JAL-1641 added type to BioJSON sequence object and modified seqsHash to sequenceRefs...
[jalview.git] / src / jalview / json / binding / v1 / SequencePojo.java
1 package jalview.json.binding.v1;
2
3
4
5 public class SequencePojo
6 {
7   private String svid = "1.0";
8
9   private String seq;
10
11   private String name;
12
13   private String type;
14
15   private String id;
16
17   private int order;
18
19   private int start;
20
21   private int end;
22
23
24   public SequencePojo()
25   {
26   }
27
28   public SequencePojo(int start, int end, String id, String name, String seq)
29   {
30     this.id = id;
31     this.name = name;
32     this.seq = seq;
33   }
34   public String getSeq()
35   {
36     return seq;
37   }
38
39   public void setSeq(String seq)
40   {
41     this.seq = seq;
42   }
43
44   public String getName()
45   {
46
47     return name;
48   }
49
50   public void setName(String name)
51   {
52     this.name = name;
53   }
54
55   public String getId()
56   {
57     return id;
58   }
59
60   public void setId(String id)
61   {
62     this.id = id;
63   }
64
65   public int getStart()
66   {
67     return start;
68   }
69
70   public void setStart(int start)
71   {
72     this.start = start;
73   }
74
75   public int getEnd()
76   {
77     return end;
78   }
79
80   public void setEnd(int end)
81   {
82     this.end = end;
83   }
84
85   public int getOrder()
86   {
87     return order;
88   }
89
90   public void setOrder(int order)
91   {
92     this.order = order;
93   }
94
95   public String getSvid()
96   {
97     return svid;
98   }
99
100   public String getType()
101   {
102     return type;
103   }
104
105   public void setType(String type)
106   {
107     this.type = type;
108   }
109
110 }