src/jalview/gui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.datamodel.*;\r
  22 \r
  23 import jalview.io.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.jbgui.*;\r
  26 \r
  27 import java.awt.*;\r
  28 import java.awt.datatransfer.*;\r
  29 import java.awt.event.*;\r
  30 \r
  31 import javax.swing.*;\r
  32 \r
  33 \r
  34 /**\r
  35  * DOCUMENT ME!\r
  36  *\r
  37  * @author $author$\r
  38  * @version $Revision$\r
  39  */\r
  40 public class CutAndPasteTransfer extends GCutAndPasteTransfer\r
  41 {\r
  42 \r
  43   AlignViewport viewport;\r
  44 \r
  45   public CutAndPasteTransfer()\r
  46   {\r
  47     SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
  48     {\r
  49       public void run()\r
  50       {\r
  51         textarea.requestFocus();\r
  52       }\r
  53     });\r
  54 \r
  55   }\r
  56 \r
  57     /**\r
  58      * DOCUMENT ME!\r
  59      */\r
  60     public void setForInput(AlignViewport viewport)\r
  61     {\r
  62       this.viewport = viewport;\r
  63       if(viewport!=null)\r
  64         ok.setText("Add");\r
  65 \r
  66       getContentPane().add(inputButtonPanel, java.awt.BorderLayout.SOUTH);\r
  67     }\r
  68 \r
  69     /**\r
  70      * DOCUMENT ME!\r
  71      *\r
  72      * @return DOCUMENT ME!\r
  73      */\r
  74     public String getText()\r
  75     {\r
  76         return textarea.getText();\r
  77     }\r
  78 \r
  79     /**\r
  80      * DOCUMENT ME!\r
  81      *\r
  82      * @param text DOCUMENT ME!\r
  83      */\r
  84     public void setText(String text)\r
  85     {\r
  86         textarea.setText(text);\r
  87     }\r
  88 \r
  89     public void appendText(String text)\r
  90     {\r
  91       textarea.append(text);\r
  92     }\r
  93 \r
  94 \r
  95     public void save_actionPerformed(ActionEvent e)\r
  96     {\r
  97       JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(\r
  98           jalview.bin.Cache.getProperty(\r
  99               "LAST_DIRECTORY"));\r
 100 \r
 101       chooser.setAcceptAllFileFilterUsed(false);\r
 102       chooser.setFileView(new JalviewFileView());\r
 103       chooser.setDialogTitle("Save Text to File");\r
 104       chooser.setToolTipText("Save");\r
 105 \r
 106       int value = chooser.showSaveDialog(this);\r
 107 \r
 108       if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)\r
 109       {\r
 110         try\r
 111         {\r
 112           java.io.PrintWriter out = new java.io.PrintWriter(\r
 113               new java.io.FileWriter(chooser.getSelectedFile()));\r
 114 \r
 115           out.print(getText());\r
 116           out.close();\r
 117         }\r
 118         catch (Exception ex)\r
 119         {\r
 120           ex.printStackTrace();\r
 121         }\r
 122 \r
 123       }\r
 124     }\r
 125 \r
 126 \r
 127 \r
 128     /**\r
 129      * DOCUMENT ME!\r
 130      *\r
 131      * @param e DOCUMENT ME!\r
 132      */\r
 133     public void copyItem_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 134     {\r
 135         textarea.getSelectedText();\r
 136         Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();\r
 137         c.setContents(new StringSelection(textarea.getSelectedText()), null);\r
 138     }\r
 139 \r
 140     /**\r
 141      * DOCUMENT ME!\r
 142      *\r
 143      * @param e DOCUMENT ME!\r
 144      */\r
 145     public void pasteMenu_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 146     {\r
 147         Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();\r
 148         Transferable contents = c.getContents(this);\r
 149 \r
 150         if (contents == null)\r
 151         {\r
 152             return;\r
 153         }\r
 154 \r
 155         try\r
 156         {\r
 157             textarea.append((String) contents.getTransferData(\r
 158                     DataFlavor.stringFlavor));\r
 159         }\r
 160         catch (Exception ex)\r
 161         {\r
 162         }\r
 163     }\r
 164 \r
 165     /**\r
 166      * DOCUMENT ME!\r
 167      *\r
 168      * @param e DOCUMENT ME!\r
 169      */\r
 170     public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 171     {\r
 172         String format = new IdentifyFile().Identify(getText(), "Paste");\r
 173         Alignment al = null;\r
 174 \r
 175         if (FormatAdapter.isValidFormat(format))\r
 176         {\r
 177           try{\r
 178             al = new FormatAdapter().readFile(getText(), "Paste", format);\r
 179           }catch(java.io.IOException ex)\r
 180           {\r
 181             JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,\r
 182                                                   "Couldn't read the pasted text.\n" +ex.toString(),\r
 183                                                   "Error parsing text",\r
 184                                                   JOptionPane.WARNING_MESSAGE);\r
 185           }\r
 186         }\r
 187 \r
 188         if (al != null)\r
 189         {\r
 190           if(viewport!=null)\r
 191           {\r
 192             for(int i=0; i<al.getHeight(); i++)\r
 193               viewport.getAlignment().addSequence(al.getSequenceAt(i));\r
 194 \r
 195             viewport.firePropertyChange("alignment", null, viewport.getAlignment().getSequences());\r
 196           }\r
 197           else\r
 198           {\r
 199             AlignFrame af = new AlignFrame(al,\r
 200                                            AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,\r
 201                                            AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);\r
 202             af.currentFileFormat = format;\r
 203             Desktop.addInternalFrame(af, "Cut & Paste input - " + format,\r
 204                                      AlignFrame.DEFAULT_WIDTH,\r
 205                                      AlignFrame.DEFAULT_HEIGHT);\r
 206             af.statusBar.setText("Successfully pasted alignment file");\r
 207 \r
 208             try\r
 209             {\r
 210               af.setMaximum(jalview.bin.Cache.getDefault("SHOW_FULLSCREEN", false));\r
 211             }\r
 212             catch (Exception ex)\r
 213             {\r
 214             }\r
 215           }\r
 216         }\r
 217     }\r
 218 \r
 219     /**\r
 220      * DOCUMENT ME!\r
 221      *\r
 222      * @param e DOCUMENT ME!\r
 223      */\r
 224     public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 225     {\r
 226         try\r
 227         {\r
 228             this.setClosed(true);\r
 229         }\r
 230         catch (Exception ex)\r
 231         {\r
 232         }\r
 233     }\r
 234 \r
 235     public void textarea_mousePressed(MouseEvent e)\r
 236     {\r
 237       if(SwingUtilities.isRightMouseButton(e))\r
 238       {\r
 239         JPopupMenu popup = new JPopupMenu("Edit");\r
 240         JMenuItem item = new JMenuItem("Copy");\r
 241         item.addActionListener(new ActionListener()\r
 242             {public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 243                   {\r
 244                     copyItem_actionPerformed(e);\r
 245                   }\r
 246             });\r
 247         popup.add(item);\r
 248         item = new JMenuItem("Paste");\r
 249         item.addActionListener(new ActionListener()\r
 250             {public void actionPerformed(ActionEvent e)\r
 251                   {\r
 252                     pasteMenu_actionPerformed(e);\r
 253                   }\r
 254             });\r
 255         popup.add(item);\r
 256         popup.show(this, e.getX()+10, e.getY()+textarea.getY()+40);\r
 257 \r
 258       }\r
 259     }\r
 260 \r
 261 }\r