JPRED-2 Add alscript to the Git repository
[jpred.git] / sources / alscript / doc / alscript / section3_4.html
1 <HEAD>
2 <TITLE> Related Programs</TITLE>
3 </HEAD>
4 <BODY><P>
5  <HR> <A NAME=tex2html122 HREF=section3_5.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/next_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html120 HREF=alscript.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/up_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html114 HREF=section3_3.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/previous_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html124 HREF=tableofcontents3_1.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/contents_motif.gif"></A> <BR>
6 <B> Next:</B> <A NAME=tex2html123 HREF=section3_5.html> Availability</A>
7 <B>Up:</B> <A NAME=tex2html121 HREF=alscript.html>No Title</A>
8 <B> Previous:</B> <A NAME=tex2html115 HREF=section3_3.html> Read This First </A>
9 <HR> <P>
10 <H1><A NAME=SECTION0004000000000000000> Related Programs</A></H1>
11 <P>
12 The AMPS package (Barton, 1990).  This performs multiple sequence
13 alignments and databank scanning.
14 <P>
15 AMAS (Livingstone and Barton, 1993, CABIOS, 9, 745-756).  Analysis of
16 Multiply Aligned Sequences.  This package uses a sophisticated
17 set-based method to identify patterns of residue conservation in
18 multiple sequence alignments.
19 <P>
20 All programs are available by anonymous ftp from geoff.biop.ox.ac.uk.
21 Please see the README file for details licencing and registration.
22 You can read manuals for the programs and some related papers at
23 http://geoff.biop.ox.ac.uk/.
24 <P>
25 <HR>
26
27 </BODY>
28 <P><ADDRESS>
29 gjb@bioch.ox.ac.uk
30 </ADDRESS>