src/jalview/datamodel/annotations/AnnotationRowBuilder.java

   1 package jalview.datamodel.annotations;
   2
   3 import jalview.datamodel.Annotation;
   4
   5 public class AnnotationRowBuilder
   6 {
   7
   8   String name;
   9
  10   boolean hasDescription = false;
  11
  12   String description;
  13
  14   boolean hasMinMax = false;
  15
  16   public String getName()
  17   {
  18     return name;
  19   }
  20
  21   public void setName(String name)
  22   {
  23     this.name = name;
  24   }
  25
  26   public boolean isHasDescription()
  27   {
  28     return hasDescription;
  29   }
  30
  31   public void setHasDescription(boolean hasDescription)
  32   {
  33     this.hasDescription = hasDescription;
  34   }
  35
  36   public String getDescription()
  37   {
  38     return description;
  39   }
  40
  41   public void setDescription(String description)
  42   {
  43     this.description = description;
  44   }
  45
  46   public boolean isHasMinMax()
  47   {
  48     return hasMinMax;
  49   }
  50
  51   public void setHasMinMax(boolean hasMinMax)
  52   {
  53     this.hasMinMax = hasMinMax;
  54   }
  55
  56   public float getMin()
  57   {
  58     return min;
  59   }
  60
  61   public void setMin(float min)
  62   {
  63     this.min = min;
  64   }
  65
  66   public float getMax()
  67   {
  68     return max;
  69   }
  70
  71   public void setMax(float max)
  72   {
  73     this.max = max;
  74   }
  75
  76   float min, max;
  77
  78   public AnnotationRowBuilder(String string)
  79   {
  80     name = string;
  81   }
  82
  83   public AnnotationRowBuilder(String name, float min, float max)
  84   {
  85     this(name);
  86     this.min = min;
  87     this.max = max;
  88     this.hasMinMax = true;
  89   }
  90
  91   /**
  92    * override this to apply some form of transformation to the annotation - eg a
  93    * colourscheme
  94    *
  95    * @param annotation
  96    */
  97   public void processAnnotation(Annotation annotation)
  98   {
  99
 100   }
 101 }