src/jalview/xml/binding/jalview/Mapping.java

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   7
   8
   9 package jalview.xml.binding.jalview;
  10
  11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlRootElement;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  16
  17
  18 /**
  19  *
  20  *                                      Represent the jalview.datamodel.Mapping object - it also provides
  21  *                                      a way of storing sequences that are mapped 'to' without adding them
  22  *                                      to the sequence set (which will mean they are then added to the alignment too).
  23  *
  24  *
  25  * <p>Java class for anonymous complex type.
  26  *
  27  * <p>The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  28  *
  29  * <pre>
  30  * &lt;complexType>
  31  *   &lt;complexContent>
  32  *     &lt;extension base="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}mapListType">
  33  *       &lt;sequence>
  34  *         &lt;choice minOccurs="0">
  35  *           &lt;element ref="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}Sequence"/>
  36  *           &lt;element name="dseqFor">
  37  *             &lt;simpleType>
  38  *               &lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
  39  *               &lt;/restriction>
  40  *             &lt;/simpleType>
  41  *           &lt;/element>
  42  *         &lt;/choice>
  43  *       &lt;/sequence>
  44  *     &lt;/extension>
  45  *   &lt;/complexContent>
  46  * &lt;/complexType>
  47  * </pre>
  48  *
  49  *
  50  */
  51 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  52 @XmlType(name = "", propOrder = {
  53     "sequence",
  54     "dseqFor"
  55 })
  56 @XmlRootElement(name = "Mapping")
  57 public class Mapping
  58     extends MapListType
  59 {
  60
  61     @XmlElement(name = "Sequence")
  62     protected Sequence sequence;
  63     protected String dseqFor;
  64
  65     /**
  66      * Gets the value of the sequence property.
  67      *
  68      * @return
  69      *     possible object is
  70      *     {@link Sequence }
  71      *
  72      */
  73     public Sequence getSequence() {
  74         return sequence;
  75     }
  76
  77     /**
  78      * Sets the value of the sequence property.
  79      *
  80      * @param value
  81      *     allowed object is
  82      *     {@link Sequence }
  83      *
  84      */
  85     public void setSequence(Sequence value) {
  86         this.sequence = value;
  87     }
  88
  89     /**
  90      * Gets the value of the dseqFor property.
  91      *
  92      * @return
  93      *     possible object is
  94      *     {@link String }
  95      *
  96      */
  97     public String getDseqFor() {
  98         return dseqFor;
  99     }
 100
 101     /**
 102      * Sets the value of the dseqFor property.
 103      *
 104      * @param value
 105      *     allowed object is
 106      *     {@link String }
 107      *
 108      */
 109     public void setDseqFor(String value) {
 110         this.dseqFor = value;
 111     }
 112
 113 }