src/jalview/schemes/TaylorColourScheme.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.schemes;
  22
  23 import jalview.api.AlignViewportI;
  24 import jalview.datamodel.AnnotatedCollectionI;
  25
  26 public class TaylorColourScheme extends ResidueColourScheme
  27 {
  28   public TaylorColourScheme()
  29   {
  30     super(ResidueProperties.aaIndex, ResidueProperties.taylor);
  31   }
  32
  33   @Override
  34   public boolean isPeptideSpecific()
  35   {
  36     return true;
  37   }
  38
  39   @Override
  40   public String getSchemeName()
  41   {
  42     return JalviewColourScheme.Taylor.toString();
  43   }
  44
  45   /**
  46    * Returns a new instance of this colour scheme with which the given data may
  47    * be coloured
  48    */
  49   @Override
  50   public ColourSchemeI getInstance(AlignViewportI view,
  51           AnnotatedCollectionI coll)
  52   {
  53     return new TaylorColourScheme();
  54   }
  55 }