server/compbio/controllers/JobController.java

   1 package compbio.controllers;
   2
   3 import java.io.IOException;
   4 import java.text.SimpleDateFormat;
   5 import java.util.Calendar;
   6 import java.util.Date;
   7 import java.util.List;
   8 import java.util.Map;
   9
  10 import org.apache.log4j.Logger;
  11 import org.springframework.stereotype.Controller;
  12 import org.springframework.web.bind.annotation.RequestMapping;
  13 import org.springframework.web.bind.annotation.RequestMethod;
  14 import org.springframework.web.bind.annotation.RequestParam;
  15
  16 import compbio.statistic.CassandraRequester;
  17 import compbio.cassandra.CassandraNativeConnector;
  18 import compbio.cassandra.DataBase;
  19 import compbio.engine.archive.ArchivedJob;
  20
  21 /**
  22  * @author Alexander Sherstnev
  23  * @author Natasha Sherstneva
  24  * @version 1.0 Dec 2013
  25  */
  26 @Controller
  27 public class JobController extends BasicController {
  28         private static Logger log = Logger.getLogger(JobController.class);
  29
  30         /**
  31          * form a query page for job execution time statistics. The servlet should
  32          * be available for users and admins only. By defaults the report time range
  33          * is from the earliest day with jobs to today ("Query for all dates" is
  34          * ticked). If the user removes the tick the time range is from today - 3
  35          * days to today. Currently, the input model is empty.
  36          *
  37          * @param model
  38          *            MVC model
  39          * @return link to the JSP query page
  40          */
  41         @RequestMapping(value = "/stat/exectime/query", method = RequestMethod.GET)
  42         public String initFormExecTime(Map<String, Object> model) {
  43                 model.put("username", getPrincipalName());
  44                 Calendar cal = Calendar.getInstance();
  45                 String date2 = cal.get(Calendar.YEAR) + "/" + (cal.get(Calendar.MONTH) + 1) + "/" + cal.get(Calendar.DATE);
  46                 cal.add(Calendar.DATE, -3);
  47                 String date1 = cal.get(Calendar.YEAR) + "/" + (cal.get(Calendar.MONTH) + 1) + "/" + cal.get(Calendar.DATE);
  48
  49                 model.put("date1", date1);
  50                 model.put("date2", date2);
  51                 return "query/JobTimeExecution";
  52         }
  53
  54         /**
  55          * form a query page for a job. The servlet should no be visible to users at
  56          * all.
  57          *
  58          * @param model
  59          *            MVC model
  60          * @return link to the JSP query page
  61          */
  62         @RequestMapping(value = "/job/query", method = RequestMethod.GET)
  63         public String initFindForm(Map<String, Object> model) {
  64                 model.put("username", getPrincipalName());
  65                 CassandraRequester cr = new CassandraRequester();
  66                 model.put("value", cr.getExample("jobid"));
  67                 return "query/JobLog";
  68         }
  69
  70         /**
  71          * form a report page for a job execution time statistics.
  72          *
  73          * @param model
  74          *            MVC model
  75          * @return link to the JSP query page
  76          */
  77         @RequestMapping(value = "/stat/exectime/results", method = RequestMethod.GET)
  78         public String findExecTimeData(@RequestParam("date1") String date1, @RequestParam("date2") String date2,
  79                         @RequestParam(value = "option", required = false) String option, Map<String, Object> model) {
  80                 model.put("username", getPrincipalName());
  81                 final long startTime = System.currentTimeMillis();
  82
  83                 CassandraRequester sp = new CassandraRequester();
  84                 if (option.equals("AllDates,off")) {
  85                         Calendar cal = Calendar.getInstance();
  86                         date1 = DateFormatYYMMDD(sp.earliestDate());
  87                         date2 = cal.get(Calendar.YEAR) + "/" + (cal.get(Calendar.MONTH) + 1) + "/" + cal.get(Calendar.DAY_OF_MONTH);
  88                 }
  89                 model.put("date1", date1);
  90                 model.put("date2", date2);
  91                 model.put("option", option);
  92                 List<DataBase> res = sp.extractExecutionTime(date1, date2);
  93                 model.put("result", res);
  94                 model.put("ndays", res.size() - 1);
  95                 final long endTime = System.currentTimeMillis();
  96                 model.put("timeExecution", (endTime - startTime));
  97                 return "/reportTimeExecution";
  98         }
  99
 100         /**
 101          * form a query page for a job. The servlet should no be visible to users at
 102          * all.
 103          *
 104          * @param model
 105          *            MVC model
 106          * @return link to the JSP query page
 107          */
 108         @RequestMapping(value = "/job/results", method = RequestMethod.GET)
 109         public String findJob(@RequestParam("IdJob") String jobid, Map<String, Object> model) {
 110                 model.put("username", getPrincipalName());
 111                 final long startTime = System.currentTimeMillis();
 112                 CassandraRequester cr = new CassandraRequester();
 113                 model.put("result", cr.readJobLog(jobid));
 114                 final long endTime = System.currentTimeMillis();
 115                 model.put("timeExecution", (endTime - startTime));
 116                 model.put("IdJob", jobid);
 117
 118                 ArchivedJob aj = new ArchivedJob(jobid);
 119                 try {
 120                         model.put("jobarchive", aj.prepareJobArchiveToWeb());
 121                 } catch (IOException e) {
 122                         log.error("JobController.prepareJobArchiveToWeb: IO exception with job archive file");
 123                         log.error(e.getLocalizedMessage(), e.getCause());
 124                 }
 125                 return "reportJobLog";
 126         }
 127
 128         /**
 129          * convert date from the standard long representation (milliseconds from 1
 130          * Jan 1970) to yyyy/mm/dd
 131          *
 132          * @param indate
 133          *            date in milliseconds from 1 Jan 1970
 134          * @return date
 135          *            in the form of yyyy/mm/dd
 136          */
 137         private String DateFormatYYMMDD(long indate) {
 138                 SimpleDateFormat datformat = new SimpleDateFormat("yyyy/MM/dd");
 139                 String dateString = datformat.format(new Date(indate));
 140                 return dateString;
 141         }
 142
 143 }