src/jalview/schemabinding/version2/descriptors/SequenceDescriptor.java

   1 /*
   2  * This class was automatically generated with
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML
   4  * Schema.
   5  * $Id$
   6  */
   7
   8 package jalview.schemabinding.version2.descriptors;
   9
  10 //---------------------------------/
  11 //- Imported classes and packages -/
  12 //---------------------------------/
  13
  14 import jalview.schemabinding.version2.Sequence;
  15
  16 /**
  17  * Class SequenceDescriptor.
  18  *
  19  * @version $Revision$ $Date$
  20  */
  21 public class SequenceDescriptor extends
  22         jalview.schemabinding.version2.descriptors.SequenceTypeDescriptor
  23 {
  24
  25   // --------------------------/
  26   // - Class/Member Variables -/
  27   // --------------------------/
  28
  29   /**
  30    * Field _elementDefinition.
  31    */
  32   private boolean _elementDefinition;
  33
  34   /**
  35    * Field _nsPrefix.
  36    */
  37   private java.lang.String _nsPrefix;
  38
  39   /**
  40    * Field _nsURI.
  41    */
  42   private java.lang.String _nsURI;
  43
  44   /**
  45    * Field _xmlName.
  46    */
  47   private java.lang.String _xmlName;
  48
  49   // ----------------/
  50   // - Constructors -/
  51   // ----------------/
  52
  53   public SequenceDescriptor()
  54   {
  55     super();
  56     setExtendsWithoutFlatten(new jalview.schemabinding.version2.descriptors.SequenceTypeDescriptor());
  57     _nsURI = "www.vamsas.ac.uk/jalview/version2";
  58     _xmlName = "Sequence";
  59     _elementDefinition = true;
  60
  61     // -- set grouping compositor
  62     setCompositorAsSequence();
  63     org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl desc = null;
  64     org.exolab.castor.mapping.FieldHandler handler = null;
  65     org.exolab.castor.xml.FieldValidator fieldValidator = null;
  66     // -- initialize attribute descriptors
  67
  68     // -- _dsseqid
  69     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
  70             java.lang.String.class, "_dsseqid", "dsseqid",
  71             org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);
  72     desc.setImmutable(true);
  73     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
  74     {
  75       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
  76               throws IllegalStateException
  77       {
  78         Sequence target = (Sequence) object;
  79         return target.getDsseqid();
  80       }
  81
  82       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
  83               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
  84       {
  85         try
  86         {
  87           Sequence target = (Sequence) object;
  88           target.setDsseqid((java.lang.String) value);
  89         } catch (java.lang.Exception ex)
  90         {
  91           throw new IllegalStateException(ex.toString());
  92         }
  93       }
  94
  95       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
  96       {
  97         return null;
  98       }
  99     };
 100     desc.setHandler(handler);
 101     desc.setMultivalued(false);
 102     addFieldDescriptor(desc);
 103
 104     // -- validation code for: _dsseqid
 105     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 106     { // -- local scope
 107       org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator typeValidator;
 108       typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.StringValidator();
 109       fieldValidator.setValidator(typeValidator);
 110       typeValidator.setWhiteSpace("preserve");
 111     }
 112     desc.setValidator(fieldValidator);
 113     // -- initialize element descriptors
 114
 115     // -- _DBRefList
 116     desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(
 117             jalview.schemabinding.version2.DBRef.class, "_DBRefList",
 118             "DBRef", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);
 119     handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler()
 120     {
 121       public java.lang.Object getValue(java.lang.Object object)
 122               throws IllegalStateException
 123       {
 124         Sequence target = (Sequence) object;
 125         return target.getDBRef();
 126       }
 127
 128       public void setValue(java.lang.Object object, java.lang.Object value)
 129               throws IllegalStateException, IllegalArgumentException
 130       {
 131         try
 132         {
 133           Sequence target = (Sequence) object;
 134           target.addDBRef((jalview.schemabinding.version2.DBRef) value);
 135         } catch (java.lang.Exception ex)
 136         {
 137           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 138         }
 139       }
 140
 141       public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException,
 142               IllegalArgumentException
 143       {
 144         try
 145         {
 146           Sequence target = (Sequence) object;
 147           target.removeAllDBRef();
 148         } catch (java.lang.Exception ex)
 149         {
 150           throw new IllegalStateException(ex.toString());
 151         }
 152       }
 153
 154       public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent)
 155       {
 156         return new jalview.schemabinding.version2.DBRef();
 157       }
 158     };
 159     desc.setHandler(handler);
 160     desc.setNameSpaceURI("www.vamsas.ac.uk/jalview/version2");
 161     desc.setMultivalued(true);
 162     addFieldDescriptor(desc);
 163
 164     // -- validation code for: _DBRefList
 165     fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();
 166     fieldValidator.setMinOccurs(0);
 167     { // -- local scope
 168     }
 169     desc.setValidator(fieldValidator);
 170   }
 171
 172   // -----------/
 173   // - Methods -/
 174   // -----------/
 175
 176   /**
 177    * Method getAccessMode.
 178    *
 179    * @return the access mode specified for this class.
 180    */
 181   public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()
 182   {
 183     return null;
 184   }
 185
 186   /**
 187    * Method getIdentity.
 188    *
 189    * @return the identity field, null if this class has no identity.
 190    */
 191   public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()
 192   {
 193     return super.getIdentity();
 194   }
 195
 196   /**
 197    * Method getJavaClass.
 198    *
 199    * @return the Java class represented by this descriptor.
 200    */
 201   public java.lang.Class getJavaClass()
 202   {
 203     return jalview.schemabinding.version2.Sequence.class;
 204   }
 205
 206   /**
 207    * Method getNameSpacePrefix.
 208    *
 209    * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.
 210    */
 211   public java.lang.String getNameSpacePrefix()
 212   {
 213     return _nsPrefix;
 214   }
 215
 216   /**
 217    * Method getNameSpaceURI.
 218    *
 219    * @return the namespace URI used when marshaling and unmarshaling as XML.
 220    */
 221   public java.lang.String getNameSpaceURI()
 222   {
 223     return _nsURI;
 224   }
 225
 226   /**
 227    * Method getValidator.
 228    *
 229    * @return a specific validator for the class described by this
 230    *         ClassDescriptor.
 231    */
 232   public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()
 233   {
 234     return this;
 235   }
 236
 237   /**
 238    * Method getXMLName.
 239    *
 240    * @return the XML Name for the Class being described.
 241    */
 242   public java.lang.String getXMLName()
 243   {
 244     return _xmlName;
 245   }
 246
 247   /**
 248    * Method isElementDefinition.
 249    *
 250    * @return true if XML schema definition of this Class is that of a global
 251    *         element or element with anonymous type definition.
 252    */
 253   public boolean isElementDefinition()
 254   {
 255     return _elementDefinition;
 256   }
 257
 258 }