JAL-3063 temporary extra menu option to save/load project as JAXB
[jalview.git] / src / jalview / jbgui / GDesktop.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.jbgui;
22
23 import jalview.api.AlignmentViewPanel;
24 import jalview.io.FileFormatException;
25 import jalview.util.MessageManager;
26 import jalview.util.Platform;
27
28 import java.awt.FlowLayout;
29 import java.awt.Toolkit;
30 import java.awt.event.ActionEvent;
31 import java.awt.event.ActionListener;
32
33 import javax.swing.JCheckBoxMenuItem;
34 import javax.swing.JFrame;
35 import javax.swing.JMenu;
36 import javax.swing.JMenuBar;
37 import javax.swing.JMenuItem;
38
39 /**
40  * DOCUMENT ME!
41  * 
42  * @author $author$
43  * @version $Revision$
44  */
45 public class GDesktop extends JFrame
46 {
47   protected static JMenu windowMenu = new JMenu();
48
49   JMenuBar desktopMenubar = new JMenuBar();
50
51   JMenu FileMenu = new JMenu();
52
53   JMenu HelpMenu = new JMenu();
54
55   protected JMenu VamsasMenu = new JMenu();
56
57   protected JMenu VamsasStMenu = new JMenu();
58
59   JMenuItem inputLocalFileMenuItem = new JMenuItem();
60
61   JMenuItem inputURLMenuItem = new JMenuItem();
62
63   JMenuItem inputTextboxMenuItem = new JMenuItem();
64
65   JMenuItem quit = new JMenuItem();
66
67   JMenuItem aboutMenuItem = new JMenuItem();
68
69   JMenuItem documentationMenuItem = new JMenuItem();
70
71   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();
72
73   protected JMenu toolsMenu = new JMenu();
74
75   JMenuItem preferences = new JMenuItem();
76
77   JMenuItem saveState = new JMenuItem();
78
79   JMenuItem loadState = new JMenuItem();
80
81   JMenu inputMenu = new JMenu();
82
83   protected JMenuItem vamsasStart = new JMenuItem();
84
85   protected JMenuItem vamsasImport = new JMenuItem();
86
87   protected JMenuItem vamsasSave = new JMenuItem();
88
89   JMenuItem inputSequence = new JMenuItem();
90
91   protected JMenuItem vamsasStop = new JMenuItem();
92
93   JMenuItem closeAll = new JMenuItem();
94
95   JMenuItem raiseRelated = new JMenuItem();
96
97   JMenuItem minimizeAssociated = new JMenuItem();
98
99   protected JCheckBoxMenuItem showMemusage = new JCheckBoxMenuItem();
100
101   JMenuItem garbageCollect = new JMenuItem();
102
103   protected JMenuItem groovyShell;
104
105   protected JCheckBoxMenuItem experimentalFeatures;
106
107   protected JCheckBoxMenuItem showConsole = new JCheckBoxMenuItem();
108
109   protected JCheckBoxMenuItem showNews = new JCheckBoxMenuItem();
110
111   protected JMenuItem snapShotWindow = new JMenuItem();
112
113   /**
114    * Creates a new GDesktop object.
115    */
116   public GDesktop()
117   {
118     try
119     {
120       jbInit();
121       this.setJMenuBar(desktopMenubar);
122     } catch (Exception e)
123     {
124       e.printStackTrace();
125     }
126
127     if (!Platform.isAMac())
128     {
129       FileMenu.setMnemonic('F');
130       inputLocalFileMenuItem.setMnemonic('L');
131       VamsasMenu.setMnemonic('V');
132       inputURLMenuItem.setMnemonic('U');
133       inputTextboxMenuItem.setMnemonic('C');
134       quit.setMnemonic('Q');
135       saveState.setMnemonic('S');
136       loadState.setMnemonic('L');
137       inputMenu.setMnemonic('I');
138     }
139   }
140
141   /**
142    * DOCUMENT ME!
143    * 
144    * @throws Exception
145    *           DOCUMENT ME!
146    */
147   private void jbInit() throws Exception
148   {
149
150     FileMenu.setText(MessageManager.getString("action.file"));
151     HelpMenu.setText(MessageManager.getString("action.help"));
152     VamsasMenu.setText("Vamsas");
153     VamsasMenu.setToolTipText(MessageManager
154             .getString("label.share_data_vamsas_applications"));
155     VamsasStMenu.setText(MessageManager.getString("label.connect_to"));
156     VamsasStMenu.setToolTipText(
157             MessageManager.getString("label.join_existing_vamsas_session"));
158     inputLocalFileMenuItem
159             .setText(MessageManager.getString("label.load_tree_from_file"));
160     inputLocalFileMenuItem.setAccelerator(
161             javax.swing.KeyStroke.getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_O,
162                     Toolkit.getDefaultToolkit().getMenuShortcutKeyMask(),
163                     false));
164     inputLocalFileMenuItem
165             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
166             {
167               @Override
168               public void actionPerformed(ActionEvent e)
169               {
170                 inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(null);
171               }
172             });
173     inputURLMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.from_url"));
174     inputURLMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
175     {
176       @Override
177       public void actionPerformed(ActionEvent e)
178       {
179         try
180         {
181           inputURLMenuItem_actionPerformed(null);
182         } catch (FileFormatException e1)
183         {
184           System.err.println("Error loading from URL: " + e1.getMessage());
185         }
186       }
187     });
188     inputTextboxMenuItem
189             .setText(MessageManager.getString("label.from_textbox"));
190     inputTextboxMenuItem
191             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
192             {
193               @Override
194               public void actionPerformed(ActionEvent e)
195               {
196                 inputTextboxMenuItem_actionPerformed(null);
197               }
198             });
199     quit.setText(MessageManager.getString("action.quit"));
200     quit.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
201     {
202       @Override
203       public void actionPerformed(ActionEvent e)
204       {
205         quit();
206       }
207     });
208     aboutMenuItem.setText(MessageManager.getString("label.about"));
209     aboutMenuItem.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
210     {
211       @Override
212       public void actionPerformed(ActionEvent e)
213       {
214         aboutMenuItem_actionPerformed(e);
215       }
216     });
217     documentationMenuItem
218             .setText(MessageManager.getString("label.documentation"));
219     documentationMenuItem.setAccelerator(javax.swing.KeyStroke
220             .getKeyStroke(java.awt.event.KeyEvent.VK_F1, 0, false));
221     documentationMenuItem
222             .addActionListener(new java.awt.event.ActionListener()
223             {
224               @Override
225               public void actionPerformed(ActionEvent e)
226               {
227                 documentationMenuItem_actionPerformed(e);
228               }
229             });
230     this.getContentPane().setLayout(flowLayout1);
231     windowMenu.setText(MessageManager.getString("label.window"));
232     preferences.setText(MessageManager.getString("label.preferences"));
233     preferences.addActionListener(new ActionListener()
234     {
235       @Override
236       public void actionPerformed(ActionEvent e)
237       {
238         preferences_actionPerformed(e);
239       }
240     });
241     toolsMenu.setText(MessageManager.getString("label.tools"));
242     saveState.setText(MessageManager.getString("action.save_project"));
243     saveState.addActionListener(new ActionListener()
244     {
245       @Override
246       public void actionPerformed(ActionEvent e)
247       {
248         saveState_actionPerformed(true);
249       }
250     });
251     JMenuItem saveAsJaxb = new JMenuItem("Save Project as JAXB");
252     saveAsJaxb.addActionListener(new ActionListener()
253     {
254       @Override
255       public void actionPerformed(ActionEvent e)
256       {
257         saveState_actionPerformed(false);
258       }
259     });
260     loadState.setText(MessageManager.getString("action.load_project"));
261     loadState.addActionListener(new ActionListener()
262     {
263       @Override
264       public void actionPerformed(ActionEvent e)
265       {
266         loadState_actionPerformed(true);
267       }
268     });
269     JMenuItem loadAsJaxb = new JMenuItem("Load Project as JAXB");
270     loadAsJaxb.addActionListener(new ActionListener()
271     {
272       @Override
273       public void actionPerformed(ActionEvent e)
274       {
275         loadState_actionPerformed(false);
276       }
277     });
278     inputMenu.setText(MessageManager.getString("label.input_alignment"));
279     vamsasStart
280             .setText(MessageManager.getString("label.new_vamsas_session"));
281     vamsasStart.setVisible(false);
282     vamsasStart.addActionListener(new ActionListener()
283     {
284       @Override
285       public void actionPerformed(ActionEvent e)
286       {
287         vamsasStart_actionPerformed(e);
288       }
289     });
290     vamsasImport.setText(
291             MessageManager.getString("action.load_vamsas_session"));
292     vamsasImport.setVisible(false);
293     vamsasImport.addActionListener(new ActionListener()
294     {
295       @Override
296       public void actionPerformed(ActionEvent e)
297       {
298         vamsasImport_actionPerformed(e);
299       }
300     });
301     vamsasSave.setText(
302             MessageManager.getString("action.save_vamsas_session"));
303     vamsasSave.setVisible(false);
304     vamsasSave.addActionListener(new ActionListener()
305     {
306       @Override
307       public void actionPerformed(ActionEvent e)
308       {
309         vamsasSave_actionPerformed(e);
310       }
311     });
312     inputSequence
313             .setText(MessageManager.getString("action.fetch_sequences"));
314     inputSequence.addActionListener(new ActionListener()
315     {
316       @Override
317       public void actionPerformed(ActionEvent e)
318       {
319         inputSequence_actionPerformed(e);
320       }
321     });
322     vamsasStop
323             .setText(MessageManager.getString("label.stop_vamsas_session"));
324     vamsasStop.setVisible(false);
325     vamsasStop.addActionListener(new ActionListener()
326     {
327       @Override
328       public void actionPerformed(ActionEvent e)
329       {
330         vamsasStop_actionPerformed(e);
331       }
332     });
333     closeAll.setText(MessageManager.getString("action.close_all"));
334     closeAll.addActionListener(new ActionListener()
335     {
336       @Override
337       public void actionPerformed(ActionEvent e)
338       {
339         closeAll_actionPerformed(e);
340       }
341     });
342     raiseRelated.setText(
343             MessageManager.getString("action.raise_associated_windows"));
344     raiseRelated.addActionListener(new ActionListener()
345     {
346       @Override
347       public void actionPerformed(ActionEvent e)
348       {
349         raiseRelated_actionPerformed(e);
350       }
351     });
352     minimizeAssociated.setText(
353             MessageManager.getString("action.minimize_associated_windows"));
354     minimizeAssociated.addActionListener(new ActionListener()
355     {
356       @Override
357       public void actionPerformed(ActionEvent e)
358       {
359         minimizeAssociated_actionPerformed(e);
360       }
361     });
362     garbageCollect
363             .setText(MessageManager.getString("label.collect_garbage"));
364     garbageCollect.addActionListener(new ActionListener()
365     {
366       @Override
367       public void actionPerformed(ActionEvent e)
368       {
369         garbageCollect_actionPerformed(e);
370       }
371     });
372     showMemusage
373             .setText(MessageManager.getString("label.show_memory_usage"));
374     showMemusage.addActionListener(new ActionListener()
375     {
376       @Override
377       public void actionPerformed(ActionEvent e)
378       {
379         showMemusage_actionPerformed(e);
380       }
381     });
382     showConsole
383             .setText(MessageManager.getString("label.show_java_console"));
384     showConsole.addActionListener(new ActionListener()
385     {
386       @Override
387       public void actionPerformed(ActionEvent e)
388       {
389         showConsole_actionPerformed(e);
390       }
391     });
392     showNews.setText(MessageManager.getString("label.show_jalview_news"));
393     showNews.addActionListener(new ActionListener()
394     {
395       @Override
396       public void actionPerformed(ActionEvent e)
397       {
398         showNews_actionPerformed(e);
399       }
400     });
401     groovyShell = new JMenuItem();
402     groovyShell.setText(MessageManager.getString("label.groovy_console"));
403     groovyShell.addActionListener(new ActionListener()
404     {
405       @Override
406       public void actionPerformed(ActionEvent e)
407       {
408         groovyShell_actionPerformed();
409       }
410     });
411     experimentalFeatures = new JCheckBoxMenuItem();
412     experimentalFeatures
413             .setText(MessageManager.getString("label.show_experimental"));
414     experimentalFeatures.setToolTipText(
415             MessageManager.getString("label.show_experimental_tip"));
416     experimentalFeatures.addActionListener(new ActionListener()
417     {
418       @Override
419       public void actionPerformed(ActionEvent e)
420       {
421         showExperimental_actionPerformed(experimentalFeatures.isSelected());
422       }
423     });
424
425     snapShotWindow.setText(MessageManager.getString("label.take_snapshot"));
426     snapShotWindow.addActionListener(new ActionListener()
427     {
428       @Override
429       public void actionPerformed(ActionEvent e)
430       {
431         snapShotWindow_actionPerformed(e);
432       }
433     });
434
435     desktopMenubar.add(FileMenu);
436     desktopMenubar.add(toolsMenu);
437     VamsasMenu.setVisible(false);
438     desktopMenubar.add(VamsasMenu);
439     desktopMenubar.add(HelpMenu);
440     desktopMenubar.add(windowMenu);
441     FileMenu.add(inputMenu);
442     FileMenu.add(inputSequence);
443     FileMenu.addSeparator();
444     FileMenu.add(saveState);
445     FileMenu.add(saveAsJaxb);
446     FileMenu.add(loadState);
447     FileMenu.add(loadAsJaxb);
448     FileMenu.addSeparator();
449     FileMenu.add(quit);
450     HelpMenu.add(aboutMenuItem);
451     HelpMenu.add(documentationMenuItem);
452     VamsasMenu.add(VamsasStMenu);
453     VamsasStMenu.setVisible(false);
454     VamsasMenu.add(vamsasStart);
455     VamsasMenu.add(vamsasImport);
456     VamsasMenu.add(vamsasSave);
457     VamsasMenu.add(vamsasStop);
458     toolsMenu.add(preferences);
459     toolsMenu.add(showMemusage);
460     toolsMenu.add(showConsole);
461     toolsMenu.add(showNews);
462     toolsMenu.add(garbageCollect);
463     toolsMenu.add(groovyShell);
464     toolsMenu.add(experimentalFeatures);
465     // toolsMenu.add(snapShotWindow);
466     inputMenu.add(inputLocalFileMenuItem);
467     inputMenu.add(inputURLMenuItem);
468     inputMenu.add(inputTextboxMenuItem);
469     windowMenu.add(closeAll);
470     windowMenu.add(raiseRelated);
471     windowMenu.add(minimizeAssociated);
472     windowMenu.addSeparator();
473     // inputMenu.add(vamsasLoad);
474   }
475
476   protected void showExperimental_actionPerformed(boolean selected)
477   {
478   }
479
480   protected void groovyShell_actionPerformed()
481   {
482   }
483
484   protected void snapShotWindow_actionPerformed(ActionEvent e)
485   {
486     // TODO Auto-generated method stub
487
488   }
489
490   protected void showConsole_actionPerformed(ActionEvent e)
491   {
492     // TODO Auto-generated method stub
493
494   }
495
496   protected void showNews_actionPerformed(ActionEvent e)
497   {
498     // TODO Auto-generated method stub
499
500   }
501
502   protected void showMemusage_actionPerformed(ActionEvent e)
503   {
504     // TODO Auto-generated method stub
505
506   }
507
508   protected void garbageCollect_actionPerformed(ActionEvent e)
509   {
510     // TODO Auto-generated method stub
511
512   }
513
514   protected void vamsasStMenu_actionPerformed()
515   {
516   }
517
518   public void vamsasSave_actionPerformed(ActionEvent e)
519   {
520   }
521
522   /**
523    * DOCUMENT ME!
524    * 
525    * @param e
526    *          DOCUMENT ME!
527    */
528   protected void inputLocalFileMenuItem_actionPerformed(
529           jalview.gui.AlignViewport av)
530   {
531   }
532
533   /**
534    * DOCUMENT ME!
535    * 
536    * @param e
537    *          DOCUMENT ME!
538    * @throws FileFormatException
539    */
540   protected void inputURLMenuItem_actionPerformed(
541           jalview.gui.AlignViewport av) throws FileFormatException
542   {
543   }
544
545   /**
546    * DOCUMENT ME!
547    * 
548    * @param e
549    *          DOCUMENT ME!
550    */
551   protected void inputTextboxMenuItem_actionPerformed(
552           AlignmentViewPanel avp)
553   {
554   }
555
556   /**
557    * DOCUMENT ME!
558    */
559   protected void quit()
560   {
561   }
562
563   /**
564    * DOCUMENT ME!
565    * 
566    * @param e
567    *          DOCUMENT ME!
568    */
569   protected void aboutMenuItem_actionPerformed(ActionEvent e)
570   {
571   }
572
573   /**
574    * DOCUMENT ME!
575    * 
576    * @param e
577    *          DOCUMENT ME!
578    */
579   protected void documentationMenuItem_actionPerformed(ActionEvent e)
580   {
581   }
582
583   /**
584    * DOCUMENT ME!
585    * 
586    * @param e
587    *          DOCUMENT ME!
588    */
589   public void SaveState_actionPerformed(ActionEvent e)
590   {
591   }
592
593   /**
594    * DOCUMENT ME!
595    * 
596    * @param e
597    *          DOCUMENT ME!
598    */
599   protected void preferences_actionPerformed(ActionEvent e)
600   {
601   }
602
603   /**
604    * DOCUMENT ME!
605    * 
606    * @param e
607    *          DOCUMENT ME!
608    */
609   public void saveState_actionPerformed(boolean asCastor)
610   {
611   }
612
613   /**
614    * DOCUMENT ME!
615    * 
616    * @param e
617    *          DOCUMENT ME!
618    */
619   public void loadState_actionPerformed(boolean asCastor)
620   {
621   }
622
623   /**
624    * DOCUMENT ME!
625    * 
626    * @param e
627    *          DOCUMENT ME!
628    */
629   public void loadJalviewAlign_actionPerformed(ActionEvent e)
630   {
631   }
632
633   public void vamsasStart_actionPerformed(ActionEvent e)
634   {
635
636   }
637
638   public void inputSequence_actionPerformed(ActionEvent e)
639   {
640
641   }
642
643   public void vamsasStop_actionPerformed(ActionEvent e)
644   {
645
646   }
647
648   public void closeAll_actionPerformed(ActionEvent e)
649   {
650
651   }
652
653   public void raiseRelated_actionPerformed(ActionEvent e)
654   {
655
656   }
657
658   public void minimizeAssociated_actionPerformed(ActionEvent e)
659   {
660
661   }
662
663   public void vamsasImport_actionPerformed(ActionEvent e)
664   {
665   }
666 }