test/jalview/io/vcf/testVcf2.vcf

   1 ##fileformat=VCFv4.2
   2 ##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
   3 ##contig=<ID=contig123,length=15>
   4 ##contig=<ID=contig456,length=20>
   5 ##contig=<ID=contig789,length=25>
   6 ##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
   7 ##reference=test/jalview/io/vcf/contigs.fasta
   8 #CHROM  POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO
   9 contig123       8       .       C       A       81.96   .       AC=1;AF=0.1
  10 contig123       12      .       G       T       1666.64 .       AC=1;AF=0.2
  11 contig456       15      .       T       C       41.94   .       AC=1;AF=0.3
  12 contig789       2       .       G       T       224.23  .       AC=1,2;AF=0
  13 contig789       21      .       G       A       433.35  .       AC=3;AF=0.6