server/compbio/controllers/JobController.java

   1 package compbio.controllers;
   2
   3 import java.io.IOException;
   4 import java.text.SimpleDateFormat;
   5 import java.util.Calendar;
   6 import java.util.Date;
   7 import java.util.List;
   8 import java.util.Map;
   9
  10 import org.apache.log4j.Logger;
  11 import org.springframework.stereotype.Controller;
  12 import org.springframework.web.bind.annotation.RequestMapping;
  13 import org.springframework.web.bind.annotation.RequestMethod;
  14 import org.springframework.web.bind.annotation.RequestParam;
  15
  16 import compbio.statistic.CassandraRequester;
  17 import compbio.cassandra.DataBase;
  18 import compbio.engine.archive.ArchivedJob;
  19
  20 /**
  21  * @author Alexander Sherstnev
  22  * @author Natasha Sherstneva
  23  * @version 1.0 Dec 2013
  24  */
  25 @Controller
  26 public class JobController extends BasicController {
  27         private static Logger log = Logger.getLogger(JobController.class);
  28
  29         /**
  30          * form a query page for job execution time statistics. The servlet should
  31          * be available for users and admins only. By defaults the report time range
  32          * is from the earliest day with jobs to today ("Query for all dates" is
  33          * ticked). If the user removes the tick the time range is from today - 3
  34          * days to today. Currently, the input model is empty.
  35          *
  36          * @param model
  37          *            MVC model
  38          * @return link to the JSP query page
  39          */
  40         @RequestMapping(value = "/stat/exectime/query", method = RequestMethod.GET)
  41         public String initFormExecTime(Map<String, Object> model) {
  42                 model.put("username", getPrincipalName());
  43                 Calendar cal = Calendar.getInstance();
  44                 String date2 = cal.get(Calendar.YEAR) + "/" + (cal.get(Calendar.MONTH) + 1) + "/" + cal.get(Calendar.DATE);
  45                 cal.add(Calendar.DATE, -3);
  46                 String date1 = cal.get(Calendar.YEAR) + "/" + (cal.get(Calendar.MONTH) + 1) + "/" + cal.get(Calendar.DATE);
  47
  48                 model.put("date1", date1);
  49                 model.put("date2", date2);
  50                 return "query/JobTimeExecution";
  51         }
  52
  53         /**
  54          * form a query page for a job. The servlet should no be visible to users at
  55          * all.
  56          *
  57          * @param model
  58          *            MVC model
  59          * @return link to the JSP query page
  60          */
  61         @RequestMapping(value = "/job/query", method = RequestMethod.GET)
  62         public String initFindForm(Map<String, Object> model) {
  63                 model.put("username", getPrincipalName());
  64                 CassandraRequester cr = new CassandraRequester();
  65                 model.put("value", cr.getExample("jobid"));
  66                 return "query/JobLog";
  67         }
  68
  69         /**
  70          * form a report page for a job execution time statistics.
  71          *
  72          * @param model
  73          *            MVC model
  74          * @return link to the JSP query page
  75          */
  76         @RequestMapping(value = "/stat/exectime/results", method = RequestMethod.GET)
  77         public String findExecTimeData(@RequestParam("date1") String date1, @RequestParam("date2") String date2,
  78                         @RequestParam(value = "option", required = false) String option, Map<String, Object> model) {
  79                 model.put("username", getPrincipalName());
  80                 final long startTime = System.currentTimeMillis();
  81
  82                 CassandraRequester sp = new CassandraRequester();
  83                 if (option.equals("AllDates,off")) {
  84                         Calendar cal = Calendar.getInstance();
  85                         date1 = DateFormatYYMMDD(sp.earliestDate());
  86                         date2 = cal.get(Calendar.YEAR) + "/" + (cal.get(Calendar.MONTH) + 1) + "/" + cal.get(Calendar.DAY_OF_MONTH);
  87                 }
  88                 model.put("date1", date1);
  89                 model.put("date2", date2);
  90                 model.put("option", option);
  91                 List<DataBase> res = sp.extractExecutionTime(date1, date2);
  92                 model.put("result", res);
  93                 String csvline = "";
  94                 if (0 < res.size()) {
  95                         csvline = "\'Date\',\'Total\',\'0-30 sec\',\'30-60 sec\',\'1-2 min\',\'2-10 min\',\'more 10 min\'%0A";
  96                         for (DataBase entry : res) {
  97                                 List<Integer> counts = entry.getTimeRez();
  98                                 int total = 0;
  99                                 for (int i = 0; i < counts.size(); ++i) {
 100                                         total += counts.get(i);
 101                                 }
 102                                 csvline += "\'" + entry.getDate() + "\',\'" + total;
 103                                 for (int i = 0; i < counts.size(); ++i) {
 104                                         csvline += "\',\'" + counts.get(i);
 105                                 }
 106                                 csvline += "\'%0A";
 107                         }
 108                 }
 109                 model.put("csvfile", csvline);
 110                 model.put("ndays", res.size() - 1);
 111                 final long endTime = System.currentTimeMillis();
 112                 model.put("timeExecution", (endTime - startTime));
 113                 return "/reportTimeExecution";
 114         }
 115
 116         /**
 117          * form a query page for a job. The servlet should no be visible to users at
 118          * all.
 119          *
 120          * @param model
 121          *            MVC model
 122          * @return link to the JSP query page
 123          */
 124         @RequestMapping(value = "/job/results", method = RequestMethod.GET)
 125         public String findJob(@RequestParam("IdJob") String jobid, Map<String, Object> model) {
 126                 model.put("username", getPrincipalName());
 127                 final long startTime = System.currentTimeMillis();
 128                 CassandraRequester cr = new CassandraRequester();
 129                 model.put("result", cr.readJobLog(jobid));
 130                 final long endTime = System.currentTimeMillis();
 131                 model.put("timeExecution", (endTime - startTime));
 132                 model.put("IdJob", jobid);
 133
 134                 ArchivedJob aj = new ArchivedJob(jobid);
 135                 try {
 136                         model.put("jobarchive", aj.prepareJobArchiveToWeb());
 137                 } catch (IOException e) {
 138                         log.error("JobController.prepareJobArchiveToWeb: IO exception with job archive file");
 139                         log.error(e.getLocalizedMessage(), e.getCause());
 140                 }
 141                 return "reportJobLog";
 142         }
 143
 144         /**
 145          * convert date from the standard long representation (milliseconds from 1
 146          * Jan 1970) to yyyy/mm/dd
 147          *
 148          * @param indate
 149          *            date in milliseconds from 1 Jan 1970
 150          * @return date in the form of yyyy/mm/dd
 151          */
 152         private String DateFormatYYMMDD(long indate) {
 153                 SimpleDateFormat datformat = new SimpleDateFormat("yyyy/MM/dd");
 154                 String dateString = datformat.format(new Date(indate));
 155                 return dateString;
 156         }
 157
 158 }