unused/appletgui/SliderPanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)\r
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3\r
  10  * of the License, or (at your option) any later version.\r
  11  *  \r
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  16  * \r
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.\r
  20  */\r
  21 package jalview.appletgui;\r
  22 \r
  23 import jalview.bin.JalviewLite;\r
  24 import jalview.datamodel.SequenceGroup;\r
  25 import jalview.schemes.ColourSchemeI;\r
  26 import jalview.util.MessageManager;\r
  27 \r
  28 import java.awt.BorderLayout;\r
  29 import java.awt.Color;\r
  30 import java.awt.FlowLayout;\r
  31 import java.awt.event.ActionEvent;\r
  32 import java.awt.event.ActionListener;\r
  33 import java.awt.event.AdjustmentEvent;\r
  34 import java.awt.event.AdjustmentListener;\r
  35 import java.awt.event.MouseEvent;\r
  36 import java.awt.event.MouseListener;\r
  37 import java.awt.event.WindowAdapter;\r
  38 import java.awt.event.WindowEvent;\r
  39 import java.util.Iterator;\r
  40 \r
  41 import javax.swing.JButton;\r
  42 import javax.swing.JCheckBox;\r
  43 import javax.swing.JFrame;\r
  44 import javax.swing.JLabel;\r
  45 import javax.swing.JPanel;\r
  46 import javax.swing.JScrollBar;\r
  47 import javax.swing.JTextField;\r
  48 \r
  49 public class SliderPanel extends JPanel implements ActionListener,\r
  50         AdjustmentListener, MouseListener\r
  51 {\r
  52   AlignmentPanel ap;\r
  53 \r
  54   boolean forConservation = true;\r
  55 \r
  56   ColourSchemeI cs;\r
  57 \r
  58   static JFrame conservationSlider;\r
  59 \r
  60   static JFrame PIDSlider;\r
  61 \r
  62   public static int setConservationSlider(AlignmentPanel ap,\r
  63           ColourSchemeI cs, String source)\r
  64   {\r
  65     SliderPanel sp = null;\r
  66 \r
  67     if (conservationSlider == null)\r
  68     {\r
  69       sp = new SliderPanel(ap, cs.getConservationInc(), true, cs);\r
  70       conservationSlider = new JFrame();\r
  71       conservationSlider.add(sp);\r
  72     }\r
  73     else\r
  74     {\r
  75       sp = (SliderPanel) conservationSlider.getComponent(0);\r
  76       sp.cs = cs;\r
  77     }\r
  78 \r
  79     conservationSlider.setTitle(MessageManager.formatMessage("label.conservation_colour_increment", new String[]{source}));\r
  80     if (ap.av.getAlignment().getGroups() != null)\r
  81     {\r
  82       sp.setAllGroupsCheckEnabled(true);\r
  83     }\r
  84     else\r
  85     {\r
  86       sp.setAllGroupsCheckEnabled(false);\r
  87     }\r
  88 \r
  89     return sp.getValue();\r
  90   }\r
  91 \r
  92   public static void showConservationSlider()\r
  93   {\r
  94     try\r
  95     {\r
  96       PIDSlider.setVisible(false);\r
  97       PIDSlider = null;\r
  98     } catch (Exception ex)\r
  99     {\r
 100     }\r
 101 \r
 102     if (!conservationSlider.isVisible())\r
 103     {\r
 104       JalviewLite.addFrame(conservationSlider,\r
 105               conservationSlider.getTitle(), 420, 100);\r
 106       conservationSlider.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
 107       {\r
 108         public void windowClosing(WindowEvent e)\r
 109         {\r
 110           conservationSlider = null;\r
 111         }\r
 112       });\r
 113 \r
 114     }\r
 115 \r
 116   }\r
 117 \r
 118   public static int setPIDSliderSource(AlignmentPanel ap, ColourSchemeI cs,\r
 119           String source)\r
 120   {\r
 121     SliderPanel pid = null;\r
 122     if (PIDSlider == null)\r
 123     {\r
 124       pid = new SliderPanel(ap, 50, false, cs);\r
 125       PIDSlider = new JFrame();\r
 126       PIDSlider.add(pid);\r
 127     }\r
 128     else\r
 129     {\r
 130       pid = (SliderPanel) PIDSlider.getComponent(0);\r
 131       pid.cs = cs;\r
 132     }\r
 133     PIDSlider.setTitle(MessageManager.formatMessage("label.percentage_identity_thereshold", new String[]{source}));\r
 134 \r
 135     if (ap.av.getAlignment().getGroups() != null)\r
 136     {\r
 137       pid.setAllGroupsCheckEnabled(true);\r
 138     }\r
 139     else\r
 140     {\r
 141       pid.setAllGroupsCheckEnabled(false);\r
 142     }\r
 143 \r
 144     return pid.getValue();\r
 145 \r
 146   }\r
 147 \r
 148   public static void showPIDSlider()\r
 149   {\r
 150     try\r
 151     {\r
 152       conservationSlider.setVisible(false);\r
 153       conservationSlider = null;\r
 154     } catch (Exception ex)\r
 155     {\r
 156     }\r
 157 \r
 158     if (!PIDSlider.isVisible())\r
 159     {\r
 160       JalviewLite.addFrame(PIDSlider, PIDSlider.getTitle(),\r
 161               420, 100);\r
 162       PIDSlider.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
 163       {\r
 164         public void windowClosing(WindowEvent e)\r
 165         {\r
 166           PIDSlider = null;\r
 167         }\r
 168       });\r
 169     }\r
 170 \r
 171   }\r
 172 \r
 173   public SliderPanel(AlignmentPanel ap, int value, boolean forConserve,\r
 174           ColourSchemeI cs)\r
 175   {\r
 176     try\r
 177     {\r
 178       jbInit();\r
 179     } catch (Exception e)\r
 180     {\r
 181       e.printStackTrace();\r
 182     }\r
 183     this.ap = ap;\r
 184     this.cs = cs;\r
 185     forConservation = forConserve;\r
 186     undoButton.setVisible(false);\r
 187     applyButton.setVisible(false);\r
 188     if (forConservation)\r
 189     {\r
 190       label.setText(MessageManager\r
 191               .getString("label.modify_conservation_visibility"));\r
 192       slider.setMinimum(0);\r
 193       slider.setMaximum(50 + slider.getVisibleAmount());\r
 194       slider.setUnitIncrement(1);\r
 195     }\r
 196     else\r
 197     {\r
 198       label.setText(MessageManager\r
 199               .getString("label.colour_residues_above_occurence"));\r
 200       slider.setMinimum(0);\r
 201       slider.setMaximum(100 + slider.getVisibleAmount());\r
 202       slider.setBlockIncrement(1);\r
 203     }\r
 204 \r
 205     slider.addAdjustmentListener(this);\r
 206     slider.addMouseListener(this);\r
 207 \r
 208     slider.setValue(value);\r
 209     valueField.setText(value + "");\r
 210   }\r
 211 \r
 212   public void valueChanged(int i)\r
 213   {\r
 214     if (cs == null)\r
 215     {\r
 216       return;\r
 217     }\r
 218 \r
 219     ColourSchemeI toChange = cs;\r
 220     Iterator<SequenceGroup> allGroups = null;\r
 221 \r
 222     if (allGroupsCheck.isSelected())\r
 223     {\r
 224       allGroups = ap.av.getAlignment().getGroups().listIterator();\r
 225     }\r
 226 \r
 227     while (toChange != null)\r
 228     {\r
 229       if (forConservation)\r
 230       {\r
 231         toChange.setConservationInc(i);\r
 232       }\r
 233       else\r
 234       {\r
 235         toChange.setThreshold(i, ap.av.isIgnoreGapsConsensus());\r
 236       }\r
 237       if (allGroups != null && allGroups.hasNext())\r
 238       {\r
 239         while ((toChange = allGroups.next().cs) == null\r
 240                 && allGroups.hasNext())\r
 241         {\r
 242           ;\r
 243         }\r
 244       }\r
 245       else\r
 246       {\r
 247         toChange = null;\r
 248       }\r
 249     }\r
 250 \r
 251     ap.seqPanel.seqCanvas.repaint();\r
 252 \r
 253   }\r
 254 \r
 255   public void setAllGroupsCheckEnabled(boolean b)\r
 256   {\r
 257     allGroupsCheck.setEnabled(b);\r
 258   }\r
 259 \r
 260   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
 261   {\r
 262     if (evt.getSource() == applyButton)\r
 263     {\r
 264       applyButton_actionPerformed();\r
 265     }\r
 266     else if (evt.getSource() == undoButton)\r
 267     {\r
 268       undoButton_actionPerformed();\r
 269     }\r
 270     else if (evt.getSource() == valueField)\r
 271     {\r
 272       valueField_actionPerformed();\r
 273     }\r
 274   }\r
 275 \r
 276   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 277   {\r
 278     valueField.setText(slider.getValue() + "");\r
 279     valueChanged(slider.getValue());\r
 280   }\r
 281 \r
 282   public void valueField_actionPerformed()\r
 283   {\r
 284     try\r
 285     {\r
 286       int i = Integer.parseInt(valueField.getText());\r
 287       slider.setValue(i);\r
 288     } catch (Exception ex)\r
 289     {\r
 290       valueField.setText(slider.getValue() + "");\r
 291     }\r
 292   }\r
 293 \r
 294   public void setValue(int value)\r
 295   {\r
 296     slider.setValue(value);\r
 297   }\r
 298 \r
 299   public int getValue()\r
 300   {\r
 301     return Integer.parseInt(valueField.getText());\r
 302   }\r
 303 \r
 304   // this is used for conservation colours, PID colours and redundancy threshold\r
 305   protected JScrollBar slider = new JScrollBar();\r
 306 \r
 307   protected JTextField valueField = new JTextField();\r
 308 \r
 309   protected JLabel label = new JLabel();\r
 310 \r
 311   JPanel jPanel1 = new JPanel();\r
 312 \r
 313   JPanel jPanel2 = new JPanel();\r
 314 \r
 315   protected JButton applyButton = new JButton();\r
 316 \r
 317   protected JButton undoButton = new JButton();\r
 318  \r
 319   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();\r
 320 \r
 321   protected JCheckBox allGroupsCheck = new JCheckBox();\r
 322 \r
 323   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();\r
 324 \r
 325   BorderLayout borderLayout2 = new BorderLayout();\r
 326 \r
 327   FlowLayout flowLayout2 = new FlowLayout();\r
 328 \r
 329   private void jbInit() throws Exception\r
 330   {\r
 331     this.setLayout(borderLayout2);\r
 332 \r
 333     // slider.setMajorTickSpacing(10);\r
 334     // slider.setMinorTickSpacing(1);\r
 335     // slider.setPaintTicks(true);\r
 336     slider.setBackground(Color.white);\r
 337     slider.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 338     slider.setOrientation(0);\r
 339     valueField.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 340     valueField.setText("   ");\r
 341     valueField.addActionListener(this);\r
 342     valueField.setColumns(3);\r
 343     label.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 344     label.setText(MessageManager.getString("label.set_this_label_text"));\r
 345     jPanel1.setLayout(borderLayout1);\r
 346     jPanel2.setLayout(flowLayout1);\r
 347     applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 348     applyButton.setLabel(MessageManager.getString("action.apply"));\r
 349     applyButton.addActionListener(this);\r
 350     undoButton.setEnabled(false);\r
 351     undoButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 352     undoButton.setLabel(MessageManager.getString("action.undo"));\r
 353     undoButton.addActionListener(this);\r
 354     allGroupsCheck.setEnabled(false);\r
 355     allGroupsCheck.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 356     allGroupsCheck.setLabel(MessageManager\r
 357             .getString("action.apply_threshold_all_groups"));\r
 358     allGroupsCheck.setName(MessageManager\r
 359             .getString("action.apply_all_groups"));\r
 360     this.setBackground(Color.white);\r
 361     this.setForeground(Color.black);\r
 362     jPanel2.add(label, null);\r
 363     jPanel2.add(applyButton, null);\r
 364     jPanel2.add(undoButton, null);\r
 365     jPanel2.add(allGroupsCheck);\r
 366     jPanel1.add(valueField, java.awt.BorderLayout.EAST);\r
 367     jPanel1.add(slider, java.awt.BorderLayout.CENTER);\r
 368     this.add(jPanel1, java.awt.BorderLayout.SOUTH);\r
 369     this.add(jPanel2, java.awt.BorderLayout.CENTER);\r
 370   }\r
 371 \r
 372   protected void applyButton_actionPerformed()\r
 373   {\r
 374   }\r
 375 \r
 376   protected void undoButton_actionPerformed()\r
 377   {\r
 378   }\r
 379 \r
 380   public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
 381   {\r
 382   }\r
 383 \r
 384   public void mouseReleased(MouseEvent evt)\r
 385   {\r
 386     ap.paintAlignment(true);\r
 387   }\r
 388 \r
 389   public void mouseClicked(MouseEvent evt)\r
 390   {\r
 391   }\r
 392 \r
 393   public void mouseEntered(MouseEvent evt)\r
 394   {\r
 395   }\r
 396 \r
 397   public void mouseExited(MouseEvent evt)\r
 398   {\r
 399   }\r
 400 }\r