JAL-1517 update copyright to version 2.8.2
[jalview.git] / src / jalview / io / JPredFile.java
index 509758b..0a1c408 100755 (executable)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
- * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -14,6 +14,7 @@
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  */
 /**
  * PredFile.java
@@ -25,15 +26,6 @@ package jalview.io;
 import java.io.*;
 import java.util.*;
 
-import javax.xml.parsers.ParserConfigurationException;
-
-import org.xml.sax.SAXException;
-
-import fr.orsay.lri.varna.exceptions.ExceptionFileFormatOrSyntax;
-import fr.orsay.lri.varna.exceptions.ExceptionLoadingFailed;
-import fr.orsay.lri.varna.exceptions.ExceptionPermissionDenied;
-import fr.orsay.lri.varna.exceptions.ExceptionUnmatchedClosingParentheses;
-
 import jalview.datamodel.*;
 
 /**
@@ -75,20 +67,13 @@ public class JPredFile extends AlignFile
    * 
    * @throws IOException
    *           DOCUMENT ME!
- * @throws SAXException 
- * @throws ParserConfigurationException 
- * @throws ExceptionFileFormatOrSyntax 
- * @throws ExceptionLoadingFailed 
- * @throws ExceptionPermissionDenied 
- * @throws InterruptedException 
- * @throws ExceptionUnmatchedClosingParentheses 
    */
-  public JPredFile(String inFile, String type) throws IOException, ExceptionFileFormatOrSyntax, ParserConfigurationException, SAXException, ExceptionPermissionDenied, ExceptionLoadingFailed, InterruptedException, ExceptionUnmatchedClosingParentheses
+  public JPredFile(String inFile, String type) throws IOException
   {
     super(inFile, type);
   }
 
-  public JPredFile(FileParse source) throws IOException, ExceptionFileFormatOrSyntax, ParserConfigurationException, SAXException, ExceptionPermissionDenied, ExceptionLoadingFailed, InterruptedException, ExceptionUnmatchedClosingParentheses
+  public JPredFile(FileParse source) throws IOException
   {
     super(source);
   }
@@ -363,15 +348,8 @@ public class JPredFile extends AlignFile
    * 
    * @param args
    *          DOCUMENT ME!
- * @throws SAXException 
- * @throws ParserConfigurationException 
- * @throws ExceptionFileFormatOrSyntax 
- * @throws ExceptionLoadingFailed 
- * @throws ExceptionPermissionDenied 
- * @throws InterruptedException 
- * @throws ExceptionUnmatchedClosingParentheses 
    */
-  public static void main(String[] args) throws ExceptionFileFormatOrSyntax, ParserConfigurationException, SAXException, ExceptionPermissionDenied, ExceptionLoadingFailed, InterruptedException, ExceptionUnmatchedClosingParentheses
+  public static void main(String[] args) 
   {
     try
     {