sources/alscript/examples/demo/example.blc

   1 A simple example block file.  The important parts are the lines that
   2 start with the greater than character - these are identifer lines for the
   3 sequences.  The first star is above the position of the first sequence
   4 in the alingmnet which is written VERTICALLY down the page.  The second
   5 star shows the end of the alignment.
   6
   7 Anything else can be written here, except greater than signs and stars.
   8
   9 This is the format produced by the AMPS package for multiple
  10 sequence alignment.
  11
  12
  13 >one
  14 >two
  15 >three
  16 >four
  17 >five
  18 *
  19 ABCDE
  20 EDFTD
  21 AAAAA
  22 LLL
  23 PPPPP
  24 GGGGG
  25 SSSSS
  26 KLMNT
  27 TTLPQ
  28 SLNST
  29 TTLSN
  30 LQPPL
  31 LLLLL
  32 TTTTT
  33 *