src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.schemes.*;\r
  29 \r
  30 public class UserDefinedColours\r
  31     extends Panel\r
  32 {\r
  33 \r
  34   AlignmentPanel ap;\r
  35   SequenceGroup seqGroup;\r
  36   Button selectedButton;\r
  37   Vector oldColours = new Vector();\r
  38   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  39   Frame frame;\r
  40 \r
  41   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  42 \r
  43   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  44   {\r
  45     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  46     return null;\r
  47   }\r
  48 \r
  49   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  50   {\r
  51     try {\r
  52         jbInit();\r
  53     } catch (Exception e) {\r
  54         e.printStackTrace();\r
  55       }\r
  56     frame = new Frame();\r
  57     frame.add(this);\r
  58     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
  59 \r
  60     if (sg != null)\r
  61     {\r
  62       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + sg.getName() + ")");\r
  63     }\r
  64 \r
  65     this.ap = ap;\r
  66     seqGroup = sg;\r
  67 \r
  68     if (seqGroup != null)\r
  69     {\r
  70       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  71     }\r
  72     else\r
  73     {\r
  74       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  75     }\r
  76 \r
  77     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  78     {\r
  79       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  80                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  81     }\r
  82 \r
  83     makeButton("B", "B");\r
  84     makeButton("Z", "Z");\r
  85     makeButton("X", "X");\r
  86     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
  87 \r
  88     validate();\r
  89 \r
  90   }\r
  91 \r
  92   protected void rText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
  93   {\r
  94     try\r
  95     {\r
  96       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
  97       rScroller.setValue(i);\r
  98       rScroller_adjustmentValueChanged(null);\r
  99     }\r
 100     catch (NumberFormatException ex)\r
 101     {}\r
 102   }\r
 103 \r
 104   protected void gText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 105   {\r
 106     try\r
 107     {\r
 108       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 109       gScroller.setValue(i);\r
 110       gScroller_adjustmentValueChanged(null);\r
 111     }\r
 112     catch (NumberFormatException ex)\r
 113     {}\r
 114 \r
 115   }\r
 116 \r
 117   protected void bText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 118   {\r
 119     try\r
 120     {\r
 121       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 122       bScroller.setValue(i);\r
 123       bScroller_adjustmentValueChanged(null);\r
 124     }\r
 125     catch (NumberFormatException ex)\r
 126     {}\r
 127 \r
 128   }\r
 129 \r
 130   protected void rScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 131   {\r
 132     R = rScroller.getValue();\r
 133     rText.setText(R + "");\r
 134     colourChanged();\r
 135   }\r
 136 \r
 137   protected void gScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 138   {\r
 139     G = gScroller.getValue();\r
 140     gText.setText(G + "");\r
 141     colourChanged();\r
 142   }\r
 143 \r
 144   protected void bScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 145   {\r
 146     B = bScroller.getValue();\r
 147     bText.setText(B + "");\r
 148     colourChanged();\r
 149   }\r
 150 \r
 151   public void colourChanged()\r
 152   {\r
 153     Color col = new Color(R, G, B);\r
 154     target.setBackground(col);\r
 155     target.repaint();\r
 156 \r
 157     if (selectedButton != null)\r
 158     {\r
 159       selectedButton.setBackground(col);\r
 160       selectedButton.repaint();\r
 161     }\r
 162   }\r
 163 \r
 164   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 165   {\r
 166     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 167     Color col = selectedButton.getBackground();\r
 168     R = col.getRed();\r
 169     G = col.getGreen();\r
 170     B = col.getBlue();\r
 171     rScroller.setValue(R);\r
 172     gScroller.setValue(G);\r
 173     bScroller.setValue(B);\r
 174     rText.setText(R + "");\r
 175     gText.setText(G + "");\r
 176     bText.setText(B + "");\r
 177 \r
 178     colourChanged();\r
 179   }\r
 180 \r
 181   void makeButton(String label, String aa)\r
 182   {\r
 183     final Button button = new Button();\r
 184     Color col = Color.white;\r
 185 \r
 186     try\r
 187     {\r
 188       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 189     }\r
 190     catch (Exception ex)\r
 191     {}\r
 192 \r
 193     button.setBackground(col);\r
 194     oldColours.addElement(col);\r
 195     button.setLabel(label);\r
 196     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 197     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 198     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 199     {\r
 200       public void mousePressed(MouseEvent e)\r
 201       {\r
 202         colourButtonPressed(e);\r
 203       }\r
 204     });\r
 205 \r
 206     buttonPanel.add(button, null);\r
 207   }\r
 208 \r
 209   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 210   {\r
 211     applyButton_actionPerformed(null);\r
 212     frame.setVisible(false);\r
 213   }\r
 214 \r
 215   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 216   {\r
 217 \r
 218     Color[] newColours = new Color[24];\r
 219     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 220     {\r
 221       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 222       newColours[i] = button.getBackground();\r
 223     }\r
 224 \r
 225     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 226     ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 227 \r
 228     if (seqGroup != null)\r
 229     {\r
 230       seqGroup.cs = ucs;\r
 231     }\r
 232     else\r
 233     {\r
 234       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 235     }\r
 236 \r
 237     ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 238     ap.repaint();\r
 239   }\r
 240 \r
 241 \r
 242   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 243   {\r
 244 \r
 245     Color[] newColours = new Color[24];\r
 246     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 247     {\r
 248       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 249       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 250     }\r
 251 \r
 252     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 253 \r
 254     if (seqGroup != null)\r
 255     {\r
 256       seqGroup.cs = ucs;\r
 257     }\r
 258     else\r
 259     {\r
 260       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 261     }\r
 262 \r
 263     ap.repaint();\r
 264 \r
 265     frame.setVisible(false);\r
 266   }\r
 267 \r
 268 \r
 269   protected Panel buttonPanel = new Panel();\r
 270   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();\r
 271   Panel jPanel2 = new Panel();\r
 272   protected Button okButton = new Button();\r
 273   protected Button applyButton = new Button();\r
 274   protected Button cancelButton = new Button();\r
 275   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();\r
 276   Label label1 = new Label();\r
 277   protected TextField rText = new TextField();\r
 278   Label label4 = new Label();\r
 279   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();\r
 280   protected TextField gText = new TextField();\r
 281   Label label5 = new Label();\r
 282   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();\r
 283   protected TextField bText = new TextField();\r
 284   protected Panel target = new Panel();\r
 285 \r
 286   private void jbInit() throws Exception {\r
 287       this.setLayout(null);\r
 288       buttonPanel.setLayout(gridLayout);\r
 289       gridLayout.setColumns(6);\r
 290       gridLayout.setRows(4);\r
 291       okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 292       okButton.setLabel("OK");\r
 293       okButton.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 294               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 295                   okButton_actionPerformed(e);\r
 296               }\r
 297           });\r
 298       applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 299       applyButton.setLabel("Apply");\r
 300       applyButton.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 301               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 302                   applyButton_actionPerformed(e);\r
 303               }\r
 304           });\r
 305       cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 306       cancelButton.setLabel("Cancel");\r
 307       cancelButton.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 308               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 309                   cancelButton_actionPerformed(e);\r
 310               }\r
 311           });\r
 312       this.setBackground(new Color(212, 208, 223));\r
 313       jPanel2.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));\r
 314       buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));\r
 315       rScroller.setMaximum(256);\r
 316       rScroller.setMinimum(0);\r
 317       rScroller.setOrientation(0);\r
 318       rScroller.setUnitIncrement(1);\r
 319   rScroller.setVisibleAmount(1);\r
 320   rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));\r
 321   rScroller.addAdjustmentListener(new java.awt.event.AdjustmentListener() {\r
 322               public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 323                   rScroller_adjustmentValueChanged(e);\r
 324               }\r
 325           });\r
 326   label1.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 327   label1.setText("R");\r
 328   label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));\r
 329   rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 330   rText.setText("0        ");\r
 331   rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));\r
 332   rText.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 333               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 334                   rText_actionPerformed(e);\r
 335               }\r
 336           });\r
 337   label4.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 338   label4.setText("G");\r
 339   label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));\r
 340   gScroller.setMaximum(256);\r
 341       gScroller.setMinimum(0);\r
 342       gScroller.setOrientation(0);\r
 343       gScroller.setUnitIncrement(1);\r
 344   gScroller.setVisibleAmount(1);\r
 345   gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));\r
 346   gScroller.addAdjustmentListener(new java.awt.event.AdjustmentListener() {\r
 347               public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 348                   gScroller_adjustmentValueChanged(e);\r
 349               }\r
 350           });\r
 351   gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 352   gText.setText("0        ");\r
 353   gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));\r
 354   gText.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 355               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 356                   gText_actionPerformed(e);\r
 357               }\r
 358           });\r
 359   label5.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 360   label5.setText("B");\r
 361   label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));\r
 362   bScroller.setMaximum(256);\r
 363       bScroller.setMinimum(0);\r
 364       bScroller.setOrientation(0);\r
 365       bScroller.setUnitIncrement(1);\r
 366   bScroller.setVisibleAmount(1);\r
 367   bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));\r
 368   bScroller.addAdjustmentListener(new java.awt.event.AdjustmentListener() {\r
 369               public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 370                   bScroller_adjustmentValueChanged(e);\r
 371               }\r
 372           });\r
 373   bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 374   bText.setText("0        ");\r
 375   bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));\r
 376   bText.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 377               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 378                   bText_actionPerformed(e);\r
 379               }\r
 380           });\r
 381   target.setBackground(Color.black);\r
 382       target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));\r
 383       this.add(jPanel2, null);\r
 384       jPanel2.add(okButton, null);\r
 385       jPanel2.add(applyButton, null);\r
 386       jPanel2.add(cancelButton, null);\r
 387       this.add(buttonPanel, null);\r
 388   this.add(target, null);\r
 389   this.add(gScroller);\r
 390   this.add(rScroller);\r
 391   this.add(bScroller);\r
 392   this.add(label5);\r
 393   this.add(label4);\r
 394   this.add(label1);\r
 395   this.add(gText);\r
 396   this.add(rText);\r
 397   this.add(bText);\r
 398 }\r
 399 \r
 400 }\r