JAL-1641 added type to BioJSON sequence object and modified seqsHash to sequenceRefs...
[jalview.git] / src / jalview / json / binding / v1 / SequenceGrpPojo.java
1 package jalview.json.binding.v1;
2
3 import java.util.ArrayList;
4
5 public class SequenceGrpPojo
6 {
7   private String svid = "1.0";
8
9   private String colourScheme;
10
11   private String groupName;
12
13   private String description;
14
15   private boolean displayBoxes;
16
17   private boolean displayText;
18
19   private boolean colourText;
20
21   private boolean showNonconserved;
22
23   private int startRes;
24
25   private int endRes;
26
27   private ArrayList<String> sequenceRefs = new ArrayList<String>();
28
29   public String getColourScheme()
30   {
31     return colourScheme;
32   }
33
34   public void setColourScheme(String colourScheme)
35   {
36     this.colourScheme = colourScheme;
37   }
38
39   public String getGroupName()
40   {
41     return groupName;
42   }
43
44   public void setGroupName(String groupName)
45   {
46     this.groupName = groupName;
47   }
48
49   public String getDescription()
50   {
51     return description;
52   }
53
54   public void setDescription(String description)
55   {
56     this.description = description;
57   }
58
59   public boolean isDisplayBoxes()
60   {
61     return displayBoxes;
62   }
63
64   public void setDisplayBoxes(boolean displayBoxes)
65   {
66     this.displayBoxes = displayBoxes;
67   }
68
69   public boolean isDisplayText()
70   {
71     return displayText;
72   }
73
74   public void setDisplayText(boolean displayText)
75   {
76     this.displayText = displayText;
77   }
78
79   public boolean isColourText()
80   {
81     return colourText;
82   }
83
84   public void setColourText(boolean colourText)
85   {
86     this.colourText = colourText;
87   }
88
89   public boolean isShowNonconserved()
90   {
91     return showNonconserved;
92   }
93
94   public void setShowNonconserved(boolean showNonconserved)
95   {
96     this.showNonconserved = showNonconserved;
97   }
98
99   public int getStartRes()
100   {
101     return startRes;
102   }
103
104   public void setStartRes(int startRes)
105   {
106     this.startRes = startRes;
107   }
108
109   public int getEndRes()
110   {
111     return endRes;
112   }
113
114   public void setEndRes(int endRes)
115   {
116     this.endRes = endRes;
117   }
118
119   public ArrayList<String> getSequenceRefs()
120   {
121     return sequenceRefs;
122   }
123
124   public void setSequenceRefs(ArrayList<String> sequenceRefs)
125   {
126     this.sequenceRefs = sequenceRefs;
127   }
128
129   public String getSvid()
130   {
131     return svid;
132   }
133
134 }