src/jalview/math/MatrixI.java

   1 package jalview.math;
   2
   3 import java.io.PrintStream;
   4
   5 public interface MatrixI
   6 {
   7   /**
   8    * Answers the number of columns
   9    *
  10    * @return
  11    */
  12   int width();
  13
  14   /**
  15    * Answers the number of rows
  16    *
  17    * @return
  18    */
  19   int height();
  20
  21   /**
  22    * Answers the value at row i, column j
  23    *
  24    * @param i
  25    * @param j
  26    * @return
  27    */
  28   double getValue(int i, int j);
  29
  30   /**
  31    * Answers a copy of the values in the i'th row
  32    *
  33    * @return
  34    */
  35   double[] getRow(int i);
  36
  37   MatrixI copy();
  38
  39   MatrixI transpose();
  40
  41   MatrixI preMultiply(MatrixI m);
  42
  43   MatrixI postMultiply(MatrixI m);
  44
  45   double[] getD();
  46
  47   double[] getE();
  48
  49   void print(PrintStream ps, String format);
  50
  51   void printD(PrintStream ps, String format);
  52
  53   void printE(PrintStream ps, String format);
  54
  55   void tqli() throws Exception;
  56
  57   void tred();
  58
  59 }