loading_file = Error loading file
428 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
429 label.file_open_error = File open error
430 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
431 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
432 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
433 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
434 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
435 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
436 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
437 label.alignment_props = Alignment Properties
438 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
439 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
440 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
441 label.annotations = Annotations
442 label.structure_options = Structure Options
443 label.features = Features
444 label.overview_params = Overview {0}
445 label.paste_newick_file = Paste Newick file
446 label.load_tree_from_file = From File - 
447 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
448 label.selection_output_command = Selection output - {0}
449 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
450 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
451 label.pca_details = PCA details
452 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
453 label.user_defined_colours = User defined colours
454 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
455 label.jaview_build_date = Build date: {0}
456 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
457 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
458 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
459 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
460 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
461 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
462 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
463 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
464 label.right_click = Right click
465 label.to_add_annotation = to add annotation
466 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
467 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
468 label.label = Label
469 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
470 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
471 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
472 label.calculating_pca= Calculating PCA
473 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
474 label.jalview_applet = Jalview applet
475 label.loading_data = Loading data
476 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
477 label.calculating_tree = Calculating tree
478 label.state_queueing = queuing
479 label.state_running = running
480 label.state_completed = finished
481 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
482 label.state_job_error = job error!
483 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
484 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
485 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
486 label.structure_type = Structure type
487 label.settings_for_type = Settings for {0}
488 label.view_full_application = View in Full Application
489 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
490 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
491 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
492 label.load_vcf_file = Load VCF File
493 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
494 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
495 label.export_features = Export Features...
496 label.export_annotations = Export Annotations...
497 label.to_upper_case = To Upper Case
498 label.to_lower_case = To Lower Case
499 label.toggle_case = Toggle Case
500 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
501 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
502 label.edit_sequence = Edit Sequence
503 label.edit_sequences = Edit Sequences
504 label.sequence_details = Sequence Details
505 label.jmol_help = Jmol Help
506 label.chimera_help = Chimera Help
507 label.close_viewer = Close Viewer
508 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
509 label.all = All
510 label.sort_by = Sort alignment by
511 label.sort_by_score = Sort by Score
512 label.sort_by_density = Sort by Density
513 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
514 label.sort_ann_by = Sort annotations by
515 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
516 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
517 label.reveal = Reveal
518 label.hide_columns = Hide Columns
519 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
520 label.load_tree_file = Load a tree file
521 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
522 label.standard_databases = Standard Databases
523 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
524 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
525 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
526 label.connect_to_session = Connect to session {0}
527 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
528 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
529 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
530 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
531 label.adjust_threshold = Adjust threshold
532 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
533 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
534 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
535 label.open_url_param = Open URL {0}
536 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
537 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
538 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
539 label.dark_colour = Dark Colour
540 label.light_colour = Light Colour
541 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
542 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
543 label.copy_format_from = Copy format from
544 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
545 label.select_all_views = Select all views
546 label.select_many_views = Select many views
547 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
548 label.open_local_file = Open local file
549 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
550 label.listen_for_selections = Listen for selections
551 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
552 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
553 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
554 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
555 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
556 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
557 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
558 label.no_services = <No Services>
559 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
560 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
561 label.connect_to = Connect to
562 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
563 label.from_url = from URL
564 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
565 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
566 label.from_textbox = from Textbox
567 label.window = Window
568 label.preferences = Preferences
569 label.tools = Tools
570 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
571 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
572 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
573 label.collect_garbage = Collect Garbage
574 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
575 label.show_java_console = Show Java Console
576 label.show_jalview_news = Show Jalview News
577 label.take_snapshot = Take snapshot
578 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
579 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
580 label.monospaced_font= Monospaced
581 label.quality = Quality
582 label.maximize_window = Maximize Window
583 label.conservation = Conservation
584 label.consensus = Consensus
585 label.histogram = Histogram
586 label.logo = Logo
587 label.non_positional_features = List Non-positional Features
588 label.database_references = List Database References
589 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
590 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
591 label.gap_symbol = Gap Symbol
592 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
593 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
594 label.address = Address
595 label.port = Port
596 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
597 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
598 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
599 label.check_for_latest_version = Check for latest version
600 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
601 label.use_proxy_server = Use a proxy server
602 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
603 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
604 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
605 label.smooth_font = Smooth Font
606 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
607 label.pad_gaps = Pad Gaps
608 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
609 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
610 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
611 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
612 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
613 label.right_align_ids = Right Align Ids
614 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
615 label.open_overview = Open Overview
616 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
617 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
618 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
619 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
620 label.visual = Visual
621 label.connections = Connections
622 label.output = Output
623 label.editing = Editing
624 label.das_settings = DAS Settings
625 label.web_services = Web Services
626 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
627 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
628 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
629 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
630 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
631 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
632 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
633 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
634 label.new_service_url = New Service URL
635 label.edit_service_url = Edit Service URL
636 label.delete_service_url = Delete Service URL
637 label.details = Details
638 label.options = Options
639 label.parameters = Parameters
640 label.available_das_sources = Available DAS Sources
641 label.full_details = Full Details
642 label.authority = Authority
643 label.type = Type
644 label.proxy_server = Proxy Server
645 label.file_output = File Output
646 label.select_input_type = Select input type
647 label.set_options_for_type = Set options for type
648 label.data_input_parameters = Data input parameters
649 label.data_returned_by_service = Data returned by service
650 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
651 label.parsing_errors = Parsing errors
652 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
653 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
654 label.input_parameter_name = Input Parameter name
655 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
656 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
657 label.brief_description_service = Brief description of service
658 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
659 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
660 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
661 label.gap_character = Gap character
662 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
663 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
664 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
665 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
666 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
667 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
668 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
669 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
670 label.input_output = Input/Output
671 label.cut_paste = Cut'n'Paste
672 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
673 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
674 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
675 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
676 label.from_file = From File
677 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
678 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
679 label.text_colour = Text Colour...
680 label.structure = Structure
681 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
682 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
683 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
684 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
685 label.sequence_name = Sequence Name
686 label.sequence_description = Sequence Description
687 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
688 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
689 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
690 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
691 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
692 label.web_browser_not_found = Web browser not found
693 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
694 label.html = HTML
695 label.wrap = Wrap
696 label.show_database_refs = Show Database Refs
697 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
698 label.save_png_image = Save As PNG Image
699 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
700 label.export_image = Export Image
701 label.vamsas_store = VAMSAS store
702 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
703 label.reverse = Reverse
704 label.reverse_complement = Reverse Complement
705 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
706 label.extract_scores = Extract Scores
707 label.get_cross_refs = Get Cross-References
708 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
709 label.add_sequences = Add Sequences
710 label.new_window = New Window
711 label.split_window = Split Window
712 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
713 label.use_registry = Use Registry
714 label.add_local_source = Add Local Source
715 label.set_as_default = Set as Default
716 label.show_labels = Show labels
717 action.background_colour = Background Colour...
718 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
719 label.link_name = Link Name
720 label.pdb_file = PDB file
721 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
722 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
723 label.superpose_structures = Superpose Structures
724 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
725 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
726 label.jmol = Jmol
727 label.chimera = Chimera
728 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
729 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
730 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
731 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
732 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
733 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
734 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
735 label.case_sensitive = Case Sensitive
736 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
737 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
738 label.index_by_host = Index by Host
739 label.index_by_type = Index by Type
740 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
741 label.display_warnings = Display Warnings
742 label.move_url_up = Move URL Up
743 label.move_url_down = Move URL Down
744 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
745 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
746 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
747 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
748 label.sequences_updated = Sequences updated
749 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
750 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
751 label.paste_new_window = Paste To New Window
752 label.settings_for_param = Settings for {0}
753 label.view_params = View {0}
754 label.aacon_calculations = AACon Calculations
755 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
756 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
757 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
758 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
759 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
760 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
761 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
762 label.all_views = All Views
763 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
764 label.realign_with_params = Realign with {0}
765 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
766 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
767 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
768 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
769 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
770 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
771 label.view_documentation = View documentation
772 label.select_return_type = Select return type
773 label.translation_of_params = Translation of {0}
774 label.features_for_params = Features for - {0}
775 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
776 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
777 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
778 label.varna_params = VARNA - {0}
779 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
780 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
781 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
782 label.points_for_params = Points for {0}
783 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
784 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
785 label.select_background_colour = Select Background Colour
786 label.invalid_font = Invalid Font
787 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
788 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
789 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
790 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
791 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
792 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
793 label.example_query_param = Example query: {0}
794 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
795 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
796 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
797 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
798 label.select_columns_containing = Select columns containing
799 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
800 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
801 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
802 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
803 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
804 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
805 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
806 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
807 label.use_sequence_id_4 = 
808 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
809 label.switch_server = Switch server
810 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
811 label.services_at = Services at {0}
812 label.rest_client_submit = {0} using {1}
813 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
814 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
815 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
816 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
817 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
818 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
819 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
820 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
821 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
822 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
823 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
824 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
825 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
826 label.user_preset = User Preset
827 label.service_preset = Service Preset
828 label.run_with_preset = Run {0} with preset
829 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
830 action.by_title_param = By {0}
831 label.source_from_db_source = Sources from {0}
832 label.from_msname = from {0}
833 label.superpose_with = Superpose with
834 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
835 label.add_new_row = Add New Row
836 label.edit_label_description = Edit Label/Description
837 label.hide_row = Hide This Row
838 label.delete_row = Delete This Row
839 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
840 label.export_annotation = Export Annotation
841 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
842 label.helix = Helix
843 label.sheet = Sheet
844 label.rna_helix = RNA Helix
845 label.remove_annotation = Remove Annotation
846 label.colour_by = Colour by...
847 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
848 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
849 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
850 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
851 label.multiharmony = Multi-Harmony
852 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
853 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
854 label.prompt_each_time = Prompt each time
855 label.use_source = Use Source
856 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
857 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
858 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
859 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
860 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
861 label.invalid_name = Invalid name
862 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
863 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
864 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
865 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
866 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
867 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
868 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
869 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
870 label.feature_type = Feature Type
871 label.show = Show
872 label.service_url = Service URL
873 label.copied_sequences = Copied sequences
874 label.cut_sequences = Cut Sequences
875 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
876 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
877 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
878 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
879 label.save_features_to_file = Save Features to File
880 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
881 label.save_pdb_file = Save PDB File
882 label.save_text_to_file = Save Text to File
883 label.save_state = Save State
884 label.restore_state = Restore State
885 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
886 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
887 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
888 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
889 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
890 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
891 label.select_startup_file = Select startup file
892 label.select_default_browser = Select default web browser
893 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
894 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
895 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
896 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
897 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
898 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
899 label.save_as_html = Save as HTML
900 label.recently_opened = Recently Opened
901 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
902 label.tree = Tree
903 label.tree_from = Tree from {0}
904 label.webservice_job_title = {0} using {1}
905 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
906 label.visible = Visible
907 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
908 label.visible_region_of = visible region of
909 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
910 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
911 label.loading_file = Loading File: {0}
912 label.edit_params = Edit {0}
913 label.as_percentage = As Percentage
914 error.not_implemented = Not implemented
915 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
916 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
917 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
918 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
919 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
920 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
921 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
922 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
923 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
924 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
925 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
926 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
927 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
928 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
929 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
930 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
931 error.implementation_error = Implementation error
932 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
933 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
934 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
935 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
936 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
937 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
938 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
939 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
940 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
941 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
942 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
943 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
944 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
945 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
946 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
947 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
948 label.cancelled_params = Cancelled {0}
949 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
950 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
951 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
952 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
953 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
954 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
955 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
956 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
957 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
958 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
959 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
960 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
961 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
962 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
963 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
964 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
965 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
966 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
967 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
968 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
969 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
970 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
971 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
972 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
973 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
974 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
975 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
976 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
977 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
978 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
979 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
980 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
981 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
982 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
983 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
984 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
985 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
986 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
987 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
988 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
989 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
990 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
991 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
992 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
993 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
994 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
995 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
996 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
997 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
998 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
999 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
1000 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
1001 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
1002 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1003 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1004 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1005 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1006 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1007 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1008 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1009 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1010 label.toggled = Toggled
1011 label.marked = Marked
1012 label.containing = containing
1013 label.not_containing = not containing
1014 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1015 label.submission_params = Submission {0}
1016 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1017 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1018 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1019 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1020 label.pca_calculating = Calculating PCA
1021 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1022 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1023 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1024 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1025 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1026 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1027 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1028 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1029 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1030 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1031 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1032 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1033 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1034 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1035 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1036 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1037 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1038 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1039 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1040 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1041 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1042 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1043 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1044 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1045 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1046 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1047 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1048 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1049 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1050 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1051 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1052 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1053 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1054 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1055 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1056 label.mapped = mapped
1057 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1058 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1059 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1060 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1061 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1062 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1063 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1064 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1065 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1066 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1067 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1068 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1069 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1070 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1071 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1072 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1073 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1074 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1075 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1076 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1077 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1078 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1079 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1080 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1081 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1082 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1083 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1084 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1085 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1086 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1087 label.remove_gaps = Remove Gaps
1088 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1089 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1090 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1091 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1092 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1093 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1094 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1095 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1096 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1097 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1098 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1099 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1100 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1101 warn.service_not_supported = Service not supported!
1102 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1103 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1104 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1105 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1106 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1107 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1108 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1109 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1110 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1111 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1112 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1113 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1114 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1115 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1116 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1117 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1118 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1119 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1120 label.eps_file = EPS file
1121 label.png_image = PNG image
1122 status.saving_file = Saving {0}
1123 status.export_complete = {0} Export completed.
1124 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1125 status.refreshing_news = Refreshing news
1126 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1127 status.opening_params = Opening {0}
1128 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1129 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1130 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1131 status.finshed_querying = Finished querying
1132 status.parsing_results = Parsing results.
1133 status.processing = Processing...
1134 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1135 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1136 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1137 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1138 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1139 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1140 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1141 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1142 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1143 status.opening_file_for = opening file for
1144 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1145 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1146 label.font_too_small = Font size is too small
1147 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1148 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1149 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1150 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1151 label.out_of_memory = Out of memory
1152 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1153 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1154 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1155 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1156 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1157 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1158 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1159 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1160 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1161 label.test_server = Test Server?
1162 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1163 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1164 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1165 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1166 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1167 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1168 label.file_already_exists = File exists
1169 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1170 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1171 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1172 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1173 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1174 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1175 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1176 label.delete_all = Delete all sequences
1177 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1178 label.add_annotations_for = Add annotations for
1179 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1180 label.choose_annotations = Choose Annotations
1181 label.find = Find
1182 label.invalid_search = Search string invalid
1183 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1184 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1185 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1186 label.show_group_logo = Show Group Logo
1187 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1188 label.show_histogram = Show Histogram
1189 label.show_logo = Show Logo
1190 label.normalise_logo = Normalise Logo
1191 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1192 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1193 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1194 label.open_split_window = Open split window
1195 action.no = No
1196 action.yes = Yes
1197 label.for = for
1198 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1199 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1200 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1201 label.alpha_helix = Alpha Helix
1202 label.beta_strand = Beta Strand
1203 label.turn = Turn
1204 label.select_all = Select All
1205 label.structures_filter = Structures Filter
1206 label.search_filter = Search Filter
1207 label.include_description= Include Description
1208 action.back = Back
1209 label.hide_insertions = Hide Insertions
1210 label.mark_as_representative = Mark as representative
1211 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1212 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1213 label.result = result
1214 label.results = results
1215 label.structure_chooser = Structure Chooser
1216 label.invert = Invert 
1217 label.select_pdb_file = Select PDB File
1218 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1219 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1220 label.search_result = Search Result
1221 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1222 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1223 label.start_jalview = Start Jalview
1224 label.biojs_html_export = BioJS
1225 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1226 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1227 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1228 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1229 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1230 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1231 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1232 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1233 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1234 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1235 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1236 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1237 action.export_groups = Export Groups
1238 action.export_annotations = Export Annotations
1239 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1240 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1241 action.export_features = Export Features
1242 label.export_settings = Export Settings
1243 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1244 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1245 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1246 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1247 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1248 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1249 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1250 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1251 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1252 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1253 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1254 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1255 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1256 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1257 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1258 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1259 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1260 label.run_groovy = Run Groovy console script
1261 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1262 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1263 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1264 action.next_page= >> 
1265 action.prev_page= << 
1266 label.next_page_tooltip=Next Page
1267 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1268 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1269 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1270 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1271 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1272 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1273 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1274 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1275 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1276 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1277 label.column = Column
1278 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1279 label.operation_failed = Operation failed
1280 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1281 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1282 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1283 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1284 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1285 action.customfilter = Custom only
1286 action.showall = Show All
1287 label.insert = Insert:
1288 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1289 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1290 label.primary = Double Click
1291 label.inmenu = In Menu
1292 label.id = ID
1293 label.database = Database
1294 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1295 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1296 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1297 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1298 label.urllinks = Links
1299 label.default_cache_size = Default Cache Size
1300 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1301 label.togglehidden = Show hidden regions
1302 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1303 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1304 label.consensus_descr = PID
1305 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1306 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1307 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1308 label.show_experimental = Enable experimental features
1309 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1310 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1311 label.overview_settings = Overview settings
1312 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1313 label.gap_colour = Gap colour:
1314 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1315 label.hidden_colour = Hidden colour:
1316 label.select_gap_colour = Select gap colour
1317 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1318 label.overview = Overview
1319 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1320 label.oview_calc = Recalculating overview...
1321 label.feature_details = Feature details
1322 label.matchCondition_contains = Contains
1323 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1324 label.matchCondition_matches = Matches
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1326 label.matchCondition_present = Is present
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1329 label.matchCondition_ne = not =
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1331 label.matchCondition_le = <=
1332 label.matchCondition_gt = >
1333 label.matchCondition_ge = >=
1334 label.numeric_required = The value should be numeric
1335 label.filter = Filter
1336 label.filters = Filters
1337 label.join_conditions = Join conditions with
1338 label.score = Score
1339 label.colour_by_label = Colour by label
1340 label.variable_colour = Variable colour...
1341 label.select_colour = Select colour
1342 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1343 option.autosearch = Autosearch
1344 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1345 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
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1361 label.free_text_search = Free Text Search
1362 label.configuration = Configuration
1363 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters