JAL-1632 compare size of input against minimums for calculation and enable/disable...
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.quit = Quit
34 action.expand_views = Expand Views
35 action.gather_views = Gather Views
36 action.page_setup = Page Setup...
37 action.reload = Reload
38 action.load = Load
39 action.open = Open
40 action.cancel = Cancel
41 action.create = Create
42 action.update = Update
43 action.delete = Delete
44 action.clear = Clear
45 action.accept = Accept
46 action.select_ddbb = --- Select Database ---
47 action.undo = Undo
48 action.redo = Redo
49 action.reset = Reset
50 action.remove_left = Remove left
51 action.remove_right = Remove right
52 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
53 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
54 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
55 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
56 action.boxes = Boxes
57 action.text = Text
58 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
59 action.by_id = By Id
60 action.by_length = By Length
61 action.by_group = By Group
62 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
63 action.set_as_reference = Set as Reference 
64 action.remove = Remove
65 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
66 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
67 action.user_defined = User Defined...
68 action.by_conservation = By Conservation
69 action.wrap = Wrap
70 action.show_gaps = Show Gaps
71 action.show_occupancy = Show Occupancy
72 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
73 action.find = Find
74 action.undefine_groups = Undefine Groups
75 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
76 action.copy = Copy
77 action.cut = Cut
78 action.font = Font...
79 action.scale_above = Scale Above
80 action.scale_left = Scale Left
81 action.scale_right = Scale Right
82 action.by_tree_order = By Tree Order
83 action.sort = Sort
84 action.calculate_tree = Calculate Tree...
85 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
86 action.help = Help
87 action.by_annotation = By Annotation...
88 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
89 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
90 action.show = Show
91 action.hide = Hide
92 action.ok = OK
93 action.set_defaults = Defaults
94 action.create_group = Create Group
95 action.remove_group = Remove Group
96 action.edit_group = Edit Group
97 action.border_colour = Border colour
98 action.edit_new_group = Edit New Group
99 action.hide_sequences = Hide Sequences
100 action.sequences = Sequences
101 action.ids = IDS
102 action.ids_sequences = IDS and sequences
103 action.reveal_all = Reveal All
104 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
105 action.find_all = Find all
106 action.find_next = Find next
107 action.file = File
108 action.view = View
109 action.annotations = Annotations
110 action.change_params = Change Parameters
111 action.apply = Apply
112 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
113 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
114 action.by_chain = By Chain
115 action.by_sequence = By Sequence
116 action.paste_annotations = Paste Annotations
117 action.format = Format
118 action.select = Select
119 action.new_view = New View
120 action.close = Close
121 action.add = Add
122 action.save_as_default = Save as default
123 action.save_as = Save as...
124 action.save = Save
125 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
126 action.change_font = Change Font
127 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
128 action.colour = Colour
129 action.calculate = Calculate
130 action.select_all = Select all
131 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
132 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
133 action.deselect_all = Deselect all
134 action.invert_selection = Invert selection
135 action.using_jmol = Using Jmol
136 action.link = Link
137 action.group_link = Group Link
138 action.show_chain = Show Chain
139 action.show_group = Show Group
140 action.fetch_db_references = Fetch DB References
141 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
142 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
143 label.structures_manager = Structures Manager
144 label.nickname = Nickname:
145 label.url = URL
146 label.url\: = URL:
147 label.input_file_url = Enter URL or Input File
148 label.select_feature = Select feature
149 label.name = Name
150 label.name\: = Name:
151 label.name_param = Name: {0}
152 label.group = Group
153 label.group\: = Group:
154 label.group_name = Group Name
155 label.group_description = Group Description
156 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
157 label.colour = Colour:
158 label.description = Description
159 label.description\: = Description:
160 label.start = Start:
161 label.end = End:
162 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
163 label.service_action = Service Action:
164 label.post_url = POST URL:
165 label.url_suffix = URL Suffix
166 label.sequence_source = Sequence Source
167 label.per_seq = per Sequence
168 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
169 label.amend = Amend
170 label.undo_command = Undo {0}
171 label.redo_command = Redo {0}
172 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
173 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
174 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
175 label.choose_calculation = Choose Calculation
176 label.treecalc_title = {0} Using {1}
177 label.tree_calc_av = Average Distance
178 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
179 label.select_score_model = Select score model
180 label.score_model_pid = % Identity
181 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
182 label.score_model_pam250 = PAM 250
183 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
184 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
185 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
186 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
187 label.status_bar = Status bar
188 label.out_to_textbox = Output to Textbox
189 label.occupancy = Occupancy
190 # delete Clustal - use FileFormat name instead
191 label.clustal = Clustal
192 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
193 label.colourScheme_clustal = Clustalx
194 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
195 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
196 label.colourScheme_zappo = Zappo
197 label.colourScheme_taylor = Taylor
198 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
199 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
200 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
201 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
202 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
203 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
204 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
205 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
206 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
207 label.blc = BLC
208 label.fasta = Fasta
209 label.msf = MSF
210 label.pfam = PFAM
211 label.pileup = Pileup
212 label.pir = PIR
213 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
214 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
215 label.show_annotations = Show annotations
216 label.hide_annotations = Hide annotations
217 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
218 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
219 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
220 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
221 label.hide_all = Hide all
222 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
223 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
224 label.colour_text = Colour Text
225 label.show_non_conserved = Show nonconserved
226 label.overview_window = Overview Window
227 label.none = None
228 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
229 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
230 label.nucleotide = Nucleotide
231 label.protein = Protein
232 label.nucleotides = Nucleotides
233 label.proteins = Proteins
234 label.to_new_alignment = To New Alignment
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236 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
237 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
238 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
239 label.input_from_textbox = Input from textbox
240 label.centre_column_labels = Centre column labels
241 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
242 label.documentation = Documentation
243 label.about = About...
244 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
245 action.feature_settings = Feature Settings...
246 label.feature_settings = Feature Settings
247 label.all_columns = All Columns
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249 label.selected_columns = Selected Columns 
250 label.selected_sequences = Selected Sequences
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252 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
253 label.selected_region = Selected Region
254 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
255 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
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257 label.group_consensus = Group Consensus
258 label.group_conservation = Group Conservation
259 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
260 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
261 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
262 label.apply_all_groups = Apply to all groups
263 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
264 label.show_first = Show first
265 label.show_last = Show last
266 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
267 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
268 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
269 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
270 label.structure_viewer = Default structure viewer
271 label.chimera_path = Path to Chimera program
272 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
273 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
274 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
275 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
276 label.min_colour = Minimum Colour
277 label.max_colour = Maximum Colour
278 label.use_original_colours = Use Original Colours
279 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
280 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
281 label.selection = Selection
282 label.group_colour = Group Colour
283 label.sequence = Sequence
284 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
285 label.min = Min:
286 label.max = Max:
287 label.colour_by_label = Colour by label
288 label.new_feature = New Feature
289 label.match_case = Match Case
290 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
291 label.labels = Labels
292 label.output_values = Output Values...
293 label.output_points = Output points...
294 label.output_transformed_points = Output transformed points
295 label.input_data = Input Data...
296 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
297 label.protein_matrix = Protein matrix
298 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
299 label.show_distances = Show distances
300 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
301 label.fit_to_window = Fit To Window
302 label.newick_format = Newick Format
303 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
304 label.colours = Colours
305 label.view_mapping = View Mapping
306 label.wireframe = Wireframe
307 label.depthcue = Depthcue
308 label.z_buffering = Z Buffering
309 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
310 label.all_chains_visible = All Chains Visible
311 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
312 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
313 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
314 label.removed_columns = Removed {0} columns.
315 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
316 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
317 label.order_by_params = Order by {0}
318 label.html_content = <html>{0}</html>
319 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
320 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
321 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
322 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
323 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
324 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
325 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
326 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
327 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
328 label.paste_your = Paste your
329 label.finished_searching = Finished searching
330 label.search_results= Search results {0} : {1}
331 label.found_match_for = Found match for {0}
332 label.font = Font:
333 label.size = Size:
334 label.style = Style:
335 label.calculating = Calculating....
336 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
337 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
338 label.set_this_label_text = set this label text
339 label.sequences_from = Sequences from {0}
340 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
341 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
342 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
343 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
344 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
345 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
346 label.source_to_target = {0} ... {1}
347 label.per_sequence_only= Per-sequence only
348 label.to_file = to File
349 label.to_textbox = to Textbox
350 label.jalview = Jalview
351 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
352 label.status = Status
353 label.channels = Channels
354 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
355 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
356 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
357 label.session_update = Session Update
358 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
359 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
360 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
361 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
362 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
363 label.groovy_console = Groovy Console...
364 label.lineart = Lineart
365 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
366 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
367 label.invert_selection = Invert Selection
368 label.optimise_order = Optimise Order
369 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
370 label.load_colours = Load Colours
371 label.save_colours = Save Colours
372 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
373 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
374 label.database_param = Database: {0}
375 label.example = Example
376 label.example_param = Example: {0}
377 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
378 label.file_format_not_specified = File format not specified
379 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
380 label.error_saving_file = Error Saving File
381 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
382 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
383 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
384 label.invalid_selection = Invalid Selection
385 label.principal_component_analysis_must_take_least_four_input_sequences = Principal component analysis must take\nat least 4 input sequences.
386 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
387 label.you_need_more_two_sequences_selected_build_tree = You need to have more than two sequences selected to build a tree!
388 label.you_need_more_than_n_sequences = You need to have more than {0} sequences
389 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
390 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
391 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
392 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
393 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
394 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
395 label.translation_failed = Translation Failed
396 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
397 label.implementation_error  = Implementation error:
398 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
399 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
400 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
401 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
402 label.view_name_original = Original
403 label.enter_view_name = Enter View Name
404 label.enter_label = Enter label
405 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
406 label.pdb_entry_is_already_displayed = {0} is already displayed.\nDo you want to re-use this viewer ?
407 label.map_sequences_to_visible_window = Map Sequences to Visible Window: {0}
408 label.add_pdbentry_to_view = Do you want to add {0} to the view called\n{1}\n
409 label.align_to_existing_structure_view = Align to existing structure view
410 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
411 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
412 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
413 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
414 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
415 label.error_parsing_text = Error parsing text
416 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
417 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
418 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
419 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
420 label.input_alignment = Input Alignment
421 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
422 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
423 label.couldnt_locate = Couldn't locate {0}
424 label.url_not_found = URL not found
425 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
426 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
427 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
428 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
429 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
430 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
431 label.invalid_url = Invalid URL !
432 label.error_loading_file = Error loading file
433 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
434 label.file_open_error = File open error
435 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
436 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
437 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
438 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
439 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
440 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
441 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
442 label.alignment_props = Alignment Properties
443 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
444 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
445 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
446 label.annotations = Annotations
447 label.structure_options = Structure Options
448 label.features = Features
449 label.overview_params = Overview {0}
450 label.paste_newick_file = Paste Newick file
451 label.load_tree_from_file = From File - 
452 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
453 label.selection_output_command = Selection output - {0}
454 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
455 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
456 label.pca_details = PCA details
457 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
458 label.user_defined_colours = User defined colours
459 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
460 label.jaview_build_date = Build date: {0}
461 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
462 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
463 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
464 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
465 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
466 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
467 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
468 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
469 label.right_click = Right click
470 label.to_add_annotation = to add annotation
471 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
472 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
473 label.label = Label
474 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
475 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
476 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
477 label.calculating_pca= Calculating PCA
478 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
479 label.jalview_applet = Jalview applet
480 label.loading_data = Loading data
481 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
482 label.calculating_tree = Calculating tree
483 label.state_queueing = queuing
484 label.state_running = running
485 label.state_completed = finished
486 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
487 label.state_job_error = job error!
488 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
489 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
490 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
491 label.structure_type = Structure type
492 label.settings_for_type = Settings for {0}
493 label.view_full_application = View in Full Application
494 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
495 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
496 label.export_features = Export Features...
497 label.export_annotations = Export Annotations...
498 label.to_upper_case = To Upper Case
499 label.to_lower_case = To Lower Case
500 label.toggle_case = Toggle Case
501 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
502 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
503 label.edit_sequence = Edit Sequence
504 label.edit_sequences = Edit Sequences
505 label.sequence_details = Sequence Details
506 label.jmol_help = Jmol Help
507 label.chimera_help = Chimera Help
508 label.close_viewer = Close Viewer
509 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
510 label.all = All
511 label.sort_by = Sort alignment by
512 label.sort_by_score = Sort by Score
513 label.sort_by_density = Sort by Density
514 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
515 label.sort_ann_by = Sort annotations by
516 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
517 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
518 label.reveal = Reveal
519 label.hide_columns = Hide Columns
520 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
521 label.load_tree_file = Load a tree file
522 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
523 label.standard_databases = Standard Databases
524 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
525 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
526 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
527 label.connect_to_session = Connect to session {0}
528 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
529 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
530 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
531 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
532 label.adjust_threshold = Adjust threshold
533 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
534 label.display_features_same_type_different_label_using_different_colour = Display features of the same type with a different label using a different colour. (e.g. domain features)
535 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
536 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
537 label.open_url_param = Open URL {0}
538 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
539 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
540 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
541 label.dark_colour = Dark Colour
542 label.light_colour = Light Colour
543 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
544 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
545 label.copy_format_from = Copy format from
546 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
547 label.select_all_views = Select all views
548 label.select_many_views = Select many views
549 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
550 label.open_local_file = Open local file
551 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
552 label.listen_for_selections = Listen for selections
553 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
554 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
555 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
556 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
557 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
558 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
559 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
560 label.no_services = <No Services>
561 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
562 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
563 label.connect_to = Connect to
564 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
565 label.from_url = from URL
566 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
567 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
568 label.from_textbox = from Textbox
569 label.window = Window
570 label.preferences = Preferences
571 label.tools = Tools
572 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
573 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
574 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
575 label.collect_garbage = Collect Garbage
576 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
577 label.show_java_console = Show Java Console
578 label.show_jalview_news = Show Jalview News
579 label.take_snapshot = Take snapshot
580 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
581 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
582 label.monospaced_font= Monospaced
583 label.quality = Quality
584 label.maximize_window = Maximize Window
585 label.conservation = Conservation
586 label.consensus = Consensus
587 label.histogram = Histogram
588 label.logo = Logo
589 label.non_positional_features = List Non-positional Features
590 label.database_references = List Database References
591 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
592 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
593 label.gap_symbol = Gap Symbol
594 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
595 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
596 label.address = Address
597 label.port = Port
598 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
599 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
600 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
601 label.check_for_latest_version = Check for latest version
602 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
603 label.use_proxy_server = Use a proxy server
604 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
605 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
606 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
607 label.smooth_font = Smooth Font
608 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
609 label.pad_gaps = Pad Gaps
610 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
611 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
612 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
613 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
614 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
615 label.right_align_ids = Right Align Ids
616 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
617 label.open_overview = Open Overview
618 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
619 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
620 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
621 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
622 label.visual = Visual
623 label.connections = Connections
624 label.output = Output
625 label.editing = Editing
626 label.das_settings = DAS Settings
627 label.web_services = Web Services
628 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
629 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
630 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
631 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
632 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
633 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
634 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
635 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
636 label.new_service_url = New Service URL
637 label.edit_service_url = Edit Service URL
638 label.delete_service_url = Delete Service URL
639 label.details = Details
640 label.options = Options
641 label.parameters = Parameters
642 label.available_das_sources = Available DAS Sources
643 label.full_details = Full Details
644 label.authority = Authority
645 label.type = Type
646 label.proxy_server = Proxy Server
647 label.file_output = File Output
648 label.select_input_type = Select input type
649 label.set_options_for_type = Set options for type
650 label.data_input_parameters = Data input parameters
651 label.data_returned_by_service = Data returned by service
652 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
653 label.parsing_errors = Parsing errors
654 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
655 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
656 label.input_parameter_name = Input Parameter name
657 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
658 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
659 label.brief_description_service = Brief description of service
660 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
661 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
662 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
663 label.gap_character = Gap character
664 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
665 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
666 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
667 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
668 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
669 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
670 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
671 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
672 label.input_output = Input/Output
673 label.cut_paste = Cut'n'Paste
674 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
675 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
676 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
677 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
678 label.from_file = From File
679 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
680 label.text_colour = Text Colour...
681 label.structure = Structure
682 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
683 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
684 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
685 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
686 label.sequence_name = Sequence Name
687 label.sequence_description = Sequence Description
688 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
689 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
690 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
691 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
692 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
693 label.web_browser_not_found = Web browser not found
694 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
695 label.html = HTML
696 label.wrap = Wrap
697 label.show_database_refs = Show Database Refs
698 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
699 label.save_png_image = Save As PNG Image
700 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
701 label.export_image = Export Image
702 label.vamsas_store = VAMSAS store
703 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
704 label.reverse = Reverse
705 label.reverse_complement = Reverse Complement
706 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
707 label.extract_scores = Extract Scores
708 label.get_cross_refs = Get Cross-References
709 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
710 label.add_sequences = Add Sequences
711 label.new_window = New Window
712 label.split_window = Split Window
713 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
714 label.use_registry = Use Registry
715 label.add_local_source = Add Local Source
716 label.set_as_default = Set as Default
717 label.show_labels = Show labels
718 action.background_colour = Background Colour...
719 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
720 label.link_name = Link Name
721 label.pdb_file = PDB file
722 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
723 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
724 label.superpose_structures = Superpose Structures
725 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
726 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
727 label.jmol = Jmol
728 label.chimera = Chimera
729 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
730 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
731 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
732 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
733 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
734 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
735 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
736 label.case_sensitive = Case Sensitive
737 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
738 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
739 label.index_by_host = Index by Host
740 label.index_by_type = Index by Type
741 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
742 label.display_warnings = Display Warnings
743 label.move_url_up = Move URL Up
744 label.move_url_down = Move URL Down
745 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
746 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
747 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
748 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
749 label.sequences_updated = Sequences updated
750 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
751 label.show_all_chains = Show all chains
752 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
753 label.paste_new_window = Paste To New Window
754 label.settings_for_param = Settings for {0}
755 label.view_params = View {0}
756 label.aacon_calculations = AACon Calculations
757 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
758 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
759 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
760 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
761 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
762 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
763 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
764 label.all_views = All Views
765 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
766 label.realign_with_params = Realign with {0}
767 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
768 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
769 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
770 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
771 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
772 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
773 label.view_documentation = View documentation
774 label.select_return_type = Select return type
775 label.translation_of_params = Translation of {0}
776 label.features_for_params = Features for - {0}
777 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
778 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
779 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
780 label.varna_params = VARNA - {0}
781 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
782 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
783 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
784 label.points_for_params = Points for {0}
785 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
786 label.graduated_color_for_params = Graduated Feature Colour for {0}
787 label.select_background_colour = Select Background Colour
788 label.invalid_font = Invalid Font
789 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
790 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
791 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
792 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
793 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
794 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
795 label.example_query_param = Example query: {0}
796 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
797 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
798 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
799 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
800 label.select_columns_containing = Select columns containing
801 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
802 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
803 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
804 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
805 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
806 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
807 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
808 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
809 label.use_sequence_id_4 = 
810 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
811 label.switch_server = Switch server
812 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
813 label.services_at = Services at {0}
814 label.rest_client_submit = {0} using {1}
815 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
816 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
817 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
818 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
819 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
820 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
821 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
822 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
823 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
824 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
825 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
826 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
827 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
828 label.user_preset = User Preset
829 label.service_preset = Service Preset
830 label.run_with_preset = Run {0} with preset
831 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
832 action.by_title_param = By {0}
833 label.source_from_db_source = Sources from {0}
834 label.from_msname = from {0}
835 label.superpose_with = Superpose with
836 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
837 label.add_new_row = Add New Row
838 label.edit_label_description = Edit Label/Description
839 label.hide_row = Hide This Row
840 label.delete_row = Delete This Row
841 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
842 label.export_annotation = Export Annotation
843 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
844 label.helix = Helix
845 label.sheet = Sheet
846 label.rna_helix = RNA Helix
847 label.remove_annotation = Remove Annotation
848 label.colour_by = Colour by...
849 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
850 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
851 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
852 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
853 label.multiharmony = Multi-Harmony
854 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
855 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
856 label.prompt_each_time = Prompt each time
857 label.use_source = Use Source
858 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
859 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
860 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
861 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
862 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
863 label.invalid_name = Invalid name
864 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
865 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
866 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
867 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
868 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
869 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
870 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
871 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
872 label.feature_type = Feature Type
873 label.display = Display
874 label.service_url = Service URL
875 label.copied_sequences = Copied sequences
876 label.cut_sequences = Cut Sequences
877 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
878 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
879 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
880 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
881 label.save_features_to_file = Save Features to File
882 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
883 label.no_features_on_alignment = No features found on alignment
884 label.save_pdb_file = Save PDB File
885 label.save_text_to_file = Save Text to File
886 label.save_state = Save State
887 label.restore_state = Restore State
888 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
889 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
890 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
891 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
892 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
893 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
894 label.select_startup_file = Select startup file
895 label.select_default_browser = Select default web browser
896 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
897 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
898 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
899 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
900 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
901 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
902 label.save_as_html = Save as HTML
903 label.recently_opened = Recently Opened
904 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
905 label.tree = Tree
906 label.tree_from = Tree from {0}
907 label.webservice_job_title = {0} using {1}
908 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
909 label.visible = Visible
910 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
911 label.visible_region_of = visible region of
912 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
913 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
914 label.loading_file = Loading File: {0}
915 label.edit_params = Edit {0}
916 label.as_percentage = As Percentage
917 error.not_implemented = Not implemented
918 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
919 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
920 error.implementation_error_sortbyfeature = Implementation Error - sortByFeature method must be one of FEATURE_SCORE, FEATURE_LABEL or FEATURE_DENSITY.
921 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
922 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
923 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
924 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
925 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
926 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
927 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
928 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
929 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
930 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
931 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
932 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
933 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
934 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
935 error.implementation_error = Implementation error
936 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
937 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
938 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
939 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
940 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
941 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
942 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
943 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
944 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
945 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
946 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
947 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
948 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
949 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
950 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
951 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
952 label.cancelled_params = Cancelled {0}
953 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
954 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
955 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
956 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
957 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
958 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
959 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
960 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
961 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
962 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
963 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
964 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
965 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
966 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
967 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
968 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
969 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
970 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
971 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
972 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
973 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
974 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
975 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
976 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
977 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
978 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
979 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
980 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
981 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
982 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
983 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
984 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
985 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
986 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
987 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
988 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
989 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
990 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
991 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
992 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
993 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
994 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
995 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
996 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
997 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
998 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
999 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
1000 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
1001 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
1002 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
1003 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
1004 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
1005 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
1006 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1007 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1008 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1009 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1010 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1011 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1012 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1013 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1014 label.toggled = Toggled
1015 label.marked = Marked
1016 label.containing = containing
1017 label.not_containing = not containing
1018 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1019 label.submission_params = Submission {0}
1020 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1021 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1022 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1023 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1024 label.pca_calculating = Calculating PCA
1025 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1026 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1027 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1028 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1029 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1030 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1031 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1032 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1033 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1034 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1035 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1036 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1037 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1038 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1039 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1040 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1041 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1042 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1043 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1044 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1045 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1046 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1047 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1048 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1049 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1050 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1051 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1052 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1053 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1054 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1055 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1056 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1057 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1058 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1059 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1060 label.mapped = mapped
1061 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1062 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1063 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1064 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1065 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1066 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1067 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1068 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1069 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1070 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1071 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1072 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1073 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1074 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1075 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1076 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1077 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1078 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1079 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1080 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1081 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1082 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1083 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1084 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1085 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1086 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1087 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1088 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1089 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1090 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1091 label.remove_gaps = Remove Gaps
1092 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1093 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1094 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1095 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1096 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1097 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1098 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1099 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1100 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1101 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1102 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1103 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1104 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1105 warn.service_not_supported = Service not supported!
1106 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1107 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1108 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1109 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1110 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1111 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1112 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1113 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1114 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1115 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1116 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1117 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1118 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1119 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1120 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1121 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1122 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1123 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1124 label.eps_file = EPS file
1125 label.png_image = PNG image
1126 status.saving_file = Saving {0}
1127 status.export_complete = {0} Export completed.
1128 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1129 status.refreshing_news = Refreshing news
1130 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1131 status.opening_params = Opening {0}
1132 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1133 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1134 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1135 status.finshed_querying = Finished querying
1136 status.parsing_results = Parsing results.
1137 status.processing = Processing...
1138 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1139 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1140 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1141 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1142 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1143 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1144 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1145 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1146 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1147 status.opening_file_for = opening file for
1148 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1149 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1150 label.font_too_small = Font size is too small
1151 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1152 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1153 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1154 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1155 label.out_of_memory = Out of memory
1156 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1157 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1158 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1159 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1160 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1161 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1162 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1163 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1164 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1165 label.test_server = Test Server?
1166 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1167 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1168 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1169 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1170 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1171 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1172 label.file_already_exists = File exists
1173 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1174 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1175 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1176 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1177 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1178 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1179 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1180 label.delete_all = Delete all sequences
1181 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1182 label.add_annotations_for = Add annotations for
1183 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1184 label.choose_annotations = Choose Annotations
1185 label.find = Find
1186 label.invalid_search = Search string invalid
1187 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1188 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1189 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1190 label.show_group_logo = Show Group Logo
1191 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1192 label.show_histogram = Show Histogram
1193 label.show_logo = Show Logo
1194 label.normalise_logo = Normalise Logo
1195 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1196 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1197 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1198 label.open_split_window = Open split window
1199 action.no = No
1200 action.yes = Yes
1201 label.for = for
1202 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1203 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1204 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1205 label.alpha_helix = Alpha Helix
1206 label.beta_strand = Beta Strand
1207 label.turn = Turn
1208 label.select_all = Select All
1209 label.structures_filter = Structures Filter
1210 label.search_filter = Search Filter
1211 label.include_description= Include Description
1212 action.back = Back
1213 label.hide_insertions = Hide Insertions
1214 label.mark_as_representative = Mark as representative
1215 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1216 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1217 label.result = result
1218 label.results = results
1219 label.structure_chooser = Structure Chooser
1220 label.select = Select : 
1221 label.invert = Invert 
1222 label.select_pdb_file = Select PDB File
1223 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1224 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1225 label.search_result = Search Result
1226 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1227 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1228 label.start_jalview = Start Jalview
1229 label.biojs_html_export = BioJS
1230 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1231 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1232 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1233 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1234 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1235 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1236 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1237 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1238 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1239 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1240 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1241 action.export_groups = Export Groups
1242 action.export_annotations = Export Annotations
1243 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1244 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1245 action.export_features = Export Features
1246 label.export_settings = Export Settings
1247 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1248 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1249 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1250 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1251 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1252 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1253 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1254 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1255 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1256 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1257 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1258 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1259 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1260 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1261 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1262 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1263 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1264 label.run_groovy = Run Groovy console script
1265 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1266 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1267 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1268 action.next_page= >> 
1269 action.prev_page= << 
1270 label.next_page_tooltip=Next Page
1271 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1272 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1273 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1274 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1275 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1276 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1277 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1278 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1279 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1280 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1281 label.column = Column
1282 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1283 label.operation_failed = Operation failed
1284 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1285 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1286 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1287 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1288 exception.url_cannot_have_miriam_id = {0} is a MIRIAM id and cannot be used as a custom url name
1289 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1290 label.filter = Filter text:
1291 action.customfilter = Custom only
1292 action.showall = Show All
1293 label.insert = Insert:
1294 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1295 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1296 label.primary = Double Click
1297 label.inmenu = In Menu
1298 label.id = ID
1299 label.database = Database
1300 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1301 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1302 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1303 label.invalid_name = Invalid Name !
1304 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1305 label.urllinks = Links