src2/fr/orsay/lri/varna/exceptions/MappingException.java

   1 /*
   2  VARNA is a tool for the automated drawing, visualization and annotation of the secondary structure of RNA, designed as a companion software for web servers and databases.
   3  Copyright (C) 2008  Kevin Darty, Alain Denise and Yann Ponty.
   4  electronic mail : Yann.Ponty@lri.fr
   5  paper mail : LRI, bat 490 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex France
   6
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  10
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  13  See the GNU General Public License for more details.
  14
  15  You should have received a copy of the GNU General Public License along with VARNA version 3.1.
  16  If not, see http://www.gnu.org/licenses.
  17  */
  18 package fr.orsay.lri.varna.exceptions;
  19
  20 public class MappingException extends Exception {
  21         private static final long serialVersionUID = 1L;
  22
  23         public static final int MULTIPLE_PARTNERS_DEFINITION_ATTEMPT = 1;
  24         public static final int BAD_ALIGNMENT_INPUT = 2;
  25         public static final int CUSTOM_MESSAGE = 3;
  26
  27         private String _errorMessage;
  28         private int _type;
  29
  30         public MappingException(String errorMessage) {
  31                 _errorMessage = errorMessage;
  32                 _type = CUSTOM_MESSAGE;
  33         }
  34
  35         public MappingException(int type) {
  36                 _type = type;
  37         }
  38
  39         public String getMessage() {
  40                 switch (_type) {
  41                 case MULTIPLE_PARTNERS_DEFINITION_ATTEMPT:
  42                         return "Mapping error: Attempt to define multiple partners for a base-pair";
  43                 case BAD_ALIGNMENT_INPUT:
  44                         return "Mapping error: Bad input alignment";
  45
  46                 case CUSTOM_MESSAGE:
  47                         return _errorMessage;
  48                 default:
  49                         return "Mapping error: Type is unknown.";
  50                 }
  51         }
  52
  53 }