src/jalview/datamodel/SequenceDummy.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 public class SequenceDummy extends Sequence implements SequenceI
   4 {
   5   public SequenceDummy(String sequenceId)
   6   {
   7     super(sequenceId, "THISAPLACEHOLDER");
   8   }
   9
  10   private boolean dummy = true;
  11
  12   /**
  13    * become a proxy for mseq, merging any existing annotation on this sequence
  14    *
  15    * @param mseq
  16    */
  17   public void become(SequenceI mseq)
  18   {
  19     initSeqFrom(mseq, null);
  20     dummy = false;
  21   }
  22
  23   /**
  24    * Test if the SequenceDummy has been promoted to a real sequence via
  25    * SequenceDummy.become
  26    *
  27    * @return true if this is a placeholder and contains no actual sequence data
  28    */
  29   public boolean isDummy()
  30   {
  31     return dummy;
  32   }
  33 }