src/jalview/io/FileParse.java

   1 /*\r
   2 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4 *\r
   5 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8 * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9 *\r
  10 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13 * GNU General Public License for more details.\r
  14 *\r
  15 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18 */\r
  19 package jalview.io;\r
  20 \r
  21 import java.io.*;\r
  22 \r
  23 import java.net.*;\r
  24 \r
  25 \r
  26 public class FileParse {\r
  27     public File inFile;\r
  28     public int fileSize;\r
  29     public int noLines;\r
  30     protected String type;\r
  31     protected BufferedReader dataIn;\r
  32 \r
  33     public FileParse() {\r
  34     }\r
  35 \r
  36     public FileParse(String fileStr, String type)\r
  37         throws MalformedURLException, IOException {\r
  38         this.type = type;\r
  39 \r
  40         if (type.equals("File")) {\r
  41             this.inFile = new File(fileStr);\r
  42             this.fileSize = (int) inFile.length();\r
  43 \r
  44             dataIn = new BufferedReader(new FileReader(fileStr));\r
  45         } else if (type.equals("URL")) {\r
  46             URL url = new URL(fileStr);\r
  47             this.fileSize = 0;\r
  48             dataIn = new BufferedReader(new InputStreamReader(url.openStream()));\r
  49         } else if (type.equals("Paste")) {\r
  50             dataIn = new BufferedReader(new StringReader(fileStr));\r
  51         }\r
  52     }\r
  53 \r
  54     public String nextLine() throws IOException {\r
  55         String next = dataIn.readLine();\r
  56 \r
  57         if (next != null) {\r
  58             noLines++;\r
  59         }\r
  60 \r
  61         return next;\r
  62     }\r
  63 }\r