src/jalview/xml/binding/jalview/ObjectFactory.java

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   7
   8
   9 package jalview.xml.binding.jalview;
  10
  11 import javax.xml.bind.JAXBElement;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlElementDecl;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlRegistry;
  14 import javax.xml.namespace.QName;
  15
  16
  17 /**
  18  * This object contains factory methods for each
  19  * Java content interface and Java element interface
  20  * generated in the jalview.xml.binding.jalview package.
  21  * <p>An ObjectFactory allows you to programatically
  22  * construct new instances of the Java representation
  23  * for XML content. The Java representation of XML
  24  * content can consist of schema derived interfaces
  25  * and classes representing the binding of schema
  26  * type definitions, element declarations and model
  27  * groups.  Factory methods for each of these are
  28  * provided in this class.
  29  *
  30  */
  31 @XmlRegistry
  32 public class ObjectFactory {
  33
  34     private final static QName _JalviewModel_QNAME = new QName("www.jalview.org", "JalviewModel");
  35
  36     /**
  37      * Create a new ObjectFactory that can be used to create new instances of schema derived classes for package: jalview.xml.binding.jalview
  38      *
  39      */
  40     public ObjectFactory() {
  41     }
  42
  43     /**
  44      * Create an instance of {@link AlcodonFrame }
  45      *
  46      */
  47     public AlcodonFrame createAlcodonFrame() {
  48         return new AlcodonFrame();
  49     }
  50
  51     /**
  52      * Create an instance of {@link MapListType }
  53      *
  54      */
  55     public MapListType createMapListType() {
  56         return new MapListType();
  57     }
  58
  59     /**
  60      * Create an instance of {@link Sequence }
  61      *
  62      */
  63     public Sequence createSequence() {
  64         return new Sequence();
  65     }
  66
  67     /**
  68      * Create an instance of {@link Annotation }
  69      *
  70      */
  71     public Annotation createAnnotation() {
  72         return new Annotation();
  73     }
  74
  75     /**
  76      * Create an instance of {@link SequenceSet }
  77      *
  78      */
  79     public SequenceSet createSequenceSet() {
  80         return new SequenceSet();
  81     }
  82
  83     /**
  84      * Create an instance of {@link FeatureMatcherSet }
  85      *
  86      */
  87     public FeatureMatcherSet createFeatureMatcherSet() {
  88         return new FeatureMatcherSet();
  89     }
  90
  91     /**
  92      * Create an instance of {@link JalviewUserColours }
  93      *
  94      */
  95     public JalviewUserColours createJalviewUserColours() {
  96         return new JalviewUserColours();
  97     }
  98
  99     /**
 100      * Create an instance of {@link Pdbentry }
 101      *
 102      */
 103     public Pdbentry createPdbentry() {
 104         return new Pdbentry();
 105     }
 106
 107     /**
 108      * Create an instance of {@link Feature }
 109      *
 110      */
 111     public Feature createFeature() {
 112         return new Feature();
 113     }
 114
 115     /**
 116      * Create an instance of {@link JalviewModel }
 117      *
 118      */
 119     public JalviewModel createJalviewModel() {
 120         return new JalviewModel();
 121     }
 122
 123     /**
 124      * Create an instance of {@link JalviewModel.FeatureSettings }
 125      *
 126      */
 127     public JalviewModel.FeatureSettings createJalviewModelFeatureSettings() {
 128         return new JalviewModel.FeatureSettings();
 129     }
 130
 131     /**
 132      * Create an instance of {@link JalviewModel.Viewport }
 133      *
 134      */
 135     public JalviewModel.Viewport createJalviewModelViewport() {
 136         return new JalviewModel.Viewport();
 137     }
 138
 139     /**
 140      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq }
 141      *
 142      */
 143     public JalviewModel.JSeq createJalviewModelJSeq() {
 144         return new JalviewModel.JSeq();
 145     }
 146
 147     /**
 148      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.RnaViewer }
 149      *
 150      */
 151     public JalviewModel.JSeq.RnaViewer createJalviewModelJSeqRnaViewer() {
 152         return new JalviewModel.JSeq.RnaViewer();
 153     }
 154
 155     /**
 156      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.Pdbids }
 157      *
 158      */
 159     public JalviewModel.JSeq.Pdbids createJalviewModelJSeqPdbids() {
 160         return new JalviewModel.JSeq.Pdbids();
 161     }
 162
 163     /**
 164      * Create an instance of {@link AnnotationColourScheme }
 165      *
 166      */
 167     public AnnotationColourScheme createAnnotationColourScheme() {
 168         return new AnnotationColourScheme();
 169     }
 170
 171     /**
 172      * Create an instance of {@link AlcodonFrame.Alcodon }
 173      *
 174      */
 175     public AlcodonFrame.Alcodon createAlcodonFrameAlcodon() {
 176         return new AlcodonFrame.Alcodon();
 177     }
 178
 179     /**
 180      * Create an instance of {@link AlcodonFrame.AlcodMap }
 181      *
 182      */
 183     public AlcodonFrame.AlcodMap createAlcodonFrameAlcodMap() {
 184         return new AlcodonFrame.AlcodMap();
 185     }
 186
 187     /**
 188      * Create an instance of {@link AnnotationElement }
 189      *
 190      */
 191     public AnnotationElement createAnnotationElement() {
 192         return new AnnotationElement();
 193     }
 194
 195     /**
 196      * Create an instance of {@link Mapping }
 197      *
 198      */
 199     public Mapping createMapping() {
 200         return new Mapping();
 201     }
 202
 203     /**
 204      * Create an instance of {@link MapListType.MapListFrom }
 205      *
 206      */
 207     public MapListType.MapListFrom createMapListTypeMapListFrom() {
 208         return new MapListType.MapListFrom();
 209     }
 210
 211     /**
 212      * Create an instance of {@link MapListType.MapListTo }
 213      *
 214      */
 215     public MapListType.MapListTo createMapListTypeMapListTo() {
 216         return new MapListType.MapListTo();
 217     }
 218
 219     /**
 220      * Create an instance of {@link SequenceType }
 221      *
 222      */
 223     public SequenceType createSequenceType() {
 224         return new SequenceType();
 225     }
 226
 227     /**
 228      * Create an instance of {@link Sequence.DBRef }
 229      *
 230      */
 231     public Sequence.DBRef createSequenceDBRef() {
 232         return new Sequence.DBRef();
 233     }
 234
 235     /**
 236      * Create an instance of {@link Annotation.ThresholdLine }
 237      *
 238      */
 239     public Annotation.ThresholdLine createAnnotationThresholdLine() {
 240         return new Annotation.ThresholdLine();
 241     }
 242
 243     /**
 244      * Create an instance of {@link Annotation.Property }
 245      *
 246      */
 247     public Annotation.Property createAnnotationProperty() {
 248         return new Annotation.Property();
 249     }
 250
 251     /**
 252      * Create an instance of {@link SequenceSet.SequenceSetProperties }
 253      *
 254      */
 255     public SequenceSet.SequenceSetProperties createSequenceSetSequenceSetProperties() {
 256         return new SequenceSet.SequenceSetProperties();
 257     }
 258
 259     /**
 260      * Create an instance of {@link VAMSAS }
 261      *
 262      */
 263     public VAMSAS createVAMSAS() {
 264         return new VAMSAS();
 265     }
 266
 267     /**
 268      * Create an instance of {@link FeatureMatcher }
 269      *
 270      */
 271     public FeatureMatcher createFeatureMatcher() {
 272         return new FeatureMatcher();
 273     }
 274
 275     /**
 276      * Create an instance of {@link WebServiceParameterSet }
 277      *
 278      */
 279     public WebServiceParameterSet createWebServiceParameterSet() {
 280         return new WebServiceParameterSet();
 281     }
 282
 283     /**
 284      * Create an instance of {@link FeatureMatcherSet.CompoundMatcher }
 285      *
 286      */
 287     public FeatureMatcherSet.CompoundMatcher createFeatureMatcherSetCompoundMatcher() {
 288         return new FeatureMatcherSet.CompoundMatcher();
 289     }
 290
 291     /**
 292      * Create an instance of {@link JalviewUserColours.Colour }
 293      *
 294      */
 295     public JalviewUserColours.Colour createJalviewUserColoursColour() {
 296         return new JalviewUserColours.Colour();
 297     }
 298
 299     /**
 300      * Create an instance of {@link JalviewUserColours.Filter }
 301      *
 302      */
 303     public JalviewUserColours.Filter createJalviewUserColoursFilter() {
 304         return new JalviewUserColours.Filter();
 305     }
 306
 307     /**
 308      * Create an instance of {@link Pdbentry.Property }
 309      *
 310      */
 311     public Pdbentry.Property createPdbentryProperty() {
 312         return new Pdbentry.Property();
 313     }
 314
 315     /**
 316      * Create an instance of {@link Feature.OtherData }
 317      *
 318      */
 319     public Feature.OtherData createFeatureOtherData() {
 320         return new Feature.OtherData();
 321     }
 322
 323     /**
 324      * Create an instance of {@link JalviewModel.JGroup }
 325      *
 326      */
 327     public JalviewModel.JGroup createJalviewModelJGroup() {
 328         return new JalviewModel.JGroup();
 329     }
 330
 331     /**
 332      * Create an instance of {@link JalviewModel.UserColours }
 333      *
 334      */
 335     public JalviewModel.UserColours createJalviewModelUserColours() {
 336         return new JalviewModel.UserColours();
 337     }
 338
 339     /**
 340      * Create an instance of {@link JalviewModel.Tree }
 341      *
 342      */
 343     public JalviewModel.Tree createJalviewModelTree() {
 344         return new JalviewModel.Tree();
 345     }
 346
 347     /**
 348      * Create an instance of {@link JalviewModel.FeatureSettings.Setting }
 349      *
 350      */
 351     public JalviewModel.FeatureSettings.Setting createJalviewModelFeatureSettingsSetting() {
 352         return new JalviewModel.FeatureSettings.Setting();
 353     }
 354
 355     /**
 356      * Create an instance of {@link JalviewModel.FeatureSettings.Group }
 357      *
 358      */
 359     public JalviewModel.FeatureSettings.Group createJalviewModelFeatureSettingsGroup() {
 360         return new JalviewModel.FeatureSettings.Group();
 361     }
 362
 363     /**
 364      * Create an instance of {@link JalviewModel.Viewport.HiddenColumns }
 365      *
 366      */
 367     public JalviewModel.Viewport.HiddenColumns createJalviewModelViewportHiddenColumns() {
 368         return new JalviewModel.Viewport.HiddenColumns();
 369     }
 370
 371     /**
 372      * Create an instance of {@link JalviewModel.Viewport.CalcIdParam }
 373      *
 374      */
 375     public JalviewModel.Viewport.CalcIdParam createJalviewModelViewportCalcIdParam() {
 376         return new JalviewModel.Viewport.CalcIdParam();
 377     }
 378
 379     /**
 380      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.RnaViewer.SecondaryStructure }
 381      *
 382      */
 383     public JalviewModel.JSeq.RnaViewer.SecondaryStructure createJalviewModelJSeqRnaViewerSecondaryStructure() {
 384         return new JalviewModel.JSeq.RnaViewer.SecondaryStructure();
 385     }
 386
 387     /**
 388      * Create an instance of {@link JalviewModel.JSeq.Pdbids.StructureState }
 389      *
 390      */
 391     public JalviewModel.JSeq.Pdbids.StructureState createJalviewModelJSeqPdbidsStructureState() {
 392         return new JalviewModel.JSeq.Pdbids.StructureState();
 393     }
 394
 395     /**
 396      * Create an instance of {@link JAXBElement }{@code <}{@link JalviewModel }{@code >}}
 397      *
 398      */
 399     @XmlElementDecl(namespace = "www.jalview.org", name = "JalviewModel")
 400     public JAXBElement<JalviewModel> createJalviewModel(JalviewModel value) {
 401         return new JAXBElement<JalviewModel>(_JalviewModel_QNAME, JalviewModel.class, null, value);
 402     }
 403
 404 }