src/jalview/bin/Jalview.java

   1 /********************\r
   2  * 2004 Jalview Reengineered\r
   3  * Barton Group\r
   4  * Dundee University\r
   5  *\r
   6  * AM Waterhouse\r
   7  *******************/\r
   8 \r
   9 \r
  10 package jalview.bin;\r
  11 \r
  12 import jalview.gui.*;\r
  13 import javax.swing.*;\r
  14 import java.awt.event.*;\r
  15 import jalview.io.*;\r
  16 \r
  17 import org.apache.log4j.*;\r
  18 \r
  19 public class Jalview extends JApplet\r
  20 {\r
  21   public static JApplet applet;\r
  22   Desktop frame;\r
  23   public void init()\r
  24   {\r
  25     applet = this;\r
  26 \r
  27     frame = new Desktop();\r
  28     frame.setResizable(true);\r
  29     frame.setVisible(true);\r
  30     frame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DO_NOTHING_ON_CLOSE);\r
  31     frame.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
  32     {\r
  33       public void windowClosing(WindowEvent e)\r
  34       {\r
  35           applet.stop();\r
  36           applet.destroy();\r
  37       }\r
  38     });\r
  39 \r
  40     String file = getParameter("alignment");\r
  41 \r
  42     if(file!=null)\r
  43     {\r
  44       jalview.bin.Cache.setProperty("LAST_DIRECTORY", file);\r
  45       String protocol = "File";\r
  46       if (file.indexOf("http:") > -1)\r
  47         protocol = "URL";\r
  48 \r
  49       String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify(file, protocol);\r
  50 \r
  51       frame.LoadFile(file, protocol, format);\r
  52     }\r
  53   }\r
  54 \r
  55   public void destroy()\r
  56   {\r
  57     if(applet!=null)\r
  58       applet.stop();\r
  59     else\r
  60       System.exit(0);\r
  61     frame.setVisible(false);\r
  62   }\r
  63 \r
  64   private static void initLogger() {\r
  65     Logger l = Logger.getLogger("org.apache.axis");\r
  66     l.setLevel(Level.INFO);\r
  67     ConsoleAppender ap = new ConsoleAppender(new SimpleLayout(),"System.err");\r
  68     ap.setName("Axis");\r
  69     l.addAppender(ap);\r
  70   }\r
  71    public static void main(String[] args) {\r
  72 \r
  73     Cache.loadProperties();\r
  74     try {\r
  75       initLogger();\r
  76     } catch (Exception e) {\r
  77       System.out.println("Failed to initialise the log4j system for axis\n"+e);\r
  78     }\r
  79     try{\r
  80        UIManager.setLookAndFeel(\r
  81    //   "javax.swing.plaf.metal.MetalLookAndFeel"\r
  82     //  "javax.swing.plaf.multi.MultiLookAndFeel"\r
  83          UIManager.getSystemLookAndFeelClassName()\r
  84      //    UIManager.getCrossPlatformLookAndFeelClassName()\r
  85        // "com.sun.java.swing.plaf.gtk.GTKLookAndFeel"\r
  86        //   "com.sun.java.swing.plaf.windows.WindowsLookAndFeel"\r
  87        //  "com.sun.java.swing.plaf.motif.MotifLookAndFeel"\r
  88      );\r
  89      }\r
  90      catch (Exception ex)\r
  91      {}\r
  92 \r
  93     // JFrame.setDefaultLookAndFeelDecorated(true);\r
  94      Desktop frame = new Desktop();\r
  95      frame.setResizable(true);\r
  96      frame.setVisible(true);\r
  97 \r
  98 \r
  99      if(args!=null && args.length>0)\r
 100      {\r
 101          String file = args[0];\r
 102          String protocol = "File";\r
 103          if(file.indexOf("http:")>-1)\r
 104            protocol = "URL";\r
 105 \r
 106          String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify(file, protocol);\r
 107 \r
 108          frame.LoadFile(file, protocol, format);\r
 109      }\r
 110 \r
 111    }\r
 112 \r
 113 }\r
 114 \r