test/jalview/renderer/ScaleRendererTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.renderer;
  22
  23 import static org.testng.Assert.assertEquals;
  24 import static org.testng.Assert.assertFalse;
  25 import static org.testng.Assert.assertNull;
  26 import static org.testng.Assert.assertTrue;
  27
  28 import jalview.gui.AlignFrame;
  29 import jalview.gui.AlignViewport;
  30 import jalview.io.DataSourceType;
  31 import jalview.io.FileLoader;
  32 import jalview.renderer.ScaleRenderer.ScaleMark;
  33
  34 import java.util.List;
  35
  36 import org.testng.annotations.Test;
  37
  38 public class ScaleRendererTest
  39 {
  40   @Test(groups = "Functional")
  41   public void testCalculateMarks()
  42   {
  43     String data = ">Seq/20-45\nABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYS\n";
  44     AlignFrame af = new FileLoader().LoadFileWaitTillLoaded(data,
  45             DataSourceType.PASTE);
  46     AlignViewport av = af.getViewport();
  47
  48     /*
  49      * scale has minor ticks at 5, 15, 25, major at 10 and 20
  50      * (these are base 1, ScaleMark holds base 0 values)
  51      */
  52     List<ScaleMark> marks = new ScaleRenderer().calculateMarks(av, 0, 25);
  53     assertEquals(marks.size(), 5);
  54
  55     assertFalse(marks.get(0).major);
  56     assertEquals(marks.get(0).column, 4);
  57     assertNull(marks.get(0).text);
  58
  59     assertTrue(marks.get(1).major);
  60     assertEquals(marks.get(1).column, 9);
  61     assertEquals(marks.get(1).text, "10");
  62
  63     assertFalse(marks.get(2).major);
  64     assertEquals(marks.get(2).column, 14);
  65     assertNull(marks.get(2).text);
  66
  67     assertTrue(marks.get(3).major);
  68     assertEquals(marks.get(3).column, 19);
  69     assertEquals(marks.get(3).text, "20");
  70
  71     assertFalse(marks.get(4).major);
  72     assertEquals(marks.get(4).column, 24);
  73     assertNull(marks.get(4).text);
  74
  75     /*
  76      * now hide columns 9-11 and 18-20 (base 1)
  77      * scale marks are now in the same columns as before, but
  78      * with column numbering adjusted for hidden columns
  79      */
  80     av.hideColumns(8, 10);
  81     av.hideColumns(17, 19);
  82     marks = new ScaleRenderer().calculateMarks(av, 0, 25);
  83     assertEquals(marks.size(), 5);
  84     assertFalse(marks.get(0).major);
  85     assertEquals(marks.get(0).column, 4);
  86     assertNull(marks.get(0).text);
  87     assertTrue(marks.get(1).major);
  88     assertEquals(marks.get(1).column, 9);
  89     assertEquals(marks.get(1).text, "13"); // +3 hidden columns
  90     assertFalse(marks.get(2).major);
  91     assertEquals(marks.get(2).column, 14);
  92     assertNull(marks.get(2).text);
  93     assertTrue(marks.get(3).major);
  94     assertEquals(marks.get(3).column, 19);
  95     assertEquals(marks.get(3).text, "26"); // +6 hidden columns
  96     assertFalse(marks.get(4).major);
  97     assertEquals(marks.get(4).column, 24);
  98     assertNull(marks.get(4).text);
  99   }
 100 }