test/jalview/ext/android/SparseDoubleArrayTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ext.android;
  22
  23 import static org.testng.Assert.assertEquals;
  24
  25 import org.testng.annotations.Test;
  26
  27 public class SparseDoubleArrayTest
  28 {
  29
  30   @Test
  31   public void testConstructor()
  32   {
  33     double[] d = new double[] { 0d, 0d, 1.2d, 0d, 0d, 3.4d };
  34     SparseDoubleArray s = new SparseDoubleArray(d);
  35     for (int i = 0; i < d.length; i++)
  36     {
  37       assertEquals(s.get(i), d[i], "At [" + i + "]");
  38     }
  39   }
  40
  41   @Test
  42   public void testAdd()
  43   {
  44     double[] d = new double[] { 0d, 0d, 1.2d, 0d, 0d, 3.4d };
  45     SparseDoubleArray s = new SparseDoubleArray(d);
  46     // add to zero (absent)
  47     s.add(0, 3.2d);
  48     assertEquals(s.get(0), 3.2d);
  49     // add to non-zero
  50     s.add(0, 2.5d);
  51     assertEquals(s.get(0), 5.7d);
  52     // add negative value
  53     s.add(2, -5.3d);
  54     assertEquals(s.get(2), -4.1d);
  55     // add to unset value
  56     s.add(12, 9.8d);
  57     assertEquals(s.get(12), 9.8d);
  58   }
  59
  60   @Test
  61   public void testDivide()
  62   {
  63     double delta = 1.0e-10;
  64     double[] d = new double[] { 0d, 2.4d, 1.2d, 0d, -4.8d, -3.6d };
  65     SparseDoubleArray s = new SparseDoubleArray(d);
  66     assertEquals(s.divide(0, 1d), 0d); // no such entry
  67     assertEquals(s.divide(2, 0d), 0d); // zero divisor
  68     assertEquals(s.divide(1, 2d), 1.2d, delta); // + / +
  69     assertEquals(s.divide(2, -2d), -0.6d, delta); // + / -
  70     assertEquals(s.divide(4, 3d), -1.6d, delta); // - / +
  71     assertEquals(s.divide(5, -3d), 1.2d, delta); // - / -
  72   }
  73 }