JPRED-2 Add alscript to the Git repository
[jpred.git] / sources / alscript / doc / alscript / subsection3_16_9.html
1 <HEAD>
2 <TITLE> Program Crashes and Known Bugs</TITLE>
3 </HEAD>
4 <BODY><P>
5  <HR> <A NAME=tex2html481 HREF=subsection3_16_10.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/next_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html479 HREF=section3_16.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/up_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html473 HREF=subsection3_16_8.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/previous_motif.gif"></A> <A NAME=tex2html483 HREF=tableofcontents3_1.html><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/contents_motif.gif"></A> <BR>
6 <B> Next:</B> <A NAME=tex2html482 HREF=subsection3_16_10.html> Wish List for </A>
7 <B>Up:</B> <A NAME=tex2html480 HREF=section3_16.html> Appendices</A>
8 <B> Previous:</B> <A NAME=tex2html474 HREF=subsection3_16_8.html> Alternative ways of </A>
9 <HR> <P>
10 <H2><A NAME=SECTION00016900000000000000> Program Crashes and Known Bugs</A></H2>
11 <P>
12 <A NAME=app8><IMG ALIGN=MIDDLE SRC="http://geoff.biop.ox.ac.uk/latex2html/invis_anchor.xbm"></A>
13 <P>
14 We've used ALSCRIPT on Sun Workstations and Silicon Graphics for some
15 time, with very large alignments and command files with thousands of
16 commands.  All seems to work OK, the program has not crashed on us at
17 all!!
18 <P>
19 However, the command interpreter in ALSCRIPT is very simple and
20 the program will crash if you give any command the wrong number of 
21 arguments (e.g. leaving out the shade value in a shade_chars command).
22 <P>
23 If you do make the program crash, have checked all the documentation 
24 and your numbers, and the program still crashes.  Then send me 
25 the command file and block file that causes the crash and I will try
26 to investigate.
27 <P>
28 Suggestions for improvements to the program are always welcome.
29 <P>
30 <HR>
31
32 </BODY>
33 <P><ADDRESS>
34 gjb@bioch.ox.ac.uk
35 </ADDRESS>