test/jalview/gui/ScalePanelTest.java

   1 package jalview.gui;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertTrue;
   5
   6 import jalview.bin.Cache;
   7 import jalview.bin.Jalview;
   8 import jalview.datamodel.Alignment;
   9 import jalview.datamodel.AlignmentI;
  10 import jalview.datamodel.Sequence;
  11 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
  12 import jalview.datamodel.SequenceI;
  13 import jalview.io.DataSourceType;
  14 import jalview.io.FileLoader;
  15 import jalview.util.MessageManager;
  16 import jalview.viewmodel.ViewportRanges;
  17
  18 import java.awt.event.MouseEvent;
  19
  20 import javax.swing.JMenuItem;
  21 import javax.swing.JPopupMenu;
  22
  23 import org.testng.annotations.BeforeClass;
  24 import org.testng.annotations.Test;
  25
  26 public class ScalePanelTest
  27 {
  28   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  29   public void setUpJvOptionPane()
  30   {
  31     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
  32     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
  33   }
  34
  35   @Test(groups = "Functional")
  36   public void testPreventNegativeStartColumn()
  37   {
  38     SequenceI seq1 = new Sequence("Seq1", "MATRESS");
  39     SequenceI seq2 = new Sequence("Seq2", "MADNESS");
  40     AlignmentI al = new Alignment(new SequenceI[] { seq1, seq2 });
  41
  42     AlignFrame alignFrame = new AlignFrame(al, al.getWidth(),
  43             al.getHeight());
  44     ScalePanel scalePanel = alignFrame.alignPanel.getScalePanel();
  45
  46     MouseEvent mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, 4, 0, 1, false);
  47     scalePanel.mousePressed(mouse);
  48     scalePanel.mouseDragged(mouse);
  49
  50     // simulate dragging selection leftwards beyond the sequences giving
  51     // negative X
  52     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, -30, 0, 1, false);
  53
  54     scalePanel.mouseReleased(mouse);
  55
  56     SequenceGroup sg = scalePanel.av.getSelectionGroup();
  57     int startCol = sg.getStartRes();
  58
  59     assertTrue(startCol >= 0);
  60   }
  61
  62   /**
  63    * Test for JAL-3212
  64    */
  65   @Test(groups = "Functional")
  66   public void testSelectColumns_withHidden()
  67   {
  68     String seq1 = ">Seq1\nANTOFAGASTAVALPARAISOMONTEVIDEOANTANANARIVO";
  69     AlignFrame alignFrame = new FileLoader().LoadFileWaitTillLoaded(seq1,
  70             DataSourceType.PASTE);
  71     ScalePanel scalePanel = alignFrame.alignPanel.getScalePanel();
  72
  73     /*
  74      * hide columns 1-20 (of 43); then 'drag' to select columns 30-31;
  75      * 31 is 51 in absolute columns but bug JAL-3212 reduces it to
  76      * endRes which is 22
  77      */
  78     AlignViewport viewport = alignFrame.getViewport();
  79     ViewportRanges ranges = viewport.getRanges();
  80     assertEquals(ranges.getStartRes(), 0);
  81     assertEquals(ranges.getEndRes(), 42);
  82     viewport.hideColumns(0, 19);
  83     alignFrame.alignPanel.updateLayout();
  84     assertEquals(ranges.getStartRes(), 0);
  85     assertEquals(ranges.getEndRes(), 22);
  86
  87     int cw = viewport.getCharWidth();
  88     int xPos = 9 * cw + 2;
  89     MouseEvent mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1,
  90             false);
  91     scalePanel.mousePressed(mouse);
  92     scalePanel.mouseDragged(mouse);
  93     xPos += cw;
  94     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
  95     scalePanel.mouseReleased(mouse);
  96
  97     SequenceGroup sg = scalePanel.av.getSelectionGroup();
  98     assertEquals(sg.getStartRes(), 29);
  99     assertEquals(sg.getEndRes(), 30);
 100   }
 101
 102   @Test(groups = "Functional")
 103   public void testBuildPopupMenu()
 104   {
 105     final String hide = MessageManager.getString("label.hide_columns");
 106     final String reveal = MessageManager.getString("label.reveal");
 107     final String revealAll = MessageManager.getString("action.reveal_all");
 108
 109     String seq1 = ">Seq1\nANTOFAGASTA";
 110     AlignFrame alignFrame = new FileLoader().LoadFileWaitTillLoaded(seq1,
 111             DataSourceType.PASTE);
 112     ScalePanel scalePanel = alignFrame.alignPanel.getScalePanel();
 113     AlignViewport viewport = alignFrame.getViewport();
 114     int cw = viewport.getCharWidth();
 115
 116     /*
 117      * hide columns 3-4 (counting from 0)
 118      */
 119     viewport.hideColumns(3, 4);
 120     alignFrame.alignPanel.updateLayout();
 121
 122     /*
 123      * verify popup menu left/right of hidden column marker
 124      * NB need to call mouseMoved first as this sets field 'reveal'
 125      */
 126     int xPos = 1 * cw + 2; // 2 columns left of hidden marker
 127     MouseEvent mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1,
 128             false);
 129     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 130     JPopupMenu popup = scalePanel.buildPopupMenu(1);
 131     assertEquals(popup.getSubElements().length, 0);
 132
 133     /*
 134      * popup just left of hidden marker has 'Reveal'
 135      */
 136     xPos = 2 * cw + 2;
 137     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 138     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 139     popup = scalePanel.buildPopupMenu(2);
 140     assertEquals(popup.getSubElements().length, 1);
 141     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
 142
 143     /*
 144      * popup just right of hidden marker has 'Reveal'
 145      */
 146     xPos = 3 * cw + 2;
 147     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 148     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 149     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5); // allowing for 2 hidden columns
 150     assertEquals(popup.getSubElements().length, 1);
 151     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
 152
 153     /*
 154      * popup further right is empty
 155      */
 156     xPos = 4 * cw + 2;
 157     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 158     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 159     popup = scalePanel.buildPopupMenu(6); // allowing for 2 hidden columns
 160     assertEquals(popup.getSubElements().length, 0);
 161
 162     /*
 163      * 'drag' to select columns around the hidden column marker
 164      */
 165     xPos = 1 * cw + 2;
 166     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 167     scalePanel.mousePressed(mouse);
 168     scalePanel.mouseDragged(mouse);
 169     xPos = 5 * cw + 2;
 170     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 171     scalePanel.mouseReleased(mouse);
 172
 173     /*
 174      * popup 2 columns left of marker: 'Hide' only
 175      */
 176     xPos = 1 * cw + 2;
 177     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 178     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 179     popup = scalePanel.buildPopupMenu(1);
 180     assertEquals(popup.getSubElements().length, 1);
 181     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), hide);
 182
 183     /*
 184      * popup just left of marker: 'Reveal' and 'Hide'
 185      */
 186     xPos = 2 * cw + 2;
 187     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 188     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 189     popup = scalePanel.buildPopupMenu(1);
 190     assertEquals(popup.getSubElements().length, 2);
 191     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
 192     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(), hide);
 193
 194     /*
 195      * popup just right of marker: 'Reveal' and 'Hide'
 196      */
 197     xPos = 3 * cw + 2;
 198     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 199     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 200     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5);
 201     assertEquals(popup.getSubElements().length, 2);
 202     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
 203     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(), hide);
 204
 205     /*
 206      * hiding a second region adds option 'Reveal all' to 'Reveal'
 207      */
 208     viewport.hideColumns(6, 7);
 209     alignFrame.alignPanel.updateLayout();
 210     xPos = 3 * cw + 2;
 211     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
 212     scalePanel.mouseMoved(mouse);
 213     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5);
 214     assertEquals(popup.getSubElements().length, 3);
 215     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
 216     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(),
 217             revealAll);
 218     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[2]).getText(), hide);
 219
 220     alignFrame.deselectAllSequenceMenuItem_actionPerformed(null);
 221     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5);
 222     assertEquals(popup.getSubElements().length, 2);
 223     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
 224     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(),
 225             revealAll);
 226   }
 227
 228   @BeforeClass(alwaysRun = true)
 229   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
 230   {
 231     /*
 232      * use read-only test properties file
 233      */
 234     Cache.loadProperties("test/jalview/io/testProps.jvprops");
 235     Jalview.main(new String[] { "-nonews" });
 236   }
 237
 238 }