src2/fr/orsay/lri/varna/interfaces/InterfaceVARNARNAListener.java

   1 package fr.orsay.lri.varna.interfaces;
   2
   3 import java.awt.geom.Point2D;
   4 import java.util.ArrayList;
   5 import java.util.Hashtable;
   6 import java.util.Set;
   7
   8 import fr.orsay.lri.varna.models.rna.ModeleBP;
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  10 public interface InterfaceVARNARNAListener {
  11         /**
  12          * Reacts to changes being made at the sequence level.
  13          * @param index The sequence index where a change of base content is observed
  14          * @param oldseq Previous base content
  15          * @param newseq New base content
  16          */
  17         public void onSequenceModified(int index, String oldseq, String newseq);
  18
  19         /**
  20          * Reacts to modification of the structure (Base-pair addition/removal).
  21          * @param current Current list of base-pairs (can be also accessed within the current RNA object).
  22          * @param addedBasePairs Newly created base-pairs
  23          * @param removedBasePairs Newly removed base-pairs
  24          */
  25         public void onStructureModified(Set<ModeleBP> current, Set<ModeleBP> addedBasePairs, Set<ModeleBP> removedBasePairs);
  26
  27         /**
  28          * Reacts to displacement of
  29          * @param previousPositions
  30          */
  31         public void onRNALayoutChanged(Hashtable<Integer,Point2D.Double> previousPositions);
  32 }