src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/JGroupDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;\r
  20 \r
  21   //---------------------------------/\r
  22  //- Imported classes and packages -/\r
  23 //---------------------------------/\r
  24 \r
  25 import jalview.schemabinding.version2.JGroup;\r
  26 \r
  27 /**\r
  28  * Class JGroupDescriptor.\r
  29  * \r
  30  * @version $Revision$ $Date$\r
  31  */\r
  32 public class JGroupDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
  33 \r
  34 \r
  35       //--------------------------/\r
  36      //- Class/Member Variables -/\r
  37     //--------------------------/\r
  38 \r
  39     /**\r
  40      * Field _elementDefinition.\r
  41      */\r
  42     private boolean _elementDefinition;\r
  43 \r
  44     /**\r
  45      * Field _nsPrefix.\r
  46      */\r
  47     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  48 \r
  49     /**\r
  50      * Field _nsURI.\r
  51      */\r
  52     private java.lang.String _nsURI;\r
  53 \r
  54     /**\r
  55      * Field _xmlName.\r
  56      */\r
  57     private java.lang.String _xmlName;\r
  58 \r
  59 \r
  60       //----------------/\r
  61      //- Constructors -/\r
  62     //----------------/\r
  63 \r
  64     public JGroupDescriptor() {\r
  65         super();\r
  66         _nsURI = "www.jalview.org";\r
  67         _xmlName = "JGroup";\r
  68         _elementDefinition = true;\r
  69         \r
  70         //-- set grouping compositor\r
  71         setCompositorAsSequence();\r
  72         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  73         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  74         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  75         //-- initialize attribute descriptors\r
  76         \r
  77         //-- _start\r
  78         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_start", "start", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  79         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  80             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  81                 throws IllegalStateException\r
  82             {\r
  83                 JGroup target = (JGroup) object;\r
  84                 if (!target.hasStart()) { return null; }\r
  85                 return new java.lang.Integer(target.getStart());\r
  86             }\r
  87             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  88                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  89             {\r
  90                 try {\r
  91                     JGroup target = (JGroup) object;\r
  92                     // if null, use delete method for optional primitives \r
  93                     if (value == null) {\r
  94                         target.deleteStart();\r
  95                         return;\r
  96                     }\r
  97                     target.setStart( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
  98                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  99                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 100                 }\r
 101             }\r
 102             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 103                 return null;\r
 104             }\r
 105         };\r
 106         desc.setHandler(handler);\r
 107         desc.setMultivalued(false);\r
 108         addFieldDescriptor(desc);\r
 109         \r
 110         //-- validation code for: _start\r
 111         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 112         { //-- local scope\r
 113             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 114             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 115             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 116             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 117             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 118         }\r
 119         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 120         //-- _end\r
 121         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 122         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 123             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 124                 throws IllegalStateException\r
 125             {\r
 126                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 127                 if (!target.hasEnd()) { return null; }\r
 128                 return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
 129             }\r
 130             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 131                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 132             {\r
 133                 try {\r
 134                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 135                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 136                     if (value == null) {\r
 137                         target.deleteEnd();\r
 138                         return;\r
 139                     }\r
 140                     target.setEnd( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 141                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 142                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 143                 }\r
 144             }\r
 145             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 146                 return null;\r
 147             }\r
 148         };\r
 149         desc.setHandler(handler);\r
 150         desc.setMultivalued(false);\r
 151         addFieldDescriptor(desc);\r
 152         \r
 153         //-- validation code for: _end\r
 154         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 155         { //-- local scope\r
 156             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 157             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 158             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 159             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 160             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 161         }\r
 162         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 163         //-- _name\r
 164         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_name", "name", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 165         desc.setImmutable(true);\r
 166         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 167             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 168                 throws IllegalStateException\r
 169             {\r
 170                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 171                 return target.getName();\r
 172             }\r
 173             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 174                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 175             {\r
 176                 try {\r
 177                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 178                     target.setName( (java.lang.String) value);\r
 179                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 180                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 181                 }\r
 182             }\r
 183             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 184                 return null;\r
 185             }\r
 186         };\r
 187         desc.setHandler(handler);\r
 188         desc.setMultivalued(false);\r
 189         addFieldDescriptor(desc);\r
 190         \r
 191         //-- validation code for: _name\r
 192         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 193         { //-- local scope\r
 194             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 195             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 196             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 197             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 198         }\r
 199         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 200         //-- _colour\r
 201         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_colour", "colour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 202         desc.setImmutable(true);\r
 203         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 204             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 205                 throws IllegalStateException\r
 206             {\r
 207                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 208                 return target.getColour();\r
 209             }\r
 210             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 211                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 212             {\r
 213                 try {\r
 214                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 215                     target.setColour( (java.lang.String) value);\r
 216                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 217                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 218                 }\r
 219             }\r
 220             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 221                 return null;\r
 222             }\r
 223         };\r
 224         desc.setHandler(handler);\r
 225         desc.setMultivalued(false);\r
 226         addFieldDescriptor(desc);\r
 227         \r
 228         //-- validation code for: _colour\r
 229         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 230         { //-- local scope\r
 231             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 232             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 233             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 234             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 235         }\r
 236         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 237         //-- _consThreshold\r
 238         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_consThreshold", "consThreshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 239         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 240             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 241                 throws IllegalStateException\r
 242             {\r
 243                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 244                 if (!target.hasConsThreshold()) { return null; }\r
 245                 return new java.lang.Integer(target.getConsThreshold());\r
 246             }\r
 247             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 248                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 249             {\r
 250                 try {\r
 251                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 252                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 253                     if (value == null) {\r
 254                         target.deleteConsThreshold();\r
 255                         return;\r
 256                     }\r
 257                     target.setConsThreshold( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 258                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 259                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 260                 }\r
 261             }\r
 262             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 263                 return null;\r
 264             }\r
 265         };\r
 266         desc.setHandler(handler);\r
 267         desc.setMultivalued(false);\r
 268         addFieldDescriptor(desc);\r
 269         \r
 270         //-- validation code for: _consThreshold\r
 271         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 272         { //-- local scope\r
 273             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 274             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 275             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 276             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 277             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 278         }\r
 279         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 280         //-- _pidThreshold\r
 281         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_pidThreshold", "pidThreshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 282         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 283             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 284                 throws IllegalStateException\r
 285             {\r
 286                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 287                 if (!target.hasPidThreshold()) { return null; }\r
 288                 return new java.lang.Integer(target.getPidThreshold());\r
 289             }\r
 290             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 291                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 292             {\r
 293                 try {\r
 294                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 295                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 296                     if (value == null) {\r
 297                         target.deletePidThreshold();\r
 298                         return;\r
 299                     }\r
 300                     target.setPidThreshold( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 301                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 302                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 303                 }\r
 304             }\r
 305             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 306                 return null;\r
 307             }\r
 308         };\r
 309         desc.setHandler(handler);\r
 310         desc.setMultivalued(false);\r
 311         addFieldDescriptor(desc);\r
 312         \r
 313         //-- validation code for: _pidThreshold\r
 314         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 315         { //-- local scope\r
 316             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 317             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 318             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 319             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 320             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 321         }\r
 322         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 323         //-- _outlineColour\r
 324         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_outlineColour", "outlineColour", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 325         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 326             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 327                 throws IllegalStateException\r
 328             {\r
 329                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 330                 if (!target.hasOutlineColour()) { return null; }\r
 331                 return new java.lang.Integer(target.getOutlineColour());\r
 332             }\r
 333             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 334                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 335             {\r
 336                 try {\r
 337                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 338                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 339                     if (value == null) {\r
 340                         target.deleteOutlineColour();\r
 341                         return;\r
 342                     }\r
 343                     target.setOutlineColour( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 344                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 345                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 346                 }\r
 347             }\r
 348             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 349                 return null;\r
 350             }\r
 351         };\r
 352         desc.setHandler(handler);\r
 353         desc.setMultivalued(false);\r
 354         addFieldDescriptor(desc);\r
 355         \r
 356         //-- validation code for: _outlineColour\r
 357         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 358         { //-- local scope\r
 359             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 360             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 361             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 362             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 363             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 364         }\r
 365         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 366         //-- _displayBoxes\r
 367         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_displayBoxes", "displayBoxes", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 368         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 369             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 370                 throws IllegalStateException\r
 371             {\r
 372                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 373                 if (!target.hasDisplayBoxes()) { return null; }\r
 374                 return (target.getDisplayBoxes() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 375             }\r
 376             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 377                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 378             {\r
 379                 try {\r
 380                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 381                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 382                     if (value == null) {\r
 383                         target.deleteDisplayBoxes();\r
 384                         return;\r
 385                     }\r
 386                     target.setDisplayBoxes( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 387                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 388                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 389                 }\r
 390             }\r
 391             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 392                 return null;\r
 393             }\r
 394         };\r
 395         desc.setHandler(handler);\r
 396         desc.setMultivalued(false);\r
 397         addFieldDescriptor(desc);\r
 398         \r
 399         //-- validation code for: _displayBoxes\r
 400         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 401         { //-- local scope\r
 402             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 403             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 404             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 405         }\r
 406         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 407         //-- _displayText\r
 408         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_displayText", "displayText", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 409         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 410             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 411                 throws IllegalStateException\r
 412             {\r
 413                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 414                 if (!target.hasDisplayText()) { return null; }\r
 415                 return (target.getDisplayText() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 416             }\r
 417             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 418                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 419             {\r
 420                 try {\r
 421                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 422                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 423                     if (value == null) {\r
 424                         target.deleteDisplayText();\r
 425                         return;\r
 426                     }\r
 427                     target.setDisplayText( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 428                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 429                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 430                 }\r
 431             }\r
 432             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 433                 return null;\r
 434             }\r
 435         };\r
 436         desc.setHandler(handler);\r
 437         desc.setMultivalued(false);\r
 438         addFieldDescriptor(desc);\r
 439         \r
 440         //-- validation code for: _displayText\r
 441         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 442         { //-- local scope\r
 443             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 444             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 445             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 446         }\r
 447         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 448         //-- _colourText\r
 449         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_colourText", "colourText", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 450         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 451             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 452                 throws IllegalStateException\r
 453             {\r
 454                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 455                 if (!target.hasColourText()) { return null; }\r
 456                 return (target.getColourText() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 457             }\r
 458             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 459                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 460             {\r
 461                 try {\r
 462                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 463                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 464                     if (value == null) {\r
 465                         target.deleteColourText();\r
 466                         return;\r
 467                     }\r
 468                     target.setColourText( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 469                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 470                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 471                 }\r
 472             }\r
 473             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 474                 return null;\r
 475             }\r
 476         };\r
 477         desc.setHandler(handler);\r
 478         desc.setMultivalued(false);\r
 479         addFieldDescriptor(desc);\r
 480         \r
 481         //-- validation code for: _colourText\r
 482         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 483         { //-- local scope\r
 484             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 485             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 486             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 487         }\r
 488         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 489         //-- _textCol1\r
 490         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_textCol1", "textCol1", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 491         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 492             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 493                 throws IllegalStateException\r
 494             {\r
 495                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 496                 if (!target.hasTextCol1()) { return null; }\r
 497                 return new java.lang.Integer(target.getTextCol1());\r
 498             }\r
 499             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 500                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 501             {\r
 502                 try {\r
 503                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 504                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 505                     if (value == null) {\r
 506                         target.deleteTextCol1();\r
 507                         return;\r
 508                     }\r
 509                     target.setTextCol1( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 510                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 511                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 512                 }\r
 513             }\r
 514             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 515                 return null;\r
 516             }\r
 517         };\r
 518         desc.setHandler(handler);\r
 519         desc.setMultivalued(false);\r
 520         addFieldDescriptor(desc);\r
 521         \r
 522         //-- validation code for: _textCol1\r
 523         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 524         { //-- local scope\r
 525             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 526             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 527             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 528             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 529             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 530         }\r
 531         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 532         //-- _textCol2\r
 533         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_textCol2", "textCol2", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 534         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 535             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 536                 throws IllegalStateException\r
 537             {\r
 538                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 539                 if (!target.hasTextCol2()) { return null; }\r
 540                 return new java.lang.Integer(target.getTextCol2());\r
 541             }\r
 542             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 543                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 544             {\r
 545                 try {\r
 546                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 547                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 548                     if (value == null) {\r
 549                         target.deleteTextCol2();\r
 550                         return;\r
 551                     }\r
 552                     target.setTextCol2( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 553                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 554                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 555                 }\r
 556             }\r
 557             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 558                 return null;\r
 559             }\r
 560         };\r
 561         desc.setHandler(handler);\r
 562         desc.setMultivalued(false);\r
 563         addFieldDescriptor(desc);\r
 564         \r
 565         //-- validation code for: _textCol2\r
 566         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 567         { //-- local scope\r
 568             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 569             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 570             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 571             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 572             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 573         }\r
 574         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 575         //-- _textColThreshold\r
 576         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_textColThreshold", "textColThreshold", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 577         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 578             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 579                 throws IllegalStateException\r
 580             {\r
 581                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 582                 if (!target.hasTextColThreshold()) { return null; }\r
 583                 return new java.lang.Integer(target.getTextColThreshold());\r
 584             }\r
 585             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 586                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 587             {\r
 588                 try {\r
 589                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 590                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 591                     if (value == null) {\r
 592                         target.deleteTextColThreshold();\r
 593                         return;\r
 594                     }\r
 595                     target.setTextColThreshold( ((java.lang.Integer) value).intValue());\r
 596                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 597                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 598                 }\r
 599             }\r
 600             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 601                 return null;\r
 602             }\r
 603         };\r
 604         desc.setHandler(handler);\r
 605         desc.setMultivalued(false);\r
 606         addFieldDescriptor(desc);\r
 607         \r
 608         //-- validation code for: _textColThreshold\r
 609         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 610         { //-- local scope\r
 611             org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator typeValidator;\r
 612             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IntValidator();\r
 613             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 614             typeValidator.setMinInclusive(-2147483648);\r
 615             typeValidator.setMaxInclusive(2147483647);\r
 616         }\r
 617         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 618         //-- _showUnconserved\r
 619         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_showUnconserved", "showUnconserved", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 620         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 621             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 622                 throws IllegalStateException\r
 623             {\r
 624                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 625                 if (!target.hasShowUnconserved()) { return null; }\r
 626                 return (target.getShowUnconserved() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 627             }\r
 628             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 629                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 630             {\r
 631                 try {\r
 632                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 633                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 634                     if (value == null) {\r
 635                         target.deleteShowUnconserved();\r
 636                         return;\r
 637                     }\r
 638                     target.setShowUnconserved( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 639                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 640                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 641                 }\r
 642             }\r
 643             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 644                 return null;\r
 645             }\r
 646         };\r
 647         desc.setHandler(handler);\r
 648         desc.setMultivalued(false);\r
 649         addFieldDescriptor(desc);\r
 650         \r
 651         //-- validation code for: _showUnconserved\r
 652         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 653         { //-- local scope\r
 654             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 655             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 656             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 657         }\r
 658         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 659         //-- _ignoreGapsinConsensus\r
 660         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_ignoreGapsinConsensus", "ignoreGapsinConsensus", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 661         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 662             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 663                 throws IllegalStateException\r
 664             {\r
 665                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 666                 if (!target.hasIgnoreGapsinConsensus()) { return null; }\r
 667                 return (target.getIgnoreGapsinConsensus() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 668             }\r
 669             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 670                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 671             {\r
 672                 try {\r
 673                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 674                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 675                     if (value == null) {\r
 676                         target.deleteIgnoreGapsinConsensus();\r
 677                         return;\r
 678                     }\r
 679                     target.setIgnoreGapsinConsensus( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 680                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 681                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 682                 }\r
 683             }\r
 684             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 685                 return null;\r
 686             }\r
 687         };\r
 688         desc.setHandler(handler);\r
 689         desc.setMultivalued(false);\r
 690         addFieldDescriptor(desc);\r
 691         \r
 692         //-- validation code for: _ignoreGapsinConsensus\r
 693         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 694         { //-- local scope\r
 695             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 696             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 697             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 698         }\r
 699         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 700         //-- _showConsensusHistogram\r
 701         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_showConsensusHistogram", "showConsensusHistogram", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 702         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 703             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 704                 throws IllegalStateException\r
 705             {\r
 706                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 707                 if (!target.hasShowConsensusHistogram()) { return null; }\r
 708                 return (target.getShowConsensusHistogram() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 709             }\r
 710             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 711                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 712             {\r
 713                 try {\r
 714                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 715                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 716                     if (value == null) {\r
 717                         target.deleteShowConsensusHistogram();\r
 718                         return;\r
 719                     }\r
 720                     target.setShowConsensusHistogram( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 721                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 722                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 723                 }\r
 724             }\r
 725             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 726                 return null;\r
 727             }\r
 728         };\r
 729         desc.setHandler(handler);\r
 730         desc.setMultivalued(false);\r
 731         addFieldDescriptor(desc);\r
 732         \r
 733         //-- validation code for: _showConsensusHistogram\r
 734         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 735         { //-- local scope\r
 736             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 737             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 738             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 739         }\r
 740         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 741         //-- _showSequenceLogo\r
 742         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_showSequenceLogo", "showSequenceLogo", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 743         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 744             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 745                 throws IllegalStateException\r
 746             {\r
 747                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 748                 if (!target.hasShowSequenceLogo()) { return null; }\r
 749                 return (target.getShowSequenceLogo() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
 750             }\r
 751             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 752                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 753             {\r
 754                 try {\r
 755                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 756                     // if null, use delete method for optional primitives \r
 757                     if (value == null) {\r
 758                         target.deleteShowSequenceLogo();\r
 759                         return;\r
 760                     }\r
 761                     target.setShowSequenceLogo( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
 762                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 763                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 764                 }\r
 765             }\r
 766             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 767                 return null;\r
 768             }\r
 769         };\r
 770         desc.setHandler(handler);\r
 771         desc.setMultivalued(false);\r
 772         addFieldDescriptor(desc);\r
 773         \r
 774         //-- validation code for: _showSequenceLogo\r
 775         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 776         { //-- local scope\r
 777             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 778             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 779             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 780         }\r
 781         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 782         //-- _id\r
 783         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 784         desc.setImmutable(true);\r
 785         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 786             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 787                 throws IllegalStateException\r
 788             {\r
 789                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 790                 return target.getId();\r
 791             }\r
 792             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 793                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 794             {\r
 795                 try {\r
 796                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 797                     target.setId( (java.lang.String) value);\r
 798                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 799                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 800                 }\r
 801             }\r
 802             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 803                 return null;\r
 804             }\r
 805         };\r
 806         desc.setHandler(handler);\r
 807         desc.setMultivalued(false);\r
 808         addFieldDescriptor(desc);\r
 809         \r
 810         //-- validation code for: _id\r
 811         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 812         { //-- local scope\r
 813             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 814             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 815             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 816             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 817         }\r
 818         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 819         //-- initialize element descriptors\r
 820         \r
 821         //-- _seqList\r
 822         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_seqList", "seq", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 823         desc.setImmutable(true);\r
 824         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 825             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 826                 throws IllegalStateException\r
 827             {\r
 828                 JGroup target = (JGroup) object;\r
 829                 return target.getSeq();\r
 830             }\r
 831             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 832                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 833             {\r
 834                 try {\r
 835                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 836                     target.addSeq( (java.lang.String) value);\r
 837                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 838                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 839                 }\r
 840             }\r
 841             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 842                 try {\r
 843                     JGroup target = (JGroup) object;\r
 844                     target.removeAllSeq();\r
 845                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 846                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 847                 }\r
 848             }\r
 849             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 850                 return null;\r
 851             }\r
 852         };\r
 853         desc.setHandler(handler);\r
 854         desc.setNameSpaceURI("www.jalview.org");\r
 855         desc.setRequired(true);\r
 856         desc.setMultivalued(true);\r
 857         addFieldDescriptor(desc);\r
 858         \r
 859         //-- validation code for: _seqList\r
 860         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 861         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 862         { //-- local scope\r
 863             org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;\r
 864             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();\r
 865             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 866             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
 867         }\r
 868         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 869     }\r
 870 \r
 871 \r
 872       //-----------/\r
 873      //- Methods -/\r
 874     //-----------/\r
 875 \r
 876     /**\r
 877      * Method getAccessMode.\r
 878      * \r
 879      * @return the access mode specified for this class.\r
 880      */\r
 881     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 882     ) {\r
 883         return null;\r
 884     }\r
 885 \r
 886     /**\r
 887      * Method getIdentity.\r
 888      * \r
 889      * @return the identity field, null if this class has no\r
 890      * identity.\r
 891      */\r
 892     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 893     ) {\r
 894         return super.getIdentity();\r
 895     }\r
 896 \r
 897     /**\r
 898      * Method getJavaClass.\r
 899      * \r
 900      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 901      */\r
 902     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 903     ) {\r
 904         return jalview.schemabinding.version2.JGroup.class;\r
 905     }\r
 906 \r
 907     /**\r
 908      * Method getNameSpacePrefix.\r
 909      * \r
 910      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 911      */\r
 912     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 913     ) {\r
 914         return _nsPrefix;\r
 915     }\r
 916 \r
 917     /**\r
 918      * Method getNameSpaceURI.\r
 919      * \r
 920      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 921      * unmarshaling as XML.\r
 922      */\r
 923     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 924     ) {\r
 925         return _nsURI;\r
 926     }\r
 927 \r
 928     /**\r
 929      * Method getValidator.\r
 930      * \r
 931      * @return a specific validator for the class described by this\r
 932      * ClassDescriptor.\r
 933      */\r
 934     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 935     ) {\r
 936         return this;\r
 937     }\r
 938 \r
 939     /**\r
 940      * Method getXMLName.\r
 941      * \r
 942      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 943      */\r
 944     public java.lang.String getXMLName(\r
 945     ) {\r
 946         return _xmlName;\r
 947     }\r
 948 \r
 949     /**\r
 950      * Method isElementDefinition.\r
 951      * \r
 952      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 953      * of a global\r
 954      * element or element with anonymous type definition.\r
 955      */\r
 956     public boolean isElementDefinition(\r
 957     ) {\r
 958         return _elementDefinition;\r
 959     }\r
 960 \r
 961 }\r