JAL-2361 option to save on OK of changed named colour scheme
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme {0} have not been saved<br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.quit = Quit
34 action.expand_views = Expand Views
35 action.gather_views = Gather Views
36 action.page_setup = Page Setup...
37 action.reload = Reload
38 action.load = Load
39 action.open = Open
40 action.cancel = Cancel
41 action.create = Create
42 action.update = Update
43 action.delete = Delete
44 action.clear = Clear
45 action.accept = Accept
46 action.select_ddbb = --- Select Database ---
47 action.undo = Undo
48 action.redo = Redo
49 action.reset = Reset
50 action.remove_left = Remove left
51 action.remove_right = Remove right
52 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
53 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
54 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
55 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
56 action.boxes = Boxes
57 action.text = Text
58 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
59 action.by_id = By Id
60 action.by_length = By Length
61 action.by_group = By Group
62 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
63 action.set_as_reference = Set as Reference 
64 action.remove = Remove
65 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
66 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
67 action.user_defined = User Defined...
68 action.by_conservation = By Conservation
69 action.wrap = Wrap
70 action.show_gaps = Show Gaps
71 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
72 action.find = Find
73 action.undefine_groups = Undefine Groups
74 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
75 action.copy = Copy
76 action.cut = Cut
77 action.font = Font...
78 action.scale_above = Scale Above
79 action.scale_left = Scale Left
80 action.scale_right = Scale Right
81 action.by_tree_order = By Tree Order
82 action.sort = Sort
83 action.calculate_tree = Calculate Tree
84 action.help = Help
85 action.by_annotation = By Annotation...
86 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
87 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
88 action.show = Show
89 action.hide = Hide
90 action.ok = OK
91 action.set_defaults = Defaults
92 action.create_group = Create Group
93 action.remove_group = Remove Group
94 action.edit_group = Edit Group
95 action.border_colour = Border colour
96 action.edit_new_group = Edit New Group
97 action.hide_sequences = Hide Sequences
98 action.sequences = Sequences
99 action.ids = IDS
100 action.ids_sequences = IDS and sequences
101 action.reveal_all = Reveal All
102 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
103 action.find_all = Find all
104 action.find_next = Find next
105 action.file = File
106 action.view = View
107 action.annotations = Annotations
108 action.change_params = Change Parameters
109 action.apply = Apply
110 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
111 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
112 action.by_chain = By Chain
113 action.by_sequence = By Sequence
114 action.paste_annotations = Paste Annotations
115 action.format = Format
116 action.select = Select
117 action.new_view = New View
118 action.close = Close
119 action.add = Add
120 action.save_as_default = Save as default
121 action.save_as = Save as...
122 action.save = Save
123 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
124 action.change_font = Change Font
125 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
126 action.colour = Colour
127 action.calculate = Calculate
128 action.select_all = Select all
129 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
130 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
131 action.deselect_all = Deselect all
132 action.invert_selection = Invert selection
133 action.using_jmol = Using Jmol
134 action.link = Link
135 action.group_link = Group Link
136 action.show_chain = Show Chain
137 action.show_group = Show Group
138 action.fetch_db_references = Fetch DB References
139 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
140 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
141 label.structures_manager = Structures Manager
142 label.nickname = Nickname:
143 label.url = URL
144 label.url\: = URL:
145 label.input_file_url = Enter URL or Input File
146 label.select_feature = Select feature
147 label.name = Name
148 label.name\: = Name:
149 label.name_param = Name: {0}
150 label.group = Group
151 label.group\: = Group:
152 label.group_name = Group Name
153 label.group_description = Group Description
154 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
155 label.colour = Colour:
156 label.description = Description
157 label.description\: = Description:
158 label.start = Start:
159 label.end = End:
160 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
161 label.service_action = Service Action:
162 label.post_url = POST URL:
163 label.url_suffix = URL Suffix
164 label.sequence_source = Sequence Source
165 label.per_seq = per Sequence
166 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
167 label.amend = Amend
168 label.undo_command = Undo {0}
169 label.redo_command = Redo {0}
170 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
171 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
172 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
173 label.treecalc_title = {0} Using {1}
174 label.tree_calc_av = Average Distance
175 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
176 label.select_score_model = Select score model
177 label.score_model_pid = % Identity
178 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
179 label.score_model_pam250 = PAM 250
180 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
181 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
182 label.status_bar = Status bar
183 label.out_to_textbox = Output to Textbox
184 # delete Clustal - use FileFormat name instead
185 label.clustal = Clustal
186 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
187 label.colourScheme_clustal = Clustalx
188 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
189 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
190 label.colourScheme_zappo = Zappo
191 label.colourScheme_taylor = Taylor
192 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
193 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
194 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
195 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
196 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
197 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
198 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
199 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
200 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
201 label.blc = BLC
202 label.fasta = Fasta
203 label.msf = MSF
204 label.pfam = PFAM
205 label.pileup = Pileup
206 label.pir = PIR
207 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
208 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
209 label.show_annotations = Show annotations
210 label.hide_annotations = Hide annotations
211 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
212 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
213 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
214 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
215 label.hide_all = Hide all
216 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
217 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
218 label.colour_text = Colour Text
219 label.show_non_conserved = Show nonconserved
220 label.overview_window = Overview Window
221 label.none = None
222 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
223 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
224 label.nucleotide = Nucleotide
225 label.protein = Protein
226 label.nucleotides = Nucleotides
227 label.proteins = Proteins
228 label.to_new_alignment = To New Alignment
229 label.to_this_alignment = Add To This Alignment
230 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
231 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
232 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
233 label.input_from_textbox = Input from textbox
234 label.centre_column_labels = Centre column labels
235 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
236 label.documentation = Documentation
237 label.about = About...
238 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
239 action.feature_settings = Feature Settings...
240 label.feature_settings = Feature Settings
241 label.all_columns = All Columns
242 label.all_sequences = All Sequences
243 label.selected_columns = Selected Columns 
244 label.selected_sequences = Selected Sequences
245 label.except_selected_sequences = All except selected sequences
246 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
247 label.selected_region = Selected Region
248 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
249 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
250 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
251 label.group_consensus = Group Consensus
252 label.group_conservation = Group Conservation
253 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
254 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
255 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
256 label.apply_all_groups = Apply to all groups
257 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
258 label.show_first = Show first
259 label.show_last = Show last
260 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
261 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
262 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
263 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
264 label.structure_viewer = Default structure viewer
265 label.chimera_path = Path to Chimera program
266 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
267 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
268 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
269 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
270 label.min_colour = Minimum Colour
271 label.max_colour = Maximum Colour
272 label.use_original_colours = Use Original Colours
273 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
274 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
275 label.selection = Selection
276 label.group_colour = Group Colour
277 label.sequence = Sequence
278 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
279 label.min = Min:
280 label.max = Max:
281 label.colour_by_label = Colour by label
282 label.new_feature = New Feature
283 label.match_case = Match Case
284 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
285 label.labels = Labels
286 label.output_values = Output Values...
287 label.output_points = Output points...
288 label.output_transformed_points = Output transformed points
289 label.input_data = Input Data...
290 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
291 label.protein_matrix = Protein matrix
292 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
293 label.show_distances = Show distances
294 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
295 label.fit_to_window = Fit To Window
296 label.newick_format = Newick Format
297 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
298 label.colours = Colours
299 label.view_mapping = View Mapping
300 label.wireframe = Wireframe
301 label.depthcue = Depthcue
302 label.z_buffering = Z Buffering
303 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
304 label.all_chains_visible = All Chains Visible
305 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
306 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
307 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
308 label.removed_columns = Removed {0} columns.
309 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
310 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
311 label.order_by_params = Order by {0}
312 label.html_content = <html>{0}</html>
313 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
314 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
315 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
316 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
317 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
318 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
319 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
320 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
321 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
322 label.paste_your = Paste your
323 label.finished_searching = Finished searching
324 label.search_results= Search results {0} : {1}
325 label.found_match_for = Found match for {0}
326 label.font = Font:
327 label.size = Size:
328 label.style = Style:
329 label.calculating = Calculating....
330 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
331 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
332 label.set_this_label_text = set this label text
333 label.sequences_from = Sequences from {0}
334 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
335 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
336 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
337 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
338 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
339 label.source_to_target = {0} ... {1}
340 label.per_sequence_only= Per-sequence only
341 label.to_file = to File
342 label.to_textbox = to Textbox
343 label.jalview = Jalview
344 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
345 label.status = Status
346 label.channels = Channels
347 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
348 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
349 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
350 label.session_update = Session Update
351 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
352 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
353 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
354 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
355 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
356 label.groovy_console = Groovy Console...
357 label.lineart = Lineart
358 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
359 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
360 label.invert_selection = Invert Selection
361 label.optimise_order = Optimise Order
362 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
363 label.load_colours = Load Colours
364 label.save_colours = Save Colours
365 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
366 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
367 label.database_param = Database: {0}
368 label.example = Example
369 label.example_param = Example: {0}
370 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
371 label.file_format_not_specified = File format not specified
372 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
373 label.error_saving_file = Error Saving File
374 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
375 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
376 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
377 label.invalid_selection = Invalid Selection
378 label.principal_component_analysis_must_take_least_four_input_sequences = Principal component analysis must take\nat least 4 input sequences.
379 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
380 label.you_need_more_two_sequences_selected_build_tree = You need to have more than two sequences selected to build a tree!
381 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
382 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
383 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
384 label.sequences_must_be_aligned_before_creating_tree = The sequences must be aligned before creating a tree.\nTry using the Pad function in the edit menu,\n or one of the multiple sequence alignment web services.
385 label.sequences_not_aligned = Sequences not aligned
386 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
387 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
388 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
389 label.translation_failed = Translation Failed
390 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
391 label.implementation_error  = Implementation error:
392 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
393 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
394 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
395 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
396 label.view_name_original = Original
397 label.enter_view_name = Enter View Name
398 label.enter_label = Enter label
399 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
400 label.pdb_entry_is_already_displayed = {0} is already displayed.\nDo you want to re-use this viewer ?
401 label.map_sequences_to_visible_window = Map Sequences to Visible Window: {0}
402 label.add_pdbentry_to_view = Do you want to add {0} to the view called\n{1}\n
403 label.align_to_existing_structure_view = Align to existing structure view
404 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
405 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
406 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
407 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
408 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
409 label.error_parsing_text = Error parsing text
410 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
411 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
412 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
413 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
414 label.input_alignment = Input Alignment
415 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
416 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
417 label.couldnt_locate = Couldn't locate {0}
418 label.url_not_found = URL not found
419 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
420 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
421 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
422 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
423 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
424 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
425 label.invalid_url = Invalid URL !
426 label.error_loading_file = Error loading file
427 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
428 label.file_open_error = File open error
429 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
430 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
431 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
432 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
433 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
434 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
435 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
436 label.alignment_props = Alignment Properties
437 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
438 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
439 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
440 label.annotations = Annotations
441 label.structure_options = Structure Options
442 label.features = Features
443 label.overview_params = Overview {0}
444 label.paste_newick_file = Paste Newick file
445 label.load_tree_from_file = From File - 
446 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
447 label.selection_output_command = Selection output - {0}
448 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
449 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
450 label.pca_details = PCA details
451 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
452 label.user_defined_colours = User defined colours
453 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
454 label.jaview_build_date = Build date: {0}
455 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
456 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
457 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
458 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
459 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
460 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
461 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
462 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
463 label.right_click = Right click
464 label.to_add_annotation = to add annotation
465 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
466 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
467 label.label = Label
468 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
469 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
470 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
471 label.calculating_pca= Calculating PCA
472 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
473 label.jalview_applet = Jalview applet
474 label.loading_data = Loading data
475 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
476 label.calculating_tree = Calculating tree
477 label.state_queueing = queuing
478 label.state_running = running
479 label.state_completed = finished
480 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
481 label.state_job_error = job error!
482 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
483 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
484 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
485 label.structure_type = Structure type
486 label.settings_for_type = Settings for {0}
487 label.view_full_application = View in Full Application
488 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
489 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
490 label.export_features = Export Features...
491 label.export_annotations = Export Annotations...
492 label.to_upper_case = To Upper Case
493 label.to_lower_case = To Lower Case
494 label.toggle_case = Toggle Case
495 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
496 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
497 label.edit_sequence = Edit Sequence
498 label.edit_sequences = Edit Sequences
499 label.sequence_details = Sequence Details
500 label.jmol_help = Jmol Help
501 label.chimera_help = Chimera Help
502 label.close_viewer = Close Viewer
503 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
504 label.all = All
505 label.sort_by = Sort alignment by
506 label.sort_by_score = Sort by Score
507 label.sort_by_density = Sort by Density
508 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
509 label.sort_ann_by = Sort annotations by
510 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
511 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
512 label.reveal = Reveal
513 label.hide_columns = Hide Columns
514 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
515 label.load_tree_file = Load a tree file
516 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
517 label.standard_databases = Standard Databases
518 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
519 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
520 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
521 label.connect_to_session = Connect to session {0}
522 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
523 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
524 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
525 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
526 label.adjust_threshold = Adjust threshold
527 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
528 label.display_features_same_type_different_label_using_different_colour = Display features of the same type with a different label using a different colour. (e.g. domain features)
529 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
530 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
531 label.open_url_param = Open URL {0}
532 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
533 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
534 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
535 label.dark_colour = Dark Colour
536 label.light_colour = Light Colour
537 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
538 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
539 label.copy_format_from = Copy format from
540 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
541 label.select_all_views = Select all views
542 label.select_many_views = Select many views
543 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
544 label.open_local_file = Open local file
545 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
546 label.listen_for_selections = Listen for selections
547 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
548 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
549 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
550 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
551 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
552 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
553 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
554 label.no_services = <No Services>
555 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
556 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
557 label.connect_to = Connect to
558 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
559 label.from_url = from URL
560 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
561 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
562 label.from_textbox = from Textbox
563 label.window = Window
564 label.preferences = Preferences
565 label.tools = Tools
566 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
567 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
568 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
569 label.collect_garbage = Collect Garbage
570 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
571 label.show_java_console = Show Java Console
572 label.show_jalview_news = Show Jalview News
573 label.take_snapshot = Take snapshot
574 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
575 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
576 label.monospaced_font= Monospaced
577 label.quality = Quality
578 label.maximize_window = Maximize Window
579 label.conservation = Conservation
580 label.consensus = Consensus
581 label.histogram = Histogram
582 label.logo = Logo
583 label.non_positional_features = List Non-positional Features
584 label.database_references = List Database References
585 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
586 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
587 label.gap_symbol = Gap Symbol
588 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
589 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
590 label.address = Address
591 label.port = Port
592 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
593 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
594 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
595 label.check_for_latest_version = Check for latest version
596 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
597 label.use_proxy_server = Use a proxy server
598 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
599 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
600 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
601 label.smooth_font = Smooth Font
602 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
603 label.pad_gaps = Pad Gaps
604 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
605 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
606 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
607 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
608 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
609 label.right_align_ids = Right Align Ids
610 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
611 label.open_overview = Open Overview
612 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
613 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
614 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
615 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
616 label.visual = Visual
617 label.connections = Connections
618 label.output = Output
619 label.editing = Editing
620 label.das_settings = DAS Settings
621 label.web_services = Web Services
622 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
623 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
624 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
625 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
626 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
627 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
628 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
629 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
630 label.new_service_url = New Service URL
631 label.edit_service_url = Edit Service URL
632 label.delete_service_url = Delete Service URL
633 label.details = Details
634 label.options = Options
635 label.parameters = Parameters
636 label.available_das_sources = Available DAS Sources
637 label.full_details = Full Details
638 label.authority = Authority
639 label.type = Type
640 label.proxy_server = Proxy Server
641 label.file_output = File Output
642 label.select_input_type = Select input type
643 label.set_options_for_type = Set options for type
644 label.data_input_parameters = Data input parameters
645 label.data_returned_by_service = Data returned by service
646 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
647 label.parsing_errors = Parsing errors
648 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
649 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
650 label.input_parameter_name = Input Parameter name
651 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
652 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
653 label.brief_description_service = Brief description of service
654 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
655 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
656 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
657 label.gap_character = Gap character
658 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
659 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
660 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
661 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
662 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
663 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
664 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
665 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
666 label.input_output = Input/Output
667 label.cut_paste = Cut'n'Paste
668 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
669 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
670 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
671 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
672 label.from_file = From File
673 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
674 label.text_colour = Text Colour...
675 label.structure = Structure
676 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
677 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
678 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
679 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
680 label.sequence_name = Sequence Name
681 label.sequence_description = Sequence Description
682 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
683 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
684 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
685 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
686 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
687 label.web_browser_not_found = Web browser not found
688 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
689 label.html = HTML
690 label.wrap = Wrap
691 label.show_database_refs = Show Database Refs
692 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
693 label.save_png_image = Save As PNG Image
694 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
695 label.export_image = Export Image
696 label.vamsas_store = VAMSAS store
697 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
698 label.reverse = Reverse
699 label.reverse_complement = Reverse Complement
700 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
701 label.extract_scores = Extract Scores
702 label.get_cross_refs = Get Cross-References
703 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
704 label.add_sequences = Add Sequences
705 label.new_window = New Window
706 label.split_window = Split Window
707 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
708 label.use_registry = Use Registry
709 label.add_local_source = Add Local Source
710 label.set_as_default = Set as Default
711 label.show_labels = Show labels
712 action.background_colour = Background Colour...
713 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
714 label.jalview_pca_calculation = Jalview PCA Calculation
715 label.link_name = Link Name
716 label.pdb_file = PDB file
717 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
718 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
719 label.superpose_structures = Superpose Structures
720 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
721 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
722 label.jmol = Jmol
723 label.chimera = Chimera
724 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
725 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
726 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
727 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
728 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
729 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
730 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
731 label.case_sensitive = Case Sensitive
732 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
733 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
734 label.index_by_host = Index by Host
735 label.index_by_type = Index by Type
736 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
737 label.display_warnings = Display Warnings
738 label.move_url_up = Move URL Up
739 label.move_url_down = Move URL Down
740 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
741 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
742 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
743 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
744 label.sequences_updated = Sequences updated
745 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
746 label.show_all_chains = Show all chains
747 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
748 label.paste_new_window = Paste To New Window
749 label.settings_for_param = Settings for {0}
750 label.view_params = View {0}
751 label.aacon_calculations = AACon Calculations
752 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
753 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
754 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
755 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
756 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
757 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
758 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
759 label.all_views = All Views
760 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
761 label.realign_with_params = Realign with {0}
762 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
763 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
764 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
765 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
766 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
767 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
768 label.view_documentation = View documentation
769 label.select_return_type = Select return type
770 label.translation_of_params = Translation of {0}
771 label.features_for_params = Features for - {0}
772 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
773 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
774 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
775 label.varna_params = VARNA - {0}
776 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
777 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
778 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
779 label.points_for_params = Points for {0}
780 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
781 label.graduated_color_for_params = Graduated Feature Colour for {0}
782 label.select_background_colour = Select Background Colour
783 label.invalid_font = Invalid Font
784 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
785 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
786 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
787 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
788 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
789 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
790 label.example_query_param = Example query: {0}
791 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
792 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
793 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
794 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
795 label.select_columns_containing = Select columns containing
796 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
797 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
798 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
799 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
800 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
801 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
802 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
803 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
804 label.use_sequence_id_4 = 
805 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
806 label.switch_server = Switch server
807 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
808 label.services_at = Services at {0}
809 label.rest_client_submit = {0} using {1}
810 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
811 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
812 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
813 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
814 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
815 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
816 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
817 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
818 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
819 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
820 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
821 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
822 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
823 label.user_preset = User Preset
824 label.service_preset = Service Preset
825 label.run_with_preset = Run {0} with preset
826 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
827 action.by_title_param = By {0}
828 label.source_from_db_source = Sources from {0}
829 label.from_msname = from {0}
830 label.superpose_with = Superpose with
831 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
832 label.add_new_row = Add New Row
833 label.edit_label_description = Edit Label/Description
834 label.hide_row = Hide This Row
835 label.delete_row = Delete This Row
836 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
837 label.export_annotation = Export Annotation
838 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
839 label.helix = Helix
840 label.sheet = Sheet
841 label.rna_helix = RNA Helix
842 label.remove_annotation = Remove Annotation
843 label.colour_by = Colour by...
844 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
845 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
846 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
847 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
848 label.multiharmony = Multi-Harmony
849 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
850 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
851 label.prompt_each_time = Prompt each time
852 label.use_source = Use Source
853 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
854 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
855 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
856 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
857 label.pca_sequences_not_aligned = The sequences must be aligned before calculating PCA.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
858 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
859 label.invalid_name = Invalid name
860 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
861 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
862 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
863 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
864 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
865 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
866 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
867 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
868 label.feature_type = Feature Type
869 label.display = Display
870 label.service_url = Service URL
871 label.copied_sequences = Copied sequences
872 label.cut_sequences = Cut Sequences
873 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
874 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
875 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
876 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
877 label.save_features_to_file = Save Features to File
878 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
879 label.no_features_on_alignment = No features found on alignment
880 label.save_pdb_file = Save PDB File
881 label.save_text_to_file = Save Text to File
882 label.save_state = Save State
883 label.restore_state = Restore State
884 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
885 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
886 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
887 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
888 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
889 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
890 label.select_startup_file = Select startup file
891 label.select_default_browser = Select default web browser
892 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
893 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
894 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
895 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
896 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
897 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
898 label.save_as_html = Save as HTML
899 label.recently_opened = Recently Opened
900 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
901 label.tree_from = Tree from {0}
902 label.webservice_job_title = {0} using {1}
903 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
904 label.visible = Visible
905 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
906 label.visible_region_of = visible region of
907 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
908 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
909 label.loading_file = Loading File: {0}
910 label.edit_params = Edit {0}
911 error.not_implemented = Not implemented
912 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
913 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
914 error.implementation_error_sortbyfeature = Implementation Error - sortByFeature method must be one of FEATURE_SCORE, FEATURE_LABEL or FEATURE_DENSITY.
915 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
916 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
917 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
918 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
919 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
920 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
921 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
922 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
923 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
924 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
925 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
926 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
927 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
928 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
929 error.implementation_error = Implementation error
930 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
931 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
932 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
933 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
934 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
935 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
936 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
937 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
938 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
939 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
940 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
941 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
942 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
943 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
944 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
945 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
946 label.cancelled_params = Cancelled {0}
947 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
948 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
949 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
950 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
951 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
952 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
953 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
954 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
955 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
956 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
957 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
958 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
959 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
960 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
961 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
962 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
963 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
964 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
965 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
966 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
967 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
968 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
969 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
970 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
971 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
972 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
973 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
974 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
975 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
976 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
977 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
978 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
979 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
980 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
981 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
982 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
983 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
984 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
985 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
986 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
987 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
988 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
989 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
990 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
991 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
992 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
993 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
994 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
995 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
996 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
997 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
998 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
999 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
1000 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1001 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1002 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1003 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1004 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1005 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1006 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1007 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1008 label.toggled = Toggled
1009 label.marked = Marked
1010 label.containing = containing
1011 label.not_containing = not containing
1012 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1013 label.submission_params = Submission {0}
1014 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1015 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1016 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1017 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1018 label.pca_calculating = Calculating PCA
1019 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1020 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1021 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1022 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1023 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1024 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1025 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1026 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1027 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1028 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1029 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1030 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1031 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1032 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1033 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1034 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1035 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1036 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1037 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1038 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1039 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1040 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1041 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1042 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1043 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1044 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1045 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1046 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1047 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1048 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1049 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1050 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1051 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1052 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1053 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1054 label.mapped = mapped
1055 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1056 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1057 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1058 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1059 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1060 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1061 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1062 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1063 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1064 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1065 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1066 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1067 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1068 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1069 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1070 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1071 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1072 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1073 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1074 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1075 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1076 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1077 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1078 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1079 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1080 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1081 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1082 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1083 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1084 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1085 label.remove_gaps = Remove Gaps
1086 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1087 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1088 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1089 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1090 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1091 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1092 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1093 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1094 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1095 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1096 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1097 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1098 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1099 warn.service_not_supported = Service not supported!
1100 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1101 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1102 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1103 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1104 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1105 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1106 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1107 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1108 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1109 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1110 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1111 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1112 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1113 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1114 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1115 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1116 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1117 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1118 label.eps_file = EPS file
1119 label.png_image = PNG image
1120 status.saving_file = Saving {0}
1121 status.export_complete = {0} Export completed.
1122 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1123 status.refreshing_news = Refreshing news
1124 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1125 status.opening_params = Opening {0}
1126 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1127 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1128 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1129 status.finshed_querying = Finished querying
1130 status.parsing_results = Parsing results.
1131 status.processing = Processing...
1132 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1133 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1134 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1135 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1136 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1137 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1138 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1139 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1140 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1141 status.opening_file_for = opening file for
1142 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1143 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1144 label.font_too_small = Font size is too small
1145 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1146 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1147 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1148 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1149 label.out_of_memory = Out of memory
1150 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1151 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1152 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1153 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1154 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1155 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1156 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1157 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1158 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1159 label.test_server = Test Server?
1160 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1161 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1162 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1163 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1164 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1165 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1166 label.file_already_exists = File exists
1167 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1168 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1169 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1170 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1171 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1172 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1173 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1174 label.delete_all = Delete all sequences
1175 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1176 label.add_annotations_for = Add annotations for
1177 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1178 label.choose_annotations = Choose Annotations
1179 label.find = Find
1180 label.invalid_search = Search string invalid
1181 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1182 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1183 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1184 label.show_group_logo = Show Group Logo
1185 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1186 label.show_histogram = Show Histogram
1187 label.show_logo = Show Logo
1188 label.normalise_logo = Normalise Logo
1189 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1190 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1191 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1192 label.open_split_window = Open split window
1193 action.no = No
1194 action.yes = Yes
1195 label.for = for
1196 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1197 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1198 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1199 label.alpha_helix = Alpha Helix
1200 label.beta_strand = Beta Strand
1201 label.turn = Turn
1202 label.select_all = Select All
1203 label.structures_filter = Structures Filter
1204 label.search_filter = Search Filter
1205 label.include_description= Include Description
1206 action.back = Back
1207 label.hide_insertions = Hide Insertions
1208 label.mark_as_representative = Mark as representative
1209 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1210 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1211 label.result = result
1212 label.results = results
1213 label.structure_chooser = Structure Chooser
1214 label.select = Select : 
1215 label.invert = Invert 
1216 label.select_pdb_file = Select PDB File
1217 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1218 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1219 label.search_result = Search Result
1220 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1221 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1222 label.start_jalview = Start Jalview
1223 label.biojs_html_export = BioJS
1224 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1225 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1226 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1227 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1228 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1229 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1230 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1231 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1232 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1233 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1234 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1235 action.export_groups = Export Groups
1236 action.export_annotations = Export Annotations
1237 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1238 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1239 action.export_features = Export Features
1240 label.export_settings = Export Settings
1241 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1242 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1243 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1244 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1245 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1246 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1247 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1248 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1249 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1250 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1251 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1252 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1253 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1254 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1255 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1256 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1257 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1258 label.run_groovy = Run Groovy console script
1259 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1260 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1261 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1262 action.next_page= >> 
1263 action.prev_page= << 
1264 label.next_page_tooltip=Next Page
1265 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1266 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1267 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1268 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1269 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1270 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1271 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1272 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1273 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1274 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1275 label.column = Column
1276 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1277 label.operation_failed = Operation failed
1278 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1279 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1280 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1281 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1282 exception.url_cannot_have_miriam_id = {0} is a MIRIAM id and cannot be used as a custom url name
1283 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1284 label.filter = Filter text:
1285 action.customfilter = Custom only
1286 action.showall = Show All
1287 label.insert = Insert:
1288 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1289 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1290 label.primary = Double Click
1291 label.inmenu = In Menu
1292 label.id = ID
1293 label.database = Database
1294 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1295 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1296 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1297 label.invalid_name = Invalid Name !
1298 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1299 label.urllinks = Links