src/jalview/schemabinding/version2/JSeqDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with\r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.schemabinding.version2;\r
   9 \r
  10 //---------------------------------/\r
  11 //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class JSeqDescriptor.\r
  18  *\r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class JSeqDescriptor\r
  22     extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl\r
  23 {\r
  24 \r
  25   //--------------------------/\r
  26   //- Class/Member Variables -/\r
  27   //--------------------------/\r
  28 \r
  29   /**\r
  30    * Field nsPrefix\r
  31    */\r
  32   private java.lang.String nsPrefix;\r
  33 \r
  34   /**\r
  35    * Field nsURI\r
  36    */\r
  37   private java.lang.String nsURI;\r
  38 \r
  39   /**\r
  40    * Field xmlName\r
  41    */\r
  42   private java.lang.String xmlName;\r
  43 \r
  44   /**\r
  45    * Field identity\r
  46    */\r
  47   private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
  48 \r
  49   //----------------/\r
  50   //- Constructors -/\r
  51   //----------------/\r
  52 \r
  53   public JSeqDescriptor()\r
  54   {\r
  55     super();\r
  56     nsURI = "www.jalview.org";\r
  57     xmlName = "JSeq";\r
  58 \r
  59     //-- set grouping compositor\r
  60     setCompositorAsSequence();\r
  61     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;\r
  62     org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler handler = null;\r
  63     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;\r
  64     //-- initialize attribute descriptors\r
  65 \r
  66     //-- _colour\r
  67     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
  68         Integer.TYPE, "_colour", "colour",\r
  69         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  70     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
  71     {\r
  72       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
  73           throws IllegalStateException\r
  74       {\r
  75         JSeq target = (JSeq) object;\r
  76         if (!target.hasColour())\r
  77         {\r
  78           return null;\r
  79         }\r
  80         return new java.lang.Integer(target.getColour());\r
  81       }\r
  82 \r
  83       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
  84           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  85       {\r
  86         try\r
  87         {\r
  88           JSeq target = (JSeq) object;\r
  89           // if null, use delete method for optional primitives\r
  90           if (value == null)\r
  91           {\r
  92             target.deleteColour();\r
  93             return;\r
  94           }\r
  95           target.setColour( ( (java.lang.Integer) value).intValue());\r
  96         }\r
  97         catch (java.lang.Exception ex)\r
  98         {\r
  99           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 100         }\r
 101       }\r
 102 \r
 103       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 104       {\r
 105         return null;\r
 106       }\r
 107     });\r
 108     desc.setHandler(handler);\r
 109     addFieldDescriptor(desc);\r
 110 \r
 111     //-- validation code for: _colour\r
 112     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 113     { //-- local scope\r
 114       IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
 115       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 116     }\r
 117     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 118     //-- _start\r
 119     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 120         Integer.TYPE, "_start", "start",\r
 121         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 122     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 123     {\r
 124       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 125           throws IllegalStateException\r
 126       {\r
 127         JSeq target = (JSeq) object;\r
 128         if (!target.hasStart())\r
 129         {\r
 130           return null;\r
 131         }\r
 132         return new java.lang.Integer(target.getStart());\r
 133       }\r
 134 \r
 135       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 136           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 137       {\r
 138         try\r
 139         {\r
 140           JSeq target = (JSeq) object;\r
 141           // ignore null values for non optional primitives\r
 142           if (value == null)\r
 143           {\r
 144             return;\r
 145           }\r
 146 \r
 147           target.setStart( ( (java.lang.Integer) value).intValue());\r
 148         }\r
 149         catch (java.lang.Exception ex)\r
 150         {\r
 151           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 152         }\r
 153       }\r
 154 \r
 155       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 156       {\r
 157         return null;\r
 158       }\r
 159     });\r
 160     desc.setHandler(handler);\r
 161     desc.setRequired(true);\r
 162     addFieldDescriptor(desc);\r
 163 \r
 164     //-- validation code for: _start\r
 165     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 166     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 167     { //-- local scope\r
 168       IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
 169       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 170     }\r
 171     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 172     //-- _end\r
 173     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 174         Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 175     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 176     {\r
 177       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 178           throws IllegalStateException\r
 179       {\r
 180         JSeq target = (JSeq) object;\r
 181         if (!target.hasEnd())\r
 182         {\r
 183           return null;\r
 184         }\r
 185         return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
 186       }\r
 187 \r
 188       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 189           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 190       {\r
 191         try\r
 192         {\r
 193           JSeq target = (JSeq) object;\r
 194           // ignore null values for non optional primitives\r
 195           if (value == null)\r
 196           {\r
 197             return;\r
 198           }\r
 199 \r
 200           target.setEnd( ( (java.lang.Integer) value).intValue());\r
 201         }\r
 202         catch (java.lang.Exception ex)\r
 203         {\r
 204           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 205         }\r
 206       }\r
 207 \r
 208       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 209       {\r
 210         return null;\r
 211       }\r
 212     });\r
 213     desc.setHandler(handler);\r
 214     desc.setRequired(true);\r
 215     addFieldDescriptor(desc);\r
 216 \r
 217     //-- validation code for: _end\r
 218     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 219     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 220     { //-- local scope\r
 221       IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
 222       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 223     }\r
 224     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 225     //-- _id\r
 226     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 227         Integer.TYPE, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 228     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 229     {\r
 230       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 231           throws IllegalStateException\r
 232       {\r
 233         JSeq target = (JSeq) object;\r
 234         if (!target.hasId())\r
 235         {\r
 236           return null;\r
 237         }\r
 238         return new java.lang.Integer(target.getId());\r
 239       }\r
 240 \r
 241       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 242           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 243       {\r
 244         try\r
 245         {\r
 246           JSeq target = (JSeq) object;\r
 247           // ignore null values for non optional primitives\r
 248           if (value == null)\r
 249           {\r
 250             return;\r
 251           }\r
 252 \r
 253           target.setId( ( (java.lang.Integer) value).intValue());\r
 254         }\r
 255         catch (java.lang.Exception ex)\r
 256         {\r
 257           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 258         }\r
 259       }\r
 260 \r
 261       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 262       {\r
 263         return null;\r
 264       }\r
 265     });\r
 266     desc.setHandler(handler);\r
 267     desc.setRequired(true);\r
 268     addFieldDescriptor(desc);\r
 269 \r
 270     //-- validation code for: _id\r
 271     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 272     fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 273     { //-- local scope\r
 274       IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
 275       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 276     }\r
 277     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 278     //-- _hidden\r
 279     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 280         Boolean.TYPE, "_hidden", "hidden",\r
 281         org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 282     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 283     {\r
 284       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 285           throws IllegalStateException\r
 286       {\r
 287         JSeq target = (JSeq) object;\r
 288         if (!target.hasHidden())\r
 289         {\r
 290           return null;\r
 291         }\r
 292         return (target.getHidden() ? java.lang.Boolean.TRUE :\r
 293                 java.lang.Boolean.FALSE);\r
 294       }\r
 295 \r
 296       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 297           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 298       {\r
 299         try\r
 300         {\r
 301           JSeq target = (JSeq) object;\r
 302           // if null, use delete method for optional primitives\r
 303           if (value == null)\r
 304           {\r
 305             target.deleteHidden();\r
 306             return;\r
 307           }\r
 308           target.setHidden( ( (java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 309         }\r
 310         catch (java.lang.Exception ex)\r
 311         {\r
 312           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 313         }\r
 314       }\r
 315 \r
 316       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 317       {\r
 318         return null;\r
 319       }\r
 320     });\r
 321     desc.setHandler(handler);\r
 322     addFieldDescriptor(desc);\r
 323 \r
 324     //-- validation code for: _hidden\r
 325     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 326     { //-- local scope\r
 327       BooleanValidator typeValidator = new BooleanValidator();\r
 328       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 329     }\r
 330     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 331     //-- initialize element descriptors\r
 332 \r
 333     //-- _featuresList\r
 334     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.\r
 335         schemabinding.version2.Features.class, "_featuresList", "features",\r
 336         org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 337     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 338     {\r
 339       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 340           throws IllegalStateException\r
 341       {\r
 342         JSeq target = (JSeq) object;\r
 343         return target.getFeatures();\r
 344       }\r
 345 \r
 346       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 347           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 348       {\r
 349         try\r
 350         {\r
 351           JSeq target = (JSeq) object;\r
 352           target.addFeatures( (jalview.schemabinding.version2.Features) value);\r
 353         }\r
 354         catch (java.lang.Exception ex)\r
 355         {\r
 356           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 357         }\r
 358       }\r
 359 \r
 360       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 361       {\r
 362         return new jalview.schemabinding.version2.Features();\r
 363       }\r
 364     });\r
 365     desc.setHandler(handler);\r
 366     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 367     desc.setMultivalued(true);\r
 368     addFieldDescriptor(desc);\r
 369 \r
 370     //-- validation code for: _featuresList\r
 371     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 372     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 373     { //-- local scope\r
 374     }\r
 375     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 376     //-- _pdbidsList\r
 377     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(jalview.\r
 378         schemabinding.version2.Pdbids.class, "_pdbidsList", "pdbids",\r
 379         org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 380     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 381     {\r
 382       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 383           throws IllegalStateException\r
 384       {\r
 385         JSeq target = (JSeq) object;\r
 386         return target.getPdbids();\r
 387       }\r
 388 \r
 389       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 390           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 391       {\r
 392         try\r
 393         {\r
 394           JSeq target = (JSeq) object;\r
 395           target.addPdbids( (jalview.schemabinding.version2.Pdbids) value);\r
 396         }\r
 397         catch (java.lang.Exception ex)\r
 398         {\r
 399           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 400         }\r
 401       }\r
 402 \r
 403       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 404       {\r
 405         return new jalview.schemabinding.version2.Pdbids();\r
 406       }\r
 407     });\r
 408     desc.setHandler(handler);\r
 409     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 410     desc.setMultivalued(true);\r
 411     addFieldDescriptor(desc);\r
 412 \r
 413     //-- validation code for: _pdbidsList\r
 414     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 415     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 416     { //-- local scope\r
 417     }\r
 418     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 419     //-- _hiddenSequencesList\r
 420     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.\r
 421         Integer.TYPE, "_hiddenSequencesList", "hiddenSequences",\r
 422         org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 423     handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()\r
 424     {\r
 425       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)\r
 426           throws IllegalStateException\r
 427       {\r
 428         JSeq target = (JSeq) object;\r
 429         return target.getHiddenSequences();\r
 430       }\r
 431 \r
 432       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)\r
 433           throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 434       {\r
 435         try\r
 436         {\r
 437           JSeq target = (JSeq) object;\r
 438           // ignore null values for non optional primitives\r
 439           if (value == null)\r
 440           {\r
 441             return;\r
 442           }\r
 443 \r
 444           target.addHiddenSequences( ( (java.lang.Integer) value).intValue());\r
 445         }\r
 446         catch (java.lang.Exception ex)\r
 447         {\r
 448           throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 449         }\r
 450       }\r
 451 \r
 452       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)\r
 453       {\r
 454         return null;\r
 455       }\r
 456     });\r
 457     desc.setHandler(handler);\r
 458     desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 459     desc.setMultivalued(true);\r
 460     addFieldDescriptor(desc);\r
 461 \r
 462     //-- validation code for: _hiddenSequencesList\r
 463     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 464     fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 465     { //-- local scope\r
 466       IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
 467       fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 468     }\r
 469     desc.setValidator(fieldValidator);\r
 470   } //-- jalview.schemabinding.version2.JSeqDescriptor()\r
 471 \r
 472   //-----------/\r
 473   //- Methods -/\r
 474   //-----------/\r
 475 \r
 476   /**\r
 477    * Method getAccessMode\r
 478    *\r
 479    *\r
 480    *\r
 481    * @return AccessMode\r
 482    */\r
 483   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 484   {\r
 485     return null;\r
 486   } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
 487 \r
 488   /**\r
 489    * Method getExtends\r
 490    *\r
 491    *\r
 492    *\r
 493    * @return ClassDescriptor\r
 494    */\r
 495   public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 496   {\r
 497     return null;\r
 498   } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
 499 \r
 500   /**\r
 501    * Method getIdentity\r
 502    *\r
 503    *\r
 504    *\r
 505    * @return FieldDescriptor\r
 506    */\r
 507   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 508   {\r
 509     return identity;\r
 510   } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
 511 \r
 512   /**\r
 513    * Method getJavaClass\r
 514    *\r
 515    *\r
 516    *\r
 517    * @return Class\r
 518    */\r
 519   public java.lang.Class getJavaClass()\r
 520   {\r
 521     return jalview.schemabinding.version2.JSeq.class;\r
 522   } //-- java.lang.Class getJavaClass()\r
 523 \r
 524   /**\r
 525    * Method getNameSpacePrefix\r
 526    *\r
 527    *\r
 528    *\r
 529    * @return String\r
 530    */\r
 531   public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 532   {\r
 533     return nsPrefix;\r
 534   } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
 535 \r
 536   /**\r
 537    * Method getNameSpaceURI\r
 538    *\r
 539    *\r
 540    *\r
 541    * @return String\r
 542    */\r
 543   public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 544   {\r
 545     return nsURI;\r
 546   } //-- java.lang.String getNameSpaceURI()\r
 547 \r
 548   /**\r
 549    * Method getValidator\r
 550    *\r
 551    *\r
 552    *\r
 553    * @return TypeValidator\r
 554    */\r
 555   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 556   {\r
 557     return this;\r
 558   } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
 559 \r
 560   /**\r
 561    * Method getXMLName\r
 562    *\r
 563    *\r
 564    *\r
 565    * @return String\r
 566    */\r
 567   public java.lang.String getXMLName()\r
 568   {\r
 569     return xmlName;\r
 570   } //-- java.lang.String getXMLName()\r
 571 \r
 572 }\r