histidine should be midblue (noticed by Peter Knight via jalview-help)
authorjprocter <Jim Procter>
Wed, 8 Aug 2007 08:07:39 +0000 (08:07 +0000)
committerjprocter <Jim Procter>
Wed, 8 Aug 2007 08:07:39 +0000 (08:07 +0000)
src/jalview/schemes/ResidueProperties.java
src/jalview/schemes/ZappoColourScheme.java

index 9ac87ab..e55ce18 100755 (executable)
@@ -277,7 +277,8 @@ public class ResidueProperties
       new Color(60, 136, 238), // T
       new Color(60, 136, 238) // U
   };
-  public static final Color[] color =
+  // Zappo
+  public static final Color[] zappo =
       {
       Color.pink, // A
       midBlue, // R
@@ -287,7 +288,7 @@ public class ResidueProperties
       Color.green, // Q
       Color.red, // E
       Color.magenta, // G
-      Color.red, // H
+      midBlue,// Color.red, // H
       Color.pink, // I
       Color.pink, // L
       midBlue, // K
index 0d1854c..f674a51 100755 (executable)
@@ -1,37 +1,37 @@
-/*\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
- * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
- *\r
- * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
- * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
- * of the License, or (at your option) any later version.\r
- *\r
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
- * GNU General Public License for more details.\r
- *\r
- * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
- * along with this program; if not, write to the Free Software\r
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
- */\r
-package jalview.schemes;\r
-\r
-/**\r
- * DOCUMENT ME!\r
- *\r
- * @author $author$\r
- * @version $Revision$\r
- */\r
-public class ZappoColourScheme\r
-    extends ResidueColourScheme\r
-{\r
-  /**\r
-   * Creates a new ZappoColourScheme object.\r
-   */\r
-  public ZappoColourScheme()\r
-  {\r
-    super(ResidueProperties.color, 0);\r
-  }\r
-}\r
+/*
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
+ * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+ *
+ * This program is free software; you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License
+ * as published by the Free Software Foundation; either version 2
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+ * GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with this program; if not, write to the Free Software
+ * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
+ */
+package jalview.schemes;
+
+/**
+ * DOCUMENT ME!
+ *
+ * @author $author$
+ * @version $Revision$
+ */
+public class ZappoColourScheme
+    extends ResidueColourScheme
+{
+  /**
+   * Creates a new ZappoColourScheme object.
+   */
+  public ZappoColourScheme()
+  {
+    super(ResidueProperties.zappo, 0);
+  }
+}