JAL-2629 update spike branch to latest
[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
index 4ca6e93..0abd2a7 100755 (executable)
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
- * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
 <title>What's new ?</title>
 </head>
 <body>
-       <p>
-               <strong>What's new ?</strong>
-       </p>
-       <p>
-               Jalview 2.8.2 is the first release produced by our new core
-               development team.<br /> It incorporates many minor improvements and
-               bug-fixes, and new features for working with 3D structure data,
-               shading alignments by secondary structure and generation of alignment
-               figures as Scalable Vector Graphics.
-               <br />As ever, the highlights are detailed below, and the full list is
-               given in the
-               <a href="releases.html#Jalview2.8.2">Jalview 2.8.2 Release Notes</a>.
-       </p>
+  <p>
+    <strong>What's new in Jalview 2.10.4 ?</strong>
+  </p>
+  <p>
+    This is the May 2018 release of Jalview, and the last in the 2.10.x series. Jalview 2.10.4 includes:
+  </p>
+  <ul>
+    <li>Numerous efficiency improvements in the renderer and overview when working with large alignments with lots of hidden columns</li>
+    <li>Use of HTTPS when connecting to Uniprot, Ensembl and other EBI web services</li>
+    <li>Critical patches for running Jalview on OSX with Java 10</li>
+    <li>Easier adjustment of the Alignment ID panel and Annotation panel</li>
+    <li>Improved support for mapping between 3D Structures and Uniprot Protein Sequences</li>
+    <li>Improved support for discovering CDS and transcripts for Proteins and Ensembl gene IDs</li>
+    <li>New buttons on the Structure Chooser for adding structures
+      to an existing view, and disabling automatic superposition
+      according to linked alignments</li>
+    <li>Annotation transfer between Chimera and Jalview <em>(formerly only
+        available in 'Experimental' mode)</em></li>
+  </ul>
+  <p>
+    The full list of bugs fixed in this release can be found in the <a href="releases.html#Jalview.2.10.4">2.10.4
+      Release Notes</a>. 
+  </p>
 </body>
 </html>