src/jalview/gui/IdCanvas.java

   1 package jalview.gui;\r
   2 \r
   3 import java.awt.*;\r
   4 import java.awt.Graphics2D.*;\r
   5 import java.awt.image.*;\r
   6 import javax.swing.*;\r
   7 import jalview.datamodel.*;\r
   8 import jalview.analysis.*;\r
   9 public class IdCanvas extends JPanel\r
  10 {\r
  11   protected AlignViewport av;\r
  12 \r
  13   protected boolean showScores  = true;\r
  14 \r
  15   protected int     maxIdLength = -1;\r
  16   protected String  maxIdStr    = null;\r
  17   BufferedImage image;\r
  18   Graphics2D gg;\r
  19   int imgHeight=0;\r
  20   boolean fastPaint = false;\r
  21 \r
  22   public IdCanvas(AlignViewport av)\r
  23   {\r
  24     setLayout(new BorderLayout());\r
  25     this.av         = av;\r
  26     PaintRefresher.Register(this);\r
  27   }\r
  28 \r
  29   public void drawIdString(Graphics2D gg,SequenceI s,int i, int starty, int ypos) {\r
  30       int charHeight = av.getCharHeight();\r
  31 \r
  32 \r
  33       if (av.getSelectionGroup()!=null && av.getSelectionGroup().sequences.contains(s)) {\r
  34           gg.setColor(Color.lightGray);\r
  35           gg.fillRect(0,AlignmentUtil.getPixelHeight(starty,i,charHeight)+ ypos,getWidth(),charHeight);\r
  36           gg.setColor(Color.white);\r
  37       } else {\r
  38           gg.setColor(s.getColor());\r
  39           gg.fillRect(0,AlignmentUtil.getPixelHeight(starty,i,charHeight)+ ypos,getWidth(),charHeight);\r
  40           gg.setColor(Color.black);\r
  41       }\r
  42 \r
  43       String string = s.getName();\r
  44       if(av.getShowFullId())\r
  45         string = s.getDisplayId();\r
  46 \r
  47       gg.drawString(string,0,AlignmentUtil.getPixelHeight(starty,i,charHeight) + ypos + charHeight-   (charHeight/5));\r
  48 \r
  49   }\r
  50 \r
  51   public void fastPaint(int vertical)\r
  52   {\r
  53     if(gg==null)\r
  54     {  repaint(); return;}\r
  55 \r
  56     gg.copyArea( 0,0, getWidth(), imgHeight, 0, -vertical*av.charHeight );\r
  57 \r
  58     int ss=av.startSeq, es=av.endSeq, transY = 0;\r
  59      if(vertical>0)    // scroll down\r
  60      {\r
  61        transY = imgHeight - vertical*av.charHeight;\r
  62        ss = es - vertical;\r
  63      }\r
  64      else if(vertical<0)\r
  65      {\r
  66        es = ss-vertical;\r
  67      }\r
  68 \r
  69         gg.translate(0, transY);\r
  70 \r
  71         drawIds(ss, es);\r
  72 \r
  73         gg.translate( 0, -transY );\r
  74 \r
  75 \r
  76       fastPaint = true;\r
  77       repaint();\r
  78   }\r
  79 \r
  80   public void paintComponent(Graphics g)\r
  81   {\r
  82     g.setColor(Color.white);\r
  83     g.fillRect(0, 0, getWidth(), getHeight());\r
  84 \r
  85     if (fastPaint)\r
  86     {\r
  87       g.drawImage(image, 0, 0, this);\r
  88       fastPaint = false;\r
  89       return;\r
  90     }\r
  91 \r
  92     imgHeight = getHeight();\r
  93     imgHeight -= imgHeight % av.charHeight;\r
  94     image = new BufferedImage(getWidth(), imgHeight, BufferedImage.TYPE_INT_RGB);\r
  95     gg = (Graphics2D) image.getGraphics();\r
  96     //Fill in the background\r
  97     gg.setColor(Color.white);\r
  98     gg.fillRect(0, 0, getWidth(), imgHeight);\r
  99     gg.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,\r
 100                         RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);\r
 101     Font italic = new Font(av.getFont().getName(), Font.ITALIC,\r
 102                            av.getFont().getSize());\r
 103     gg.setFont(italic);\r
 104 \r
 105     drawIds( av.getStartSeq(), av.endSeq);\r
 106 \r
 107     g.drawImage(image, 0, 0, this);\r
 108   }\r
 109 \r
 110   void drawIds(int starty, int endy)\r
 111   {\r
 112 \r
 113     Color currentColor     = Color.white;\r
 114     Color currentTextColor = Color.black;\r
 115 \r
 116     if (av.getWrapAlignment())\r
 117     {\r
 118           // Draw the rest of the panels\r
 119           int chunkHeight =  (av.alignment.getHeight() + 2)*av.charHeight;\r
 120           int row = av.getStartRes() / av.chunkWidth ;\r
 121           for(int ypos=2*av.charHeight;\r
 122               ypos <= getHeight() && row*av.chunkWidth<av.alignment.getWidth();\r
 123               ypos += chunkHeight, row++ )\r
 124           {\r
 125             for (int i = starty; i < av.alignment.getHeight(); i++)\r
 126             {\r
 127               SequenceI s = av.alignment.getSequenceAt(i);\r
 128               drawIdString(gg, s, i, 0, ypos);\r
 129             }\r
 130           }\r
 131 \r
 132 \r
 133     } else\r
 134     {\r
 135 \r
 136       //Now draw the id strings\r
 137       for (int i = starty; i < endy; i++)\r
 138       {\r
 139         // Selected sequence colours\r
 140 \r
 141         if (av.getSelectionGroup()!= null\r
 142             && av.getSelectionGroup().sequences.contains(av.alignment.getSequenceAt(i)))\r
 143         {\r
 144        //   if(av.alignment.findGroup(al.getSequenceAt(i)).getEndRes()==\r
 145           currentColor = Color.lightGray;\r
 146           currentTextColor = Color.black;\r
 147         }\r
 148         else\r
 149         {\r
 150           currentColor = av.alignment.getSequenceAt(i).getColor();\r
 151           currentTextColor = Color.black;\r
 152         }\r
 153 \r
 154         gg.setColor(currentColor);\r
 155 \r
 156         gg.fillRect(0,\r
 157                     AlignmentUtil.getPixelHeight(starty, i, av.charHeight),\r
 158                     getWidth(),\r
 159                     av.charHeight);\r
 160 \r
 161         gg.setColor(currentTextColor);\r
 162         String string = av.alignment.getSequenceAt(i).getName();\r
 163         if(av.getShowFullId())\r
 164           string = av.alignment.getSequenceAt(i).getDisplayId();\r
 165         gg.drawString(string, 0,\r
 166                       AlignmentUtil.getPixelHeight(starty, i, av.charHeight) +\r
 167                       av.charHeight - (av.charHeight / 5));\r
 168       }\r
 169 \r
 170       // add a border\r
 171       gg.setColor(Color.white);\r
 172       gg.fillRect(getWidth()-4,0,4,getHeight());\r
 173     }\r
 174 \r
 175   }\r
 176 }\r