JPRED-2 Add alscript to the Git repository
[jpred.git] / sources / alscript / doc / alscript / subsection3_16_12.html
1 <HEAD>
2 <TITLE> References</TITLE>
3 </HEAD>
4 <BODY><P>
5  <HR> <A NAME=tex2html512 HREF=section3_17.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/next_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html510 HREF=section3_16.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/up_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html506 HREF=subsection3_16_11.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/previous_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html514 HREF=tableofcontents3_1.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/contents_motif.gif"></A> <BR>
6 <B> Next:</B> <A NAME=tex2html513 HREF=section3_17.html>  About this document </A>
7 <B>Up:</B> <A NAME=tex2html511 HREF=section3_16.html> Appendices</A>
8 <B> Previous:</B> <A NAME=tex2html507 HREF=subsection3_16_11.html> Acknowledgements</A>
9 <HR> <P>
10 <H2><A NAME=SECTION000161200000000000000> References</A></H2>
11 <P>
12 <A NAME=app10><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/invis_anchor.xbm"></A>
13 <P>
14 <PRE><TT>
15
16 1.  Barton, G. J. (1993), 
17         &quot;ALSCRIPT A tool to format multiple sequence alignments&quot;,
18         Protein Engineering,  Volume 6, No. 1, pp.37-40.
19
20 2.  Barton, G. J. (1990),
21         &quot;Protein Multiple Sequence Alignment and Flexible Pattern Matching&quot;,
22         Methods in Enzymology,
23         183,403-428.
24
25 3.  Barton, G. J. and Sternberg, M. J. E. (1987),
26         &quot;A Strategy for the Rapid Multiple Alignment of Protein Sequences: 
27          Confidence Levels From Tertiary Structure Comparisons&quot;,
28         Journal of Molecular Biology,
29         198,327-337
30
31 4. Higgins, D. G. and Sharp, P. M. (1989),
32         &quot;Fast and sensitive multiple sequence alignments on a microcomputer&quot;,
33         CABIOS,
34         5,151--153
35
36 5. Devereux, J. Haeberli, P. Smithies, O. (1984),
37         &quot;A comprehensive set of sequence analysis programs for the VAX&quot;,
38         Nucleic Acids Res.
39         12, 387-395
40
41 6. Livingstone, C. D. and Barton, G. J. (1993),
42         &quot;Protein Sequence Alignments:  A Strategy for the Hierarchical analysis
43         of residue conservation&quot;
44         Computer Applications in the Biosciences,
45         9, 745-756.</TT></PRE>
46 <HR>
47
48 </BODY>
49 <P><ADDRESS>
50 gjb@bioch.ox.ac.uk
51 </ADDRESS>