src/jalview/bin/JalviewLite.java

   1 package jalview.bin;\r
   2 \r
   3 import java.applet.*;\r
   4 import java.awt.*;\r
   5 import java.awt.event.*;\r
   6 import jalview.datamodel.*;\r
   7 import jalview.io.*;\r
   8 import jalview.appletgui.AlignFrame;\r
   9 \r
  10 public class JalviewLite extends Applet\r
  11 {\r
  12   static int lastFrameX = 200;\r
  13   static int lastFrameY = 200;\r
  14   static Applet applet;\r
  15   boolean fileFound = true;\r
  16   String file = "No file";\r
  17   Button launcher = new Button("Start Jalview");\r
  18 \r
  19   public void init()\r
  20   {\r
  21     applet = this;\r
  22     this.setBackground(Color.white);\r
  23 \r
  24     file = getParameter("file");\r
  25     if (file != null)\r
  26     {\r
  27       add(launcher);\r
  28       file = applet.getCodeBase() + file;\r
  29       launcher.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()\r
  30      {\r
  31        public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
  32        {\r
  33          String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify( file, "URL");\r
  34          LoadFile(file, "URL", format);\r
  35        }\r
  36      });\r
  37     }\r
  38      else\r
  39      {\r
  40        file = "NO FILE";\r
  41        fileFound = false;\r
  42      }\r
  43    }\r
  44 \r
  45 \r
  46    public static void showURL(String url)\r
  47    {\r
  48      try{\r
  49        applet.getAppletContext().showDocument(new java.net.URL(url), "HELP_WINDOW");\r
  50      }catch(Exception ex){}\r
  51    }\r
  52 \r
  53    public void LoadFile(String file, String protocol,  String format)\r
  54    {\r
  55      LoadingThread loader = new LoadingThread(file, protocol, format, this);\r
  56      loader.start();\r
  57    }\r
  58 \r
  59    public static void addFrame(final Frame frame, String title, int width, int height)\r
  60    {\r
  61      frame.setLocation(lastFrameX,lastFrameY);\r
  62      lastFrameX+=40; lastFrameY+=40;\r
  63      frame.setSize(width,height);\r
  64      frame.setTitle(title);\r
  65      frame.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
  66     {\r
  67       public void windowClosing(WindowEvent e)\r
  68       {\r
  69         frame.dispose();\r
  70       }\r
  71     });\r
  72     frame.setVisible(true);\r
  73    }\r
  74 \r
  75 \r
  76    public void paint(Graphics g)\r
  77    {\r
  78      if(!fileFound)\r
  79      {\r
  80        g.setColor(new Color(200,200,200));\r
  81        g.setColor(Color.cyan);\r
  82        g.fillRect(0,0,getSize().width, getSize().height);\r
  83        g.setColor(Color.red);\r
  84        g.drawString("Jalview can't open file", 5, 15);\r
  85        g.drawString("\""+ file+"\"", 5, 30);\r
  86      }\r
  87    }\r
  88 \r
  89    class LoadingThread extends Thread\r
  90    {\r
  91      String file, protocol, format;\r
  92      JalviewLite jlapplet;\r
  93 \r
  94      public LoadingThread(String file, String protocol,  String format, JalviewLite applet)\r
  95      {\r
  96        this.file = file;\r
  97        this.protocol = protocol;\r
  98        this.format = format;\r
  99        this.jlapplet = applet;\r
 100      }\r
 101      public void run()\r
 102      {\r
 103        SequenceI [] sequences = null;\r
 104        sequences = FormatAdapter.readFile(file, protocol, format);\r
 105 \r
 106        if (sequences != null && sequences.length>0)\r
 107        {\r
 108          AlignFrame af = new AlignFrame(new Alignment(sequences), jlapplet );\r
 109          addFrame(af, file, AlignFrame.NEW_WINDOW_WIDTH, AlignFrame.NEW_WINDOW_HEIGHT);\r
 110          af.statusBar.setText("Successfully loaded file " + file);\r
 111        }\r
 112        else\r
 113        {\r
 114          fileFound = false;\r
 115          remove(launcher);\r
 116          repaint();\r
 117        }\r
 118      }\r
 119    }\r
 120 }\r
 121 \r
 122 \r