src/jalview/bin/Jalview.java

   1 /********************\r
   2  * 2004 Jalview Reengineered\r
   3  * Barton Group\r
   4  * Dundee University\r
   5  *\r
   6  * AM Waterhouse\r
   7  *******************/\r
   8 \r
   9 \r
  10 package jalview.bin;\r
  11 \r
  12 import jalview.gui.*;\r
  13 import javax.swing.*;\r
  14 import java.awt.event.*;\r
  15 import jalview.io.*;\r
  16 \r
  17 import org.apache.log4j.*;\r
  18 \r
  19 public class Jalview extends JApplet\r
  20 {\r
  21   public static JApplet applet;\r
  22   Desktop frame;\r
  23   public void init()\r
  24   {\r
  25     applet = this;\r
  26 \r
  27     frame = new Desktop();\r
  28     frame.setResizable(true);\r
  29     frame.setVisible(true);\r
  30     frame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DO_NOTHING_ON_CLOSE);\r
  31     frame.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
  32     {\r
  33       public void windowClosing(WindowEvent e)\r
  34       {\r
  35           applet.stop();\r
  36           applet.destroy();\r
  37       }\r
  38     });\r
  39 \r
  40     String file = getParameter("alignment");\r
  41 \r
  42     if(file!=null)\r
  43     {\r
  44       jalview.bin.Cache.setProperty("LAST_DIRECTORY", file);\r
  45       String protocol = "File";\r
  46       if (file.indexOf("http:") > -1)\r
  47         protocol = "URL";\r
  48 \r
  49       String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify(file, protocol);\r
  50 \r
  51       frame.LoadFile(file, protocol, format);\r
  52     }\r
  53   }\r
  54 \r
  55   public void destroy()\r
  56   {\r
  57     if(applet!=null)\r
  58       applet.stop();\r
  59     else\r
  60       System.exit(0);\r
  61     frame.setVisible(false);\r
  62   }\r
  63 \r
  64   private static void initLogger() {\r
  65     Logger l = Logger.getLogger("org.apache.axis");\r
  66     if (Cache.getProperty("logs.Axis.Level")==null) {\r
  67       Cache.setProperty("logs.Axis.Level", Level.INFO.toString());\r
  68     }\r
  69 \r
  70     l.setLevel(Level.toLevel(Cache.getProperty("logs.Axis.Level")));\r
  71     ConsoleAppender ap = new ConsoleAppender(new SimpleLayout(),"System.err");\r
  72     ap.setName("Axis");\r
  73     l.addAppender(ap);\r
  74   }\r
  75    public static void main(String[] args) {\r
  76 \r
  77     Cache.loadProperties();\r
  78     try {\r
  79       initLogger();\r
  80     } catch (Exception e) {\r
  81       System.out.println("Problems initializing the log4j system\n"+e);\r
  82     }\r
  83     try{\r
  84        UIManager.setLookAndFeel(\r
  85    //   "javax.swing.plaf.metal.MetalLookAndFeel"\r
  86     //  "javax.swing.plaf.multi.MultiLookAndFeel"\r
  87          UIManager.getSystemLookAndFeelClassName()\r
  88      //    UIManager.getCrossPlatformLookAndFeelClassName()\r
  89        // "com.sun.java.swing.plaf.gtk.GTKLookAndFeel"\r
  90        //   "com.sun.java.swing.plaf.windows.WindowsLookAndFeel"\r
  91        //  "com.sun.java.swing.plaf.motif.MotifLookAndFeel"\r
  92      );\r
  93      }\r
  94      catch (Exception ex)\r
  95      {}\r
  96 \r
  97      Desktop frame = new Desktop();\r
  98      frame.setResizable(true);\r
  99      frame.setVisible(true);\r
 100 \r
 101 \r
 102 \r
 103      if(args!=null && args.length>0)\r
 104      {\r
 105          String file=null;\r
 106          if(args[0].equals("-open"))\r
 107            file = args[1];\r
 108          else\r
 109            file = args[0];\r
 110 \r
 111          String protocol = "File";\r
 112          if(file.indexOf("http:")>-1)\r
 113            protocol = "URL";\r
 114 \r
 115          String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify(file, protocol);\r
 116 \r
 117          frame.LoadFile(file, protocol, format);\r
 118      }\r
 119 \r
 120    }\r
 121 \r
 122 }\r
 123 \r