src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.schemes.*;\r
  29 \r
  30 public class UserDefinedColours\r
  31     extends Panel implements ActionListener, AdjustmentListener\r
  32 {\r
  33 \r
  34   AlignmentPanel ap;\r
  35   SequenceGroup seqGroup;\r
  36   Button selectedButton;\r
  37   Vector oldColours = new Vector();\r
  38   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  39   Frame frame;\r
  40   MCview.AppletPDBCanvas pdbcanvas;\r
  41 \r
  42   Component caller;\r
  43   String originalLabel;\r
  44   Color originalColour;\r
  45 \r
  46   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  47 \r
  48   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  49   {\r
  50     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  51     return null;\r
  52   }\r
  53 \r
  54   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  55   {\r
  56     this.ap = ap;\r
  57     seqGroup = sg;\r
  58 \r
  59     if (seqGroup != null)\r
  60     {\r
  61       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  62     }\r
  63     else\r
  64     {\r
  65       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  66     }\r
  67 \r
  68     init();\r
  69   }\r
  70 \r
  71   public UserDefinedColours(MCview.AppletPDBCanvas pdb)\r
  72   {\r
  73     this.pdbcanvas = pdb;\r
  74     init();\r
  75   }\r
  76 \r
  77   public UserDefinedColours(Component caller,\r
  78                             String label,\r
  79                             Color colour)\r
  80   {\r
  81     this.caller = caller;\r
  82     originalColour = colour;\r
  83     originalLabel = label;\r
  84     init();\r
  85     remove(buttonPanel);\r
  86 \r
  87     setTargetColour(colour);\r
  88 \r
  89     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 113, 400, 35));\r
  90     frame.setTitle("User Defined Colours - " + label);\r
  91     frame.setSize(420, 200);\r
  92   }\r
  93 \r
  94   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  95   {\r
  96     if (evt.getSource() == okButton)\r
  97     {\r
  98       okButton_actionPerformed();\r
  99     }\r
 100     else if (evt.getSource() == applyButton)\r
 101     {\r
 102       applyButton_actionPerformed();\r
 103     }\r
 104     else if (evt.getSource() == cancelButton)\r
 105     {\r
 106       cancelButton_actionPerformed();\r
 107     }\r
 108     else if (evt.getSource() == rText)\r
 109     {\r
 110       rText_actionPerformed();\r
 111     }\r
 112     else if (evt.getSource() == gText)\r
 113     {\r
 114       gText_actionPerformed();\r
 115     }\r
 116     else if (evt.getSource() == bText)\r
 117     {\r
 118       bText_actionPerformed();\r
 119     }\r
 120   }\r
 121 \r
 122   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 123   {\r
 124     if (evt.getSource() == rScroller)\r
 125     {\r
 126       rScroller_adjustmentValueChanged();\r
 127     }\r
 128     else if (evt.getSource() == gScroller)\r
 129     {\r
 130       gScroller_adjustmentValueChanged();\r
 131     }\r
 132     else if (evt.getSource() == bScroller)\r
 133     {\r
 134       bScroller_adjustmentValueChanged();\r
 135     }\r
 136   }\r
 137 \r
 138   void init()\r
 139   {\r
 140     try\r
 141     {\r
 142       jbInit();\r
 143     }\r
 144     catch (Exception e)\r
 145     {\r
 146       e.printStackTrace();\r
 147     }\r
 148     frame = new Frame();\r
 149     frame.add(this);\r
 150     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
 151 \r
 152     if (seqGroup != null)\r
 153     {\r
 154       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + seqGroup.getName() + ")");\r
 155     }\r
 156 \r
 157     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
 158     {\r
 159       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
 160                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
 161     }\r
 162 \r
 163     makeButton("B", "B");\r
 164     makeButton("Z", "Z");\r
 165     makeButton("X", "X");\r
 166     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
 167 \r
 168     validate();\r
 169   }\r
 170 \r
 171   protected void rText_actionPerformed()\r
 172   {\r
 173     try\r
 174     {\r
 175       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
 176       rScroller.setValue(i);\r
 177       rScroller_adjustmentValueChanged();\r
 178     }\r
 179     catch (NumberFormatException ex)\r
 180     {}\r
 181   }\r
 182 \r
 183   protected void gText_actionPerformed()\r
 184   {\r
 185     try\r
 186     {\r
 187       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 188       gScroller.setValue(i);\r
 189       gScroller_adjustmentValueChanged();\r
 190     }\r
 191     catch (NumberFormatException ex)\r
 192     {}\r
 193 \r
 194   }\r
 195 \r
 196   protected void bText_actionPerformed()\r
 197   {\r
 198     try\r
 199     {\r
 200       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 201       bScroller.setValue(i);\r
 202       bScroller_adjustmentValueChanged();\r
 203     }\r
 204     catch (NumberFormatException ex)\r
 205     {}\r
 206 \r
 207   }\r
 208 \r
 209   protected void rScroller_adjustmentValueChanged()\r
 210   {\r
 211     R = rScroller.getValue();\r
 212     rText.setText(R + "");\r
 213     colourChanged();\r
 214   }\r
 215 \r
 216   protected void gScroller_adjustmentValueChanged()\r
 217   {\r
 218     G = gScroller.getValue();\r
 219     gText.setText(G + "");\r
 220     colourChanged();\r
 221   }\r
 222 \r
 223   protected void bScroller_adjustmentValueChanged()\r
 224   {\r
 225     B = bScroller.getValue();\r
 226     bText.setText(B + "");\r
 227     colourChanged();\r
 228   }\r
 229 \r
 230   public void colourChanged()\r
 231   {\r
 232     Color col = new Color(R, G, B);\r
 233     target.setBackground(col);\r
 234     target.repaint();\r
 235 \r
 236     if (selectedButton != null)\r
 237     {\r
 238       selectedButton.setBackground(col);\r
 239       selectedButton.repaint();\r
 240     }\r
 241   }\r
 242 \r
 243   void setTargetColour(Color col)\r
 244   {\r
 245     R = col.getRed();\r
 246     G = col.getGreen();\r
 247     B = col.getBlue();\r
 248     rScroller.setValue(R);\r
 249     gScroller.setValue(G);\r
 250     bScroller.setValue(B);\r
 251     rText.setText(R + "");\r
 252     gText.setText(G + "");\r
 253     bText.setText(B + "");\r
 254     colourChanged();\r
 255   }\r
 256 \r
 257   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 258   {\r
 259     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 260     setTargetColour(selectedButton.getBackground());\r
 261   }\r
 262 \r
 263   void makeButton(String label, String aa)\r
 264   {\r
 265     final Button button = new Button();\r
 266     Color col = Color.white;\r
 267 \r
 268     try\r
 269     {\r
 270       col = oldColourScheme.findColour(aa.charAt(0), -1);\r
 271     }\r
 272     catch (Exception ex)\r
 273     {}\r
 274 \r
 275     button.setBackground(col);\r
 276     oldColours.addElement(col);\r
 277     button.setLabel(label);\r
 278     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 279     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 280     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 281     {\r
 282       public void mousePressed(MouseEvent e)\r
 283       {\r
 284         colourButtonPressed(e);\r
 285       }\r
 286     });\r
 287 \r
 288     buttonPanel.add(button, null);\r
 289   }\r
 290 \r
 291   protected void okButton_actionPerformed()\r
 292   {\r
 293     applyButton_actionPerformed();\r
 294     frame.setVisible(false);\r
 295   }\r
 296 \r
 297   protected void applyButton_actionPerformed()\r
 298   {\r
 299     if (caller != null)\r
 300     {\r
 301       if (caller instanceof FeatureSettings)\r
 302       {\r
 303         ( (FeatureSettings) caller).setUserColour\r
 304             (originalLabel, new Color(R, G, B));\r
 305       }\r
 306       else if (caller instanceof AnnotationColourChooser)\r
 307       {\r
 308         if (originalLabel.equals("Min Colour"))\r
 309         {\r
 310           ( (AnnotationColourChooser) caller).minColour_actionPerformed\r
 311               (new Color(R, G, B));\r
 312         }\r
 313         else\r
 314         {\r
 315           ( (AnnotationColourChooser) caller).maxColour_actionPerformed\r
 316               (new Color(R, G, B));\r
 317         }\r
 318       }\r
 319       return;\r
 320     }\r
 321 \r
 322     Color[] newColours = new Color[24];\r
 323     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 324     {\r
 325       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 326       newColours[i] = button.getBackground();\r
 327     }\r
 328 \r
 329     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 330     if (ap != null)\r
 331     {\r
 332       ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 333     }\r
 334 \r
 335     if (ap != null)\r
 336     {\r
 337       if (seqGroup != null)\r
 338       {\r
 339         seqGroup.cs = ucs;\r
 340       }\r
 341       else\r
 342       {\r
 343         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 344       }\r
 345       ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 346       ap.repaint();\r
 347     }\r
 348     else if (pdbcanvas != null)\r
 349     {\r
 350       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 351       pdbcanvas.updateSeqColours();\r
 352     }\r
 353   }\r
 354 \r
 355   protected void cancelButton_actionPerformed()\r
 356   {\r
 357     if (caller != null)\r
 358     {\r
 359       if (caller instanceof FeatureSettings)\r
 360       {\r
 361         ( (FeatureSettings) caller).setUserColour\r
 362             (originalLabel, originalColour);\r
 363       }\r
 364       else if (caller instanceof AnnotationColourChooser)\r
 365       {\r
 366         if (originalLabel.equals("Min Colour"))\r
 367         {\r
 368           ( (AnnotationColourChooser) caller).minColour_actionPerformed\r
 369               (originalColour);\r
 370         }\r
 371         else\r
 372         {\r
 373           ( (AnnotationColourChooser) caller).maxColour_actionPerformed\r
 374               (originalColour);\r
 375         }\r
 376       }\r
 377       frame.setVisible(false);\r
 378       return;\r
 379     }\r
 380 \r
 381     Color[] newColours = new Color[24];\r
 382     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 383     {\r
 384       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 385       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 386     }\r
 387 \r
 388     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 389 \r
 390     if (ap != null)\r
 391     {\r
 392       if (seqGroup != null)\r
 393       {\r
 394         seqGroup.cs = ucs;\r
 395       }\r
 396       else\r
 397       {\r
 398         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 399       }\r
 400       ap.repaint();\r
 401     }\r
 402     else if (pdbcanvas != null)\r
 403     {\r
 404       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 405     }\r
 406 \r
 407     frame.setVisible(false);\r
 408   }\r
 409 \r
 410   protected Panel buttonPanel = new Panel();\r
 411   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();\r
 412   Panel okcancelPanel = new Panel();\r
 413   protected Button okButton = new Button();\r
 414   protected Button applyButton = new Button();\r
 415   protected Button cancelButton = new Button();\r
 416   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();\r
 417   Label label1 = new Label();\r
 418   protected TextField rText = new TextField();\r
 419   Label label4 = new Label();\r
 420   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();\r
 421   protected TextField gText = new TextField();\r
 422   Label label5 = new Label();\r
 423   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();\r
 424   protected TextField bText = new TextField();\r
 425   protected Panel target = new Panel();\r
 426 \r
 427   private void jbInit()\r
 428       throws Exception\r
 429   {\r
 430     this.setLayout(null);\r
 431     buttonPanel.setLayout(gridLayout);\r
 432     gridLayout.setColumns(6);\r
 433     gridLayout.setRows(4);\r
 434     okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 435     okButton.setLabel("OK");\r
 436     okButton.addActionListener(this);\r
 437     applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 438     applyButton.setLabel("Apply");\r
 439     applyButton.addActionListener(this);\r
 440     cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 441     cancelButton.setLabel("Cancel");\r
 442     cancelButton.addActionListener(this);\r
 443     this.setBackground(new Color(212, 208, 223));\r
 444     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));\r
 445     buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));\r
 446     rScroller.setMaximum(256);\r
 447     rScroller.setMinimum(0);\r
 448     rScroller.setOrientation(0);\r
 449     rScroller.setUnitIncrement(1);\r
 450     rScroller.setVisibleAmount(1);\r
 451     rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));\r
 452     rScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 453     label1.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 454     label1.setText("R");\r
 455     label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));\r
 456     rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 457     rText.setText("0        ");\r
 458     rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));\r
 459     rText.addActionListener(this);\r
 460     label4.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 461     label4.setText("G");\r
 462     label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));\r
 463     gScroller.setMaximum(256);\r
 464     gScroller.setMinimum(0);\r
 465     gScroller.setOrientation(0);\r
 466     gScroller.setUnitIncrement(1);\r
 467     gScroller.setVisibleAmount(1);\r
 468     gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));\r
 469     gScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 470     gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 471     gText.setText("0        ");\r
 472     gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));\r
 473     gText.addActionListener(this);\r
 474     label5.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 475     label5.setText("B");\r
 476     label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));\r
 477     bScroller.setMaximum(256);\r
 478     bScroller.setMinimum(0);\r
 479     bScroller.setOrientation(0);\r
 480     bScroller.setUnitIncrement(1);\r
 481     bScroller.setVisibleAmount(1);\r
 482     bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));\r
 483     bScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 484     bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 485     bText.setText("0        ");\r
 486     bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));\r
 487     bText.addActionListener(this);\r
 488     target.setBackground(Color.black);\r
 489     target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));\r
 490     this.add(okcancelPanel, null);\r
 491     okcancelPanel.add(okButton, null);\r
 492     okcancelPanel.add(applyButton, null);\r
 493     okcancelPanel.add(cancelButton, null);\r
 494     this.add(buttonPanel, null);\r
 495     this.add(target, null);\r
 496     this.add(gScroller);\r
 497     this.add(rScroller);\r
 498     this.add(bScroller);\r
 499     this.add(label5);\r
 500     this.add(label4);\r
 501     this.add(label1);\r
 502     this.add(gText);\r
 503     this.add(rText);\r
 504     this.add(bText);\r
 505   }\r
 506 \r
 507 }\r