Merge branch 'develop' into features/r2_11_2_alphafold/JAL-2349_JAL-3855
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.force_quit = Force quit
36 label.quit_jalview = Are you sure you want to quit Jalview?
37 label.wait_for_save = Wait for save
38 label.unsaved_changes = There are unsaved changes.
39 label.save_in_progress = Some files are still saving:
40 label.unknown = Unknown
41 label.quit_after_saving = Jalview will quit after saving.
42 label.all_saved = All files saved.
43 label.quitting_bye = Quitting, bye!
44 action.wait = Wait
45 action.cancel_quit = Cancel quit
46 action.expand_views = Expand Views
47 action.gather_views = Gather Views
48 action.page_setup = Page Setup...
49 action.reload = Reload
50 action.load = Load
51 action.open = Open
52 action.cancel = Cancel
53 action.create = Create
54 action.update = Update
55 action.delete = Delete
56 action.clear = Clear
57 action.accept = Accept
58 action.select_ddbb = --- Select Database ---
59 action.undo = Undo
60 action.redo = Redo
61 action.reset = Reset
62 action.remove_left = Remove left
63 action.remove_right = Remove right
64 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
65 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
66 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
67 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
68 action.boxes = Boxes
69 action.text = Text
70 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
71 action.by_id = By Id
72 action.by_length = By Length
73 action.by_group = By Group
74 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
75 action.set_as_reference = Set as Reference 
76 action.remove = Remove
77 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
78 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
79 action.user_defined = User Defined...
80 action.by_conservation = By Conservation
81 action.wrap = Wrap
82 action.show_gaps = Show Gaps
83 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
84 action.find = Find
85 action.undefine_groups = Undefine Groups
86 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
87 action.copy = Copy
88 action.cut = Cut
89 action.font = Font...
90 action.scale_above = Scale Above
91 action.scale_left = Scale Left
92 action.scale_right = Scale Right
93 action.by_tree_order = By Tree Order
94 action.sort = Sort
95 action.calculate_tree = Calculate Tree...
96 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
97 action.help = Help
98 action.by_annotation = By Annotation...
99 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
100 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
101 action.show = Show
102 action.hide = Hide
103 action.ok = OK
104 action.set_defaults = Defaults
105 action.create_group = Create Group
106 action.remove_group = Remove Group
107 action.edit_group = Edit Group
108 action.border_colour = Border colour
109 action.edit_new_group = Edit New Group
110 action.hide_sequences = Hide Sequences
111 action.sequences = Sequences
112 action.ids = IDS
113 action.ids_sequences = IDS and sequences
114 action.reveal_all = Reveal All
115 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
116 action.find_all = Find all
117 action.find_next = Find next
118 action.file = File
119 action.view = View
120 action.annotations = Annotations
121 action.change_params = Change Parameters
122 action.apply = Apply
123 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
124 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
125 action.by_chain = By Chain
126 action.by_sequence = By Sequence
127 action.paste_annotations = Paste Annotations
128 action.format = Format
129 action.select = Select
130 action.new_view = New View
131 action.new_structure_view_with = Open new structure view with {0}
132 action.close = Close
133 action.add = Add
134 action.save_as = Save as...
135 action.save = Save
136 action.change_font = Change Font
137 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
138 action.colour = Colour
139 action.calculate = Calculate
140 action.select_all = Select all
141 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
142 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
143 action.copy_highlighted_regions = Copy Highlighted Regions
144 tooltip.copy_highlighted_regions = Copies highlighted sequence regions to the clipboard for export or further analysis
145 action.deselect_all = Deselect all
146 action.invert_selection = Invert selection
147 action.using_jmol = Using Jmol
148 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
149 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
150 action.link = Link
151 action.group_link = Group Link
152 action.show_chain = Show Chain
153 action.show_group = Show Group
154 action.fetch_db_references = Fetch DB References
155 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
156 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
157 label.structures_manager = Structures Manager
158 label.url = URL
159 label.url\: = URL:
160 label.input_file_url = Enter URL or Input File
161 label.select_feature = Select feature
162 label.name = Name
163 label.name\: = Name:
164 label.name_param = Name: {0}
165 label.group = Group
166 label.group\: = Group:
167 label.group_name = Group Name
168 label.group_description = Group Description
169 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
170 label.colour = Colour:
171 label.description = Description
172 label.description\: = Description:
173 label.start = Start:
174 label.end = End:
175 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
176 label.service_action = Service Action:
177 label.post_url = POST URL:
178 label.url_suffix = URL Suffix
179 label.per_seq = per Sequence
180 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
181 label.amend = Amend
182 label.undo_command = Undo {0}
183 label.redo_command = Redo {0}
184 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
185 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
186 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
187 label.choose_calculation = Choose Calculation
188 label.calc_title = {0} Using {1}
189 label.tree_calc_av = Average Distance
190 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
191 label.score_model_pid = % Identity
192 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
193 label.score_model_pam250 = PAM 250
194 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
195 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
196 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
197 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
198 label.status_bar = Status bar
199 label.out_to_textbox = Output to Textbox
200 label.occupancy = Occupancy
201 # delete Clustal - use FileFormat name instead
202 label.clustal = Clustal
203 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
204 label.colourScheme_clustal = Clustal
205 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
206 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
207 label.colourScheme_zappo = Zappo
208 label.colourScheme_taylor = Taylor
209 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
210 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
211 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
212 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
213 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
214 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
215 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
216 label.colourScheme_nucleotideambiguity = Nucleotide Ambiguity
217 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
218 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
219 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
220 label.colourScheme_gecos\:flower = gecos Flower
221 label.colourScheme_gecos\:blossom = gecos Blossom
222 label.colourScheme_gecos\:sunset = gecos Sunset
223 label.colourScheme_gecos\:ocean = gecos Ocean
224 label.blc = BLC
225 label.fasta = Fasta
226 label.msf = MSF
227 label.pfam = PFAM
228 label.pileup = Pileup
229 label.pir = PIR
230 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
231 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
232 label.show_annotations = Show annotations
233 label.hide_annotations = Hide annotations
234 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
235 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
236 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
237 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
238 label.hide_all = Hide all
239 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
240 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
241 label.colour_text = Colour Text
242 label.show_non_conserved = Show nonconserved
243 label.overview_window = Overview Window
244 label.none = None
245 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
246 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
247 label.nucleotide = Nucleotide
248 label.protein = Protein
249 label.nucleotides = Nucleotides
250 label.proteins = Proteins
251 label.CDS = CDS
252 label.to_new_alignment = To New Alignment
253 label.to_this_alignment = Add To This Alignment
254 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
255 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
256 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
257 label.input_from_textbox = Input from textbox
258 label.centre_column_labels = Centre column labels
259 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
260 label.documentation = Documentation
261 label.about = About...
262 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
263 action.feature_settings = Feature Settings...
264 label.all_columns = All Columns
265 label.all_sequences = All Sequences
266 label.selected_columns = Selected Columns 
267 label.selected_sequences = Selected Sequences
268 label.except_selected_sequences = All except selected sequences
269 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
270 label.selected_region = Selected Region
271 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
272 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
273 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
274 label.group_consensus = Group Consensus
275 label.group_conservation = Group Conservation
276 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
277 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
278 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
279 label.apply_all_groups = Apply to all groups
280 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
281 label.show_first = Show first
282 label.show_last = Show last
283 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
284 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
285 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
286 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
287 label.structure_viewer = Default structure viewer
288 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
289 label.viewer_path = Path to {0} program
290 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
291 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
292 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
293 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck configured path in Structure tab of Jalview''s Preferences 
294 label.min_colour = Minimum Colour
295 label.max_colour = Maximum Colour
296 label.no_colour = No Colour
297 label.use_original_colours = Use Original Colours
298 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
299 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
300 label.selection = Selection
301 label.group_colour = Group Colour
302 label.sequence = Sequence
303 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
304 label.min_value = Min value
305 label.max_value = Max value
306 label.no_value = No value
307 label.new_feature = New Feature
308 label.match_case = Match Case
309 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
310 label.labels = Labels
311 label.output_values = Output Values...
312 label.output_points = Output points...
313 label.output_transformed_points = Output transformed points
314 label.input_data = Input Data...
315 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
316 label.protein_matrix = Protein matrix
317 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
318 label.show_distances = Show distances
319 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
320 label.fit_to_window = Fit To Window
321 label.newick_format = Newick Format
322 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
323 label.colours = Colours
324 label.view_mapping = View Mapping
325 label.wireframe = Wireframe
326 label.depthcue = Depthcue
327 label.z_buffering = Z Buffering
328 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
329 label.all_chains_visible = All Chains Visible
330 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
331 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
332 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
333 label.removed_columns = Removed {0} columns.
334 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
335 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
336 label.order_by_params = Order by {0}
337 label.html_content = <html>{0}</html>
338 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
339 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
340 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
341 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
342 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
343 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
344 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
345 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
346 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
347 label.paste_your = Paste your
348 label.finished_searching = Finished searching
349 label.subsequence_matches_found = {0} subsequence matches found
350 label.search_results= Search results {0} : {1}
351 label.found_match_for = Found match for {0}
352 label.font = Font:
353 label.size = Size:
354 label.style = Style:
355 label.calculating = Calculating....
356 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
357 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
358 label.set_this_label_text = set this label text
359 label.sequences_from = Sequences from {0}
360 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
361 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
362 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
363 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
364 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
365 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
366 label.source_to_target = {0} ... {1}
367 label.per_sequence_only= Per-sequence only
368 label.to_file = to File
369 label.to_textbox = to Textbox
370 label.jalview = Jalview
371 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
372 label.status = Status
373 label.channels = Channels
374 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
375 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
376 label.groovy_console = Groovy Console...
377 label.lineart = Lineart
378 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
379 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
380 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
381 label.invert_selection = Invert Selection
382 label.optimise_order = Optimise Order
383 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
384 label.load_colours = Load Colours
385 label.save_colours = Save Colours
386 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
387 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
388 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
389 label.database_param = Database: {0}
390 label.example = Example
391 label.example_param = Example: {0}
392 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
393 label.file_format_not_specified = File format not specified
394 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
395 label.error_saving_file = Error Saving File
396 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
397 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
398 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
399 label.invalid_selection = Invalid Selection
400 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
401 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
402 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
403 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
404 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
405 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
406 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
407 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
408 label.translation_failed = Translation Failed
409 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
410 label.implementation_error  = Implementation error:
411 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
412 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
413 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
414 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
415 label.view_name_original = Original
416 label.enter_view_name = Enter View Name
417 label.enter_label = Enter label
418 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
419 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
420 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
421 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
422 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
423 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn''t read the pasted text {0}
424 label.error_parsing_text = Error parsing text
425 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
426 label.input_alignment = Input Alignment
427 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
428 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
429 label.url_not_found = URL not found
430 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
431 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
432 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
433 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
434 label.invalid_url = Invalid URL !
435 label.error_loading_file = Error loading file
436 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
437 label.file_open_error = File open error
438 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
439 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
440 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
441 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
442 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
443 label.alignment_props = Alignment Properties
444 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
445 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
446 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
447 label.annotations = Annotations
448 label.structure_options = Structure Options
449 label.features = Features
450 label.overview_params = Overview {0}
451 label.paste_newick_file = Paste Newick file
452 label.load_tree_from_file = From File - 
453 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
454 label.selection_output_command = Selection output - {0}
455 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
456 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
457 label.pca_details = PCA details
458 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
459 label.user_defined_colours = User defined colours
460 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
461 label.jaview_build_date = Build date: {0}
462 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
463 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
464 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
465 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
466 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
467 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
468 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
469 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
470 label.right_click = Right click
471 label.to_add_annotation = to add annotation
472 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
473 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
474 label.label = Label
475 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
476 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
477 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
478 label.calculating_pca= Calculating PCA
479 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
480 label.jalview_applet = Jalview applet
481 label.loading_data = Loading data
482 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
483 label.calculating_tree = Calculating tree
484 label.state_queueing = queuing
485 label.state_running = running
486 label.state_completed = finished
487 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
488 label.state_job_error = job error!
489 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
490 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
491 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
492 label.structure_type = Structure type
493 label.settings_for_type = Settings for {0}
494 label.view_full_application = View in Full Application
495 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
496 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
497 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
498 label.load_vcf_file = Load VCF File
499 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
500 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
501 label.export_features = Export Features...
502 label.export_annotations = Export Annotations...
503 label.to_upper_case = To Upper Case
504 label.to_lower_case = To Lower Case
505 label.toggle_case = Toggle Case
506 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
507 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
508 label.edit_sequence = Edit Sequence
509 label.edit_sequences = Edit Sequences
510 label.insert_gap = Insert 1 gap
511 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
512 label.delete_gap = Delete 1 gap
513 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
514 label.sequence_details = Sequence Details
515 label.viewer_help = {0} Help
516 label.close_viewer = Close Viewer
517 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
518 label.all = All
519 label.sort_by = Sort alignment by
520 label.sort_by_score = Sort by Score
521 label.sort_by_density = Sort by Density
522 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
523 label.sort_ann_by = Sort annotations by
524 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
525 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
526 label.reveal = Reveal
527 label.hide_columns = Hide Columns
528 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
529 label.load_tree_file = Load a tree file
530 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
531 label.standard_databases = Standard Databases
532 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
533 label.fetch_uniprot_references = Fetch Uniprot references
534 label.search_3dbeacons = Search 3D-Beacons
535 label.find_models_from_3dbeacons = Search 3D-Beacons for 3D structures and models
536 label.3dbeacons = 3D-Beacons
537 label.fetch_references_for = Fetch database references for {0} sequences ?
538 label.fetch_references_for_3dbeacons = 3D Beacons needs to fetch Uniprot References for {0} sequences.  Do you want to continue ?
539 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
540 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
541 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
542 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
543 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
544 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
545 label.adjust_threshold = Adjust threshold
546 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
547 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
548 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
549 label.open_url_param = Open URL {0}
550 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
551 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
552 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
553 label.dark_colour = Dark Colour
554 label.light_colour = Light Colour
555 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
556 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
557 label.copy_format_from = Copy format from
558 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
559 label.select_all_views = Select all views
560 label.select_many_views = Select many views
561 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
562 label.open_local_file = Open local file
563 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
564 label.listen_for_selections = Listen for selections
565 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
566 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
567 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
568 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
569 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
570 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
571 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
572 label.no_services = <No Services>
573 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
574 label.from_url = from URL
575 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
576 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
577 label.from_textbox = from Textbox
578 label.window = Window
579 label.preferences = Preferences
580 label.tools = Tools
581 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
582 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
583 label.collect_garbage = Collect Garbage
584 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
585 label.show_java_console = Show Java Console
586 label.show_jalview_news = Show Jalview News
587 label.take_snapshot = Take snapshot
588 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
589 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
590 label.monospaced_font= Monospaced
591 label.quality = Quality
592 label.maximize_window = Maximize Window
593 label.conservation = Conservation
594 label.consensus = Consensus
595 label.histogram = Histogram
596 label.logo = Logo
597 label.non_positional_features = List Non-positional Features
598 label.database_references = List Database References
599 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
600 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
601 label.gap_symbol = Gap Symbol
602 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
603 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
604 label.address = Address
605 label.host = Host
606 label.port = Port
607 label.default_browser_unix_windows = Default Browser (Unix, Windows)
608 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
609 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
610 label.check_for_latest_version = Check for latest version
611 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
612 label.no_proxy = No proxy servers
613 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
614 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
615 label.auth_required = Authentication required
616 label.username = Username
617 label.password = Password
618 label.proxy_password_required = Proxy password required
619 label.not_stored = not stored in Preferences file
620 label.rendering_style = {0} rendering style
621 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
622 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
623 label.smooth_font = Smooth Font
624 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
625 label.pad_gaps = Pad Gaps
626 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
627 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
628 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
629 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
630 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
631 label.right_align_ids = Right Align Ids
632 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
633 label.open_overview = Open Overview
634 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
635 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
636 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
637 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
638 label.visual = Visual
639 label.connections = Connections
640 label.output = Output
641 label.editing = Editing
642 label.web_services = Web Services
643 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
644 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
645 label.fetch_viewer_attributes = Fetch {0} attributes
646 label.fetch_viewer_attributes_tip = Copy {0} attribute to Jalview feature
647 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
648 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
649 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
650 label.new_service_url = New Service URL
651 label.edit_service_url = Edit Service URL
652 label.delete_service_url = Delete Service URL
653 label.details = Details
654 label.options = Options
655 label.parameters = Parameters
656 label.proxy_servers = Proxy Servers
657 label.file_output = File Output
658 label.select_input_type = Select input type
659 label.set_options_for_type = Set options for type
660 label.data_input_parameters = Data input parameters
661 label.data_returned_by_service = Data returned by service
662 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
663 label.parsing_errors = Parsing errors
664 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
665 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
666 label.input_parameter_name = Input Parameter name
667 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
668 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
669 label.brief_description_service = Brief description of service
670 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
671 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
672 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
673 label.gap_character = Gap character
674 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
675 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
676 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
677 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
678 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
679 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
680 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
681 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
682 label.input_output = Input/Output
683 label.cut_paste = Cut'n'Paste
684 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
685 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
686 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
687 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
688 label.from_file = From File
689 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
690 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
691 label.text_colour = Text Colour...
692 label.structure = Structure
693 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
694 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
695 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
696 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
697 label.sequence_name = Sequence Name
698 label.sequence_description = Sequence Description
699 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
700 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
701 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
702 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
703 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
704 label.web_browser_not_found = Web browser not found
705 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
706 label.html = HTML
707 label.wrap = Wrap
708 label.show_database_refs = Show Database Refs
709 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
710 label.save_png_image = Save As PNG Image
711 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
712 label.export_image = Export Image
713 label.vamsas_store = VAMSAS store
714 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
715 label.reverse = Reverse
716 label.reverse_complement = Reverse Complement
717 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
718 label.extract_scores = Extract Scores
719 label.get_cross_refs = Get Cross-References
720 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
721 label.add_sequences = Add Sequences
722 label.new_window = New Window
723 label.split_window = Split Window
724 label.set_as_default = Set as Default
725 label.show_labels = Show labels
726 action.background_colour = Background Colour...
727 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
728 label.link_name = Link Name
729 label.pdb_file = PDB file
730 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
731 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
732 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
733 label.superpose_structures = Superpose Structures
734 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
735 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
736 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
737 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
738 label.attributes_set = {0} attribute values set on {1}
739 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
740 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
741 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
742 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
743 label.case_sensitive = Case Sensitive
744 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
745 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
746 label.index_by_host = Index by Host
747 label.index_by_type = Index by Type
748 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
749 label.display_warnings = Display Warnings
750 label.move_url_up = Move URL Up
751 label.move_url_down = Move URL Down
752 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
753 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
754 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
755 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
756 label.sequences_updated = Sequences updated
757 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
758 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
759 label.paste_new_window = Paste To New Window
760 label.settings_for_param = Settings for {0}
761 label.view_params = View {0}
762 label.aacon_calculations = AACon Calculations
763 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
764 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
765 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
766 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
767 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
768 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
769 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
770 label.all_views = All Views
771 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
772 label.realign_with_params = Realign with {0}
773 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
774 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
775 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
776 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
777 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
778 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
779 label.view_documentation = View documentation
780 label.select_return_type = Select return type
781 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
782 label.features_for_params = Features for - {0}
783 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
784 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
785 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
786 label.varna_params = VARNA - {0}
787 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
788 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
789 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
790 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
791 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
792 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
793 label.points_for_params = Points for {0}
794 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
795 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
796 label.select_background_colour = Select Background Colour
797 label.invalid_font = Invalid Font
798 label.search_db_all = Search all of {0}
799 label.search_db_index = Search {0} index {1}
800 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
801 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0} separated by a semi-colon ";"
802 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
803 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
804 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
805 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
806 label.example_query_param = Example query: {0}
807 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
808 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
809 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
810 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
811 label.select_columns_containing = Select columns containing
812 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
813 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
814 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
815 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
816 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
817 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
818 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
819 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
820 label.use_sequence_id_4 = 
821 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
822 label.switch_server = Switch server
823 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
824 label.services_at = Services at {0}
825 label.rest_client_submit = {0} using {1}
826 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
827 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
828 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
829 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
830 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
831 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
832 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
833 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
834 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
835 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
836 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
837 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
838 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
839 label.user_preset = User Preset
840 label.service_preset = Service Preset
841 label.run_with_preset = Run {0} with preset
842 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
843 action.by_title_param = By {0}
844 label.source_from_db_source = Sources from {0}
845 label.from_msname = from {0}
846 label.superpose_with = Superpose with
847 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
848 label.add_new_row = Add New Row
849 label.edit_label_description = Edit Label/Description
850 label.hide_row = Hide This Row
851 label.delete_row = Delete This Row
852 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
853 label.export_annotation = Export Annotation
854 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
855 label.helix = Helix
856 label.sheet = Sheet
857 label.rna_helix = RNA Helix
858 label.remove_annotation = Remove Annotation
859 label.colour_by = Colour by...
860 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
861 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
862 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
863 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
864 label.multiharmony = Multi-Harmony
865 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
866 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
867 label.prompt_each_time = Prompt each time
868 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
869 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
870 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
871 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
872 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
873 label.invalid_name = Invalid name
874 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
875 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
876 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
877 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn''t be located.
878 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
879 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
880 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
881 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
882 label.feature_type = Feature Type
883 label.show = Show
884 label.service_url = Service URL
885 label.copied_sequences = Copied sequences
886 label.cut_sequences = Cut Sequences
887 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
888 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
889 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
890 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
891 label.save_features_to_file = Save Features to File
892 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
893 label.save_pdb_file = Save PDB File
894 label.save_text_to_file = Save Text to File
895 label.save_state = Save State
896 label.restore_state = Restore State
897 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
898 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
899 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
900 label.select_startup_file = Select startup file
901 label.select_default_browser = Select default web browser
902 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
903 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
904 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
905 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
906 label.save_as_html = Save as HTML
907 label.recently_opened = Recently Opened
908 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
909 label.tree = Tree
910 label.tree_from = Tree from {0}
911 label.webservice_job_title = {0} using {1}
912 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
913 label.visible = Visible
914 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
915 label.visible_region_of = visible region of
916 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
917 label.loading_file = Loading File: {0}
918 label.edit_params = Edit {0}
919 label.as_percentage = As Percentage
920 error.not_implemented = Not implemented
921 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
922 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
923 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
924 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
925 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
926 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
927 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
928 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
929 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
930 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
931 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
932 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
933 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
934 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
935 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
936 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
937 error.implementation_error = Implementation error
938 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
939 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
940 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
941 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
942 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
943 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
944 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
945 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
946 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
947 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
948 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
949 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
950 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
951 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
952 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
953 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
954 label.cancelled_params = Cancelled {0}
955 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
956 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
957 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
958 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
959 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
960 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
961 error.invalid_value_for_option = Invalid value ''{0}'' for option ''{1}''
962 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
963 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
964 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
965 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
966 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
967 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
968 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
969 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
970 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
971 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
972 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
973 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
974 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
975 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
976 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
977 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
978 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
979 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
980 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
981 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
982 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
983 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
984 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
985 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
986 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
987 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
988 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
989 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
990 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
991 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can''t locate either oldname ({0}) or presetName ({1}) in the datastore!"
992 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
993 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
994 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
995 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
996 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
997 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
998 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
999 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn''t encode {0} as UTF-8.
1000 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1001 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1002 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1003 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1004 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1005 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1006 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
1007 label.toggled = Toggled
1008 label.marked = Marked
1009 label.containing = containing
1010 label.not_containing = not containing
1011 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
1012 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
1013 label.submission_params = Submission {0}
1014 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1015 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1016 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1017 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1018 label.pca_calculating = Calculating PCA
1019 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1020 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1021 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1022 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1023 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1024 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1025 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1026 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1027 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1028 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1029 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1030 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1031 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1032 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1033 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1034 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1035 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1036 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1037 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1038 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1039 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1040 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1041 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1042 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1043 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1044 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1045 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1046 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1047 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1048 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1049 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1050 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1051 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1052 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1053 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1054 label.mapped = mapped
1055 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1056 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn''t parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1057 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1058 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1059 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn''t access datasource ({0})
1060 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn''t process data as RNAML file ({0})
1061 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1062 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1063 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1064 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1065 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1066 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1067 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn''t store sequence mappings for {0}
1068 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1069 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1070 exception.browser_unable_to_launch = Unable to launch browser: {0}
1071 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1072 exception.browser_os_not_supported = Launching browser on this operating system not supported.  Use URL\n{0}
1073 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1074 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1075 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1076 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1077 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1078 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1079 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1080 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1081 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1082 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1083 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1084 label.remove_gaps = Remove Gaps
1085 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1086 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1087 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1088 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1089 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1090 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1091 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1092 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1093 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1094 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1095 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1096 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1097 warn.service_not_supported = Service not supported!
1098 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1099 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1100 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1101 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn''t support this program.\n{0}
1102 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1103 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1104 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1105 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1106 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1107 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1108 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1109 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1110 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1111 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1112 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1113 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1114 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1115 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1116 label.eps_file = EPS file
1117 label.png_image = PNG image
1118 status.export_complete = {0} Export completed
1119 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1120 status.refreshing_news = Refreshing news
1121 status.opening_params = Opening {0}
1122 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1123 status.finshed_querying = Finished querying
1124 status.parsing_results = Parsing results.
1125 status.processing = Processing...
1126 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1127 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1128 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1129 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1130 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1131 status.searching_3d_beacons = Searching 3D Beacons
1132 status.no_structures_discovered_from_3d_beacons = No models discovered from 3D Beacons
1133 status.opening_file_for = opening file for
1134 status.colouring_structures = Colouring structures
1135 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1136 label.font_too_small = Font size is too small
1137 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1138 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1139 label.out_of_memory = Out of memory
1140 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1141 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1142 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1143 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1144 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1145 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1146 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1147 label.test_server = Test Server?
1148 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1149 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1150 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1151 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1152 label.file_already_exists = File exists
1153 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1154 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1155 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1156 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1157 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1158 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1159 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1160 label.delete_all = Delete all sequences
1161 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1162 label.add_annotations_for = Add annotations for
1163 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1164 label.choose_annotations = Choose Annotations
1165 label.find = Find
1166 label.in = in
1167 label.invalid_search = Search string invalid
1168 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1169 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1170 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1171 label.show_group_logo = Show Group Logo
1172 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1173 label.show_histogram = Show Histogram
1174 label.show_logo = Show Logo
1175 label.normalise_logo = Normalise Logo
1176 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1177 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1178 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1179 label.open_split_window = Open split window
1180 action.no = No
1181 action.yes = Yes
1182 label.for = for
1183 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1184 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1185 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1186 label.alpha_helix = Alpha Helix
1187 label.beta_strand = Beta Strand
1188 label.turn = Turn
1189 label.select_all = Select All
1190 label.structures_filter = Structures Filter
1191 label.search_filter = Search Filter
1192 label.include_description= Include Description
1193 action.back = Back
1194 label.hide_insertions = Hide Insertions
1195 label.mark_as_representative = Mark as representative
1196 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1197 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1198 label.result = result
1199 label.results = results
1200 label.structure_chooser = Structure Chooser
1201 label.invert = Invert 
1202 label.select_pdb_file = Select PDB File
1203 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1204 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1205 label.search_result = Search Result
1206 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1207 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1208 label.start_jalview = Start Jalview
1209 label.biojs_html_export = BioJS
1210 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1211 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1212 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1213 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1214 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1215 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1216 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1217 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1218 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1219 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1220 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1221 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1222 action.export_groups = Export Groups
1223 action.export_annotations = Export Annotations
1224 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1225 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1226 action.export_features = Export Features
1227 label.export_settings = Export Settings
1228 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1229 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1230 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1231 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1232 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1233 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1234 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1235 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1236 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1237 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1238 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1239 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1240 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1241 label.run_groovy = Run Groovy console script
1242 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1243 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1244 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1245 action.next_page= >> 
1246 action.prev_page= << 
1247 label.next_page_tooltip=Next Page
1248 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1249 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1250 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1251 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1252 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1253 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1254 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1255 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1256 label.column = Column
1257 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1258 label.operation_failed = Operation failed
1259 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1260 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1261 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1262 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1263 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1264 action.customfilter = Custom only
1265 action.showall = Show All
1266 label.insert = Insert:
1267 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1268 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1269 label.primary = Double Click
1270 label.inmenu = In Menu
1271 label.id = ID
1272 label.database = Database
1273 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1274 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1275 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1276 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1277 label.urllinks = Links
1278 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1279 label.togglehidden = Show hidden regions
1280 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1281 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1282 label.consensus_descr = PID
1283 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1284 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1285 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1286 label.show_experimental = Enable experimental features
1287 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1288 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1289 label.overview_settings = Overview settings
1290 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1291 label.gap_colour = Gap colour:
1292 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1293 label.hidden_colour = Hidden colour:
1294 label.select_gap_colour = Select gap colour
1295 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1296 label.overview = Overview
1297 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1298 label.oview_calc = Recalculating overview...
1299 label.feature_details = Feature details
1300 label.matchCondition_contains = Contains
1301 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1302 label.matchCondition_matches = Matches
1303 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1304 label.matchCondition_present = Is present
1305 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1306 label.matchCondition_eq = =
1307 label.matchCondition_ne = not =
1308 label.matchCondition_lt = <
1309 label.matchCondition_le = <=
1310 label.matchCondition_gt = >
1311 label.matchCondition_ge = >=
1312 label.numeric_required = The value should be numeric
1313 label.filter = Filter
1314 label.filters = Filters
1315 label.join_conditions = Join conditions with
1316 label.delete_condition = Delete this condition
1317 label.score = Score
1318 label.colour_by_label = Colour by label
1319 label.variable_colour = Variable colour...
1320 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1321 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1322 option.autosearch = Autosearch
1323 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1324 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1325 label.simple_colour = Simple Colour
1326 label.colour_by_text = Colour by text
1327 label.graduated_colour = Graduated Colour
1328 label.by_text_of = By text of
1329 label.by_range_of = By range of
1330 label.or = Or
1331 label.and = And
1332 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1333 label.best_quality = Best Quality
1334 label.best_resolution = Best Resolution
1335 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1336 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1337 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1338 label.cached_structures = Cached Structures
1339 label.free_text_search = Free Text Search
1340 label.annotation_name = Annotation Name
1341 label.annotation_description = Annotation Description 
1342 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1343 label.alignment = alignment
1344 label.pca = PCA
1345 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1346 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1347 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1348 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1349 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1350 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1351 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1352 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1353 label.continue_operation = Continue operation?
1354 label.continue = Continue
1355 label.backups = Backups
1356 label.backup = Backup
1357 label.backup_files = Backup Files
1358 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1359 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1360 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1361 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1362 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1363 label.scheme_examples = Scheme examples
1364 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1365 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1366 label.keep_files = Deleting old backup files
1367 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1368 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1369 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1370 label.always_ask = Always ask
1371 label.auto_delete = Automatically delete
1372 label.filename = filename
1373 label.braced_oldest = (oldest)
1374 label.braced_newest = (most recent)
1375 label.configuration = Configuration
1376 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1377 label.schemes = Schemes
1378 label.customise = Customise
1379 label.custom = Custom
1380 label.default = Default
1381 label.single_file = Single backup
1382 label.keep_all_versions = Keep all versions
1383 label.rolled_backups = Rolled backup files
1384 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1385 label.custom_description = Your own saved scheme
1386 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1387 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1388 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1389 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1390 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1391 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1392 label.include_backup_files = Include backup files
1393 label.cancel_changes = Cancel changes
1394 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1395 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1396 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1397 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1398 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1399 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1400 label.delete = Delete
1401 label.rename = Rename
1402 label.keep = Keep
1403 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1404 label.annotation_name = Annotation Name
1405 label.annotation_description = Annotation Description 
1406 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1407 label.alignment = alignment
1408 label.pca = PCA
1409 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1410 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1411 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1412 label.show_linked_features = Show {0} features
1413 label.on_top = on top
1414 label.include_features = Include Features
1415 label.search_features = Search descriptions of displayed features
1416 label.include_linked_features = Include {0} features
1417 label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
1418 label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
1419 label.no_features_to_sort_by = No features to sort by
1420 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1421 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching
1422 label.log_level = Log level
1423 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1424 label.copy = Copy
1425 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1426 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1427 label.startup = Startup
1428 label.memory = Memory
1429 label.customise_memory_settings = Customise maximum memory settings
1430 label.memory_setting_text = New memory settings will only come into effect the next time you start Jalview
1431 label.maximum_memory_used = Maximum memory limited to both
1432 label.percent_of_physical_memory = Maximum percent of physical memory
1433 label.maximum_memory = Maximum absolute memory
1434 label.maximum_memory_tooltip = Enter memory as an integer number optionally followed by 'b', 'k', 'm', 'g' or 't'
1435 label.adjustments_for_this_computer = Adjustments for this computer
1436 label.memory_example_text = Maximum memory that would be used with these settings on this computer
1437 label.memory_example_tooltip = The memory allocated to Jalview is the smaller of the percentage of physical memory (default 90%) and the maximum absolute memory (default 32GB). If your computer's memory cannot be ascertained then the maximum absolute memory defaults to 8GB (if not customised).<br>Jalview will always try and reserve 512MB for the OS and at least 512MB for itself.
1438 warning.wrong_jvm_version_title = Wrong Java Version
1439 warning.wrong_jvm_version_message = The Java version being used (Java {0}) may lead to problems.\nThis installation of Jalview should be used with Java {1}.