src/ext/edu/ucsf/rbvi/strucviz2/StructureSettings.java

   1 /* vim: set ts=2: */
   2 /**
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  29  * OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE,
  30  * EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
  31  *
  32  */
  33 package ext.edu.ucsf.rbvi.strucviz2;
  34
  35 /**
  36  * This object maintains the relationship between Chimera objects and Cytoscape
  37  * objects.
  38  */
  39 public class StructureSettings
  40 {
  41
  42   // @Tunable(description = "Path to UCSF Chimera application", gravity = 4.0)
  43   public String chimeraPath = null;
  44
  45   public StructureSettings(StructureManager manager)
  46   {
  47
  48     chimeraPath = manager.getCurrentChimeraPath(null);
  49
  50     // This seems a little strange, but it has to do with the order of tunable
  51     // interceptor
  52     // handling. We need to set these selectors in our structure manager and
  53     // dynamically
  54     // pull the data out as needed....
  55     manager.setStructureSettings(this);
  56   }
  57
  58   public String getChimeraPath()
  59   {
  60     return chimeraPath;
  61   }
  62 }