src/jalview/datamodel/AlignmentExportData.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 import jalview.api.AlignExportSettingI;
   4
   5
   6 public class AlignmentExportData
   7 {
   8   private AlignmentI alignment;
   9
  10   private String[] omitHidden;
  11
  12   private int[] startEnd;
  13
  14   private AlignExportSettingI settings;
  15
  16   public AlignmentExportData(AlignmentI align, String[] ommit,
  17           int[] startEnd, AlignExportSettingI settings)
  18   {
  19     this.alignment = align;
  20     this.omitHidden = ommit;
  21     this.startEnd = startEnd;
  22     this.settings = settings;
  23   }
  24
  25   public AlignmentI getAlignment()
  26   {
  27     return alignment;
  28   }
  29
  30   public void setAlignment(AlignmentI alignment)
  31   {
  32     this.alignment = alignment;
  33   }
  34
  35   public String[] getOmitHidden()
  36   {
  37     return omitHidden;
  38   }
  39
  40   public void setOmitHidden(String[] omitHidden)
  41   {
  42     this.omitHidden = omitHidden;
  43   }
  44
  45   public int[] getStartEndPostions()
  46   {
  47     return startEnd;
  48   }
  49
  50   public void setStartEndPostions(int[] startEnd)
  51   {
  52     this.startEnd = startEnd;
  53   }
  54
  55   public AlignExportSettingI getSettings()
  56   {
  57     return settings;
  58   }
  59
  60   public void setSettings(AlignExportSettingI settings)
  61   {
  62     this.settings = settings;
  63   }
  64 }